「大人，我們派遣部分將士將阿普杜拉哈等押往巴楚等待大軍回合，然後在城內繼續懸掛葉爾羌旗幟，並偽造文書讓堯勒瓦斯火速馳援。大人帶一萬步槍兵和兩萬普通軍士駐防莎車。小的帶人去城南埋伏，只等堯勒瓦斯率軍進入甕城，城內城外一起殺出，殺他個措手不及。務必生擒堯勒瓦斯。」
「這樣一來，不是顯得我大明軍隊殘暴不仁，殺害已經投降的葉爾羌部隊。」
「大人，如果遣散令下達，你能保證堯勒瓦斯乖乖听命嗎？他手里可有八萬蒙古騎兵，就算再路途損失部分也不會少于七萬。如果他們難逃到克什米爾。那我們如何是好？」
「這個……但是要是激起葉爾羌各部落公憤怎麼辦？」
「大人你忘了那些民夫了吧，這是大概也死得差不多了吧。就說堯勒瓦斯拒絕解散武裝，屠殺前往收編的大明兩萬騎兵，大明將士義憤填膺為同胞雪仇而已。」
這個姚啟聖真是夠毒的啊，李承宗想想都有些害怕，年紀輕輕就有如此心計，不過眼下抓住堯勒瓦斯確實很重要，甚至比抓住阿普杜拉哈更重要。
「好吧，就依你之計。不過要盡量減少傷亡，我派幾個猛將跟隨你。生擒堯勒瓦斯就立刻罷兵。」
「是，大人，那麼小的就去布置了。」
夜幕降臨，心急如焚的堯勒瓦斯正在帶領大軍火速趕往莎車城，那里又自己的父汗和葉爾羌大大小小的部落首領。這可惡的大明軍隊一路設伏已經嚴重延遲了他的救援速度，還好經過幾天努力阻攔他的人也殺得差不多了。而剎車成已經在自己眼中了。看起來莎車還是很平靜。
難道大明軍隊還沒有到？萬幸啊，要是父汗等被俘虜，一切都白搭了。
「勇士們，隨我進城再休息，莎車需要我們。」
精疲力盡的幾萬終于見到了莎車城，個個長舒了一口氣。一個個都放心了警惕，準備回城好好休息。
「堯勒瓦斯率大軍回來了，快快開城門！」
城頭裝扮好的士兵連忙點頭，並招呼開城門。
城門開啟，堯勒瓦斯騎馬走在最前面，很快進入甕城。抬頭看看城牆上的將士，揮手致意。城牆上的士兵一看差不多了，關門，發射！
城外埋伏好的姚啟聖帶領步槍騎和騎兵一起沖出「殺啊，活捉堯勒瓦斯！」可憐這些蒙古騎兵們以為回到莎車城了，萬事大吉，幾乎沒有任何防備。
城門一關，堯勒瓦斯和數百騎兵被關在甕城。李承宗連忙招呼城牆上的步槍手， …… 里啪啦一陣騷動之後甕城之內已沒什麼人，城外喊聲殺聲一片。
「堯勒瓦斯投降吧，你父汗等已經投降大明。」
孤家寡人成了甕中之鱉，堯勒瓦斯也沒什麼好說的，束手就擒。李承宗于是站在高牆之上對外大喊「外面的蒙古勇士們听著，大明已經于兩日前攻陷莎車城。阿普杜拉哈等已經臣服大明，如今堯勒瓦斯也已被我大明擒獲。爾等無須頑抗，就地繳械投降，願意報效大明的將即刻收編的，不願意的則放你們回各自部落。」
都城被攻陷，可汗、大將先後被擒，內外夾擊。頑抗已經沒有意義，大部分蒙古兵就地繳械投降，少數乘機逃跑的則被步槍無情射殺。戰爭就這麼快結束了，平定葉爾羌的戰斗到此可以說基本結束了。
莎車城內已經抓獲了六萬俘虜，其中有兩萬人表示願意報效大明，繼續從軍，李承宗安排騎兵將這部分人陸續押解回巴楚，要效力也是遠離葉爾羌的其他前線，在葉爾羌肯定不行了，那天反戈一擊可不是好玩的。李承宗正準備按約釋放剩下的四萬人時，姚啟聖又來了，「李大人，剩下四萬俘虜讓小的來處理吧。」
「你打算如何處理？」
「讓他們為陣亡的大明將士償命。」
「你！」李承宗被姚啟聖的話嚇著了。
「李大人，這四萬人，一旦釋放即刻就可能再拿起武器成為有戰斗力的軍隊，而我們的西征大軍除去民夫不過十五萬。這莎車。巴楚、阿克蘇到處要設防。少一個敵人多一份安逸。」
「不行！我大明一向以仁義治天下，如此坑殺俘虜的行為萬萬不可。」
「那也不能就地釋放，起碼押解到哈密或者長安再做處置。大人，我們還有需要事務要處理呢，那兩萬民夫生死未卜，死了的必須派人掩埋。而看管這些人需要浪費我們很多人力。」
「不用再說了，我決定了。」
「那大人我明日帶人去尋找那些民夫。」
「早去早回，我們的阿克蘇匯合。」
沿著莎車城西行，一路上都是民夫們的尸首，姚啟聖帶兵將他們逐一掩埋，快到英吉沙時總算又遇到有活人，不過大部分身受重傷，粗略統計了下2萬民夫，死了有一萬多，重傷的約五千人，輕傷能自理者不過三、四千。戰馬倒是被這些輕傷者盡可能的保留了下來。
「勇士們，你們辛苦了。我一定奏明皇上為你們請功。不過眼下，最重要的是醫治這些重傷者。」交代完英吉沙的部隊救人收拾殘局外，姚啟聖還有一件更重要的事情要做，那就是那四萬不肯投靠大明的俘虜，在姚啟聖眼里這些人早晚是個禍害，不能讓他們到達巴楚，萬一兵變，說不定又要走了阿普杜拉哈等人。
于是繼續帶人前往莎車和巴楚途中伏擊，很快在葉爾羌河拐向東北的河灣處踫到了押解俘虜的部隊，那些將士為姚啟聖的大明所折服，紛紛前來拜見，一名帶頭的副將走上前來「姚大人這麼急忙來此地所謂何事？」
「還不是為了這些俘虜，李承宗是仁義之人舍不得殺他們。你們也不想想，這些人一旦到了巴楚，見到自己的可汗被押，一旦兵變怎麼辦？你我這些基層將領不替李大人排憂解難，要我們何用。」
姚啟聖這麼一說，幾個將領也覺得很有道理，這投降的一共6萬人，押解的人數不過四萬，而且巴楚城內也沒什麼障礙，就算不反過來打擊明軍，就算劫走阿普杜拉哈在這茫茫沙漠中再到哪里去找他們？
「那姚大人打算如何處置？」
「如此……」姚啟聖把自己的計劃跟幾個頭領一說，幾個人有點猶豫︰「能行嗎？」
「你們盡管配合著干就是了，出了事情我姚啟聖一個人頂著。」這姚啟聖如此仗義，幾個將領便不再猶豫，于是在一個午餐的中午，姚啟聖的兩萬步槍騎和押解俘虜的兩萬騎兵一起行動，將四萬俘虜全部殺掉，連放抗的機會都沒有，尸體迅速填入葉爾羌河。押解部隊繼續前往巴楚集結。姚啟聖則回到莎車城交命。
死了這麼多人，必須有個交代。不管是對阿普杜拉哈還是對李承宗。
「什麼？」李承宗不相信，但從姚啟聖那堅毅的眼神中看不出任何存活的可能。「暴徒，你天生就是個暴徒！」
「李大人，巴楚已經有兩萬降軍，再去四萬，萬一兵變，劫走阿普杜拉哈，我等要去哪里找啊。這些俘虜是中途起義被射殺的，我姚啟聖願意為此負全部責任！」
「負責！？你姚啟聖有幾顆腦袋，這是破壞蒙漢和睦的大事。」
「大人，小的以為你應該即刻下令葉爾羌各部落立刻上繳武裝，一月為期，一月後再發現有私藏武器的一律殺無赦。」
「本督還輪不到你來指揮！」
「恕小的失言，大人你先忙。我去收拾收拾。」