結果事情很快就升級成為肢體沖突，朱國治在人群中，還被打的鼻青臉腫。見狀，蘇州城里的守軍，王進寶立即派出軍隊來鎮壓。朱國治雖然被救了出來，還是不忘讓王進寶，不要傷了這些讀書人。
這樣一來，金聖嘆等人就越發的有恃無恐了。但金聖嘆等人，終究是文人，不可能與軍隊抗衡。但事情也不是如想象中的容易，等復明軍控制好局面後。復明軍就立即發現，已經有十幾個復明軍將士，在剛才的沖突中，失去了性命。
面對這個結果，朱國治和王進寶都傻眼了。面對這樣的情況，兩人都不敢在隱瞞了。王進寶直接給自己的上司，馬寶去了一份軍情。
朱國治見事情鬧大，也只好，將事情原原本本的寫信告訴了朱由棟，等著朱由棟處理方案。馬寶現在正在揚州追殺梁化鳳，一時間也沒有收到王進寶的情報。反而是朱國治的奏疏，先到了朱由棟的手里。
朱由棟雖然沒有接到王進寶的軍情，但是自有軍情司的人員，將情報傳給了朱由棟。所以朱由棟一看了朱國治的奏疏，頓時就火冒三丈。然後讓人回信給朱國治，告訴他，不要以為現在去拍江南士紳的馬匹，就能保住命。不要忘了，能讓他活命的人，只有一個。
朱由棟的回信，一個字都沒有說怎麼處理哭廟的事情，但是朱國治卻瞬間清醒過來。朱由棟既然敢對江南士紳動手，難道還指望這些人來救自己嗎？
這時汪士榮也回到了蘇州，之前汪士榮對士紳還有些好感。但是這才到地方去清欠，也看的明明白白，這些士紳根本就沒有國家概念。甚至連民族大義都沒有，想的只是他們自己家里的幾兩銀子。
何況現在復明軍還被打死了人，這事就更不可能輕易過去了。等他來到朱國治這里的時候，周大柱已經黑著個臉坐在朱國治面前的。朱國治手里拿著朱由棟回的書信，頭上的汗水一顆一顆的掉。
好半天，周大柱才道︰「怎麼樣？朱巡撫想好要怎麼處置這件事了嗎？」朱國治再沒有，之前據理力爭的姿態。有些有氣無力的道︰「我現在是心亂如麻，不知道周將軍有什麼好方法嗎？」
周大柱道︰「其實也簡單，根本不用你去想用什麼方法，殿下不是都已經交代好了嗎？還有什麼好商量的？」朱國治抬頭似乎要說什麼，但想了一下最終還是沒有說。最後嘆了一口氣道︰「既然如此，那就按殿下的意思辦了。」
周大柱冷眼看了朱國治一眼，道︰「你想的好，真的認為你能置身事外嗎？然殿下的意思辦，听你的這個口氣，想要讓殿下來給你擋著？如果你真的這樣想，你最好準備一副棺材。」然後對汪士榮道︰「去，將這次參與哭廟和打傷復明軍將士的人，全部扣押。」
汪士榮自從上次被周大柱教訓一頓後，再也不敢有任何怨言。當即道︰「周將軍，將他們抓起來，然後怎麼處置呢？他們畢竟都是讀書人，而且現在外面群情激動。我們貿然的抓人，怕是會犯了眾怒啊。」
周大柱道︰「怎麼處置？難道你不知道？他們是讀書人，難道就抓不得嗎？」汪士榮道︰「將軍，我們還是謹慎些好。當初錦衣衛就是在蘇州抓了人，結果
鬧出了人命，最後被蘇州的百姓毆打致死。可見眾怒難犯，到時候不好收場啊。」
周大柱冷哼一聲，道︰「我管他們什麼眾怒不眾怒，現在我們沒有殺害普通百姓，他們憑什麼來打我們？再說了，是那些士子去哭廟，然後打死了我們復明軍的將士。知道這是意味著什麼嗎？這簡直就如同謀反，這些士人，只有一個結果，那就是斬首。」
汪士榮一愣，見周大柱一臉堅定，知道全說不了。當即轉身就出去，讓復明軍開始抓人去。這時王進寶也進來，周大柱見了，道︰「王進寶，你立即通知所有駐防的復明軍，對參與哭廟的人，全部逮捕。然後等殿下通知，該殺的殺，該流放的流放。」
王進寶道︰「周將軍，現在不用我們去抓了，他們都已經來了蘇州。由于當時哭廟的事情，他們在蘇州城里鬧起來了。還要鼓動商人不做買賣，讓百姓無糧可買。」周大柱一听，頓時猛然站了起來。然後看向朱國治道︰「朱巡撫，這就是你做的好事，當初猶豫不決，現在事情越發的不可收拾了。難道你現在，真的不願意出面嗎？」
朱國治幾乎要哭了出來，道︰「將軍啊，這事太大了，我們不能做主。還是上報給殿下吧，再鬧下去，形勢就會失控了。」周大柱上前，直接就是一巴掌打在了朱國治的臉上。
然後厲聲道︰「你真是無可救藥了，你看看現在的情況，這已經失控了。你居然還猶豫不解，難道這就是你處理能力嗎？你當時在滿清那里，怎麼就可以不顧任何後果。全心全意的為滿清搜刮自己的同胞，現在卻不願意為大明出一點力。」
朱國治捂著，被周大柱打的發麻的臉。委屈的道︰「周將軍啊，不是我不願意為大明出力。大清只要我出力，不管我怎麼得罪人，也不管有多少人反對我。只要我為朝廷辦了事，就算有人事後用這事來攻擊我。」
說道這里，朱國治有些膽怯的看了周大柱一眼，小聲道︰「只要我有旗人的身份，朝廷就能能保我全身而退。可是我現在為大明出力，只要殿下不保我。那我就是有死路一條了，根本沒有任何生還的希望。你說我該怎麼辦？」
周大柱一愣，道︰「你個慫包，原來你是如此想的？難道你就不相信殿下能保你？而且，你就不怕殿下現在就殺了你啊。」朱國治道︰「我不知道殿下以後會不會殺我，但是我相信殿下現在不會。因為殿下還要讓我來治理江蘇。能為殿下清欠的人，就只有我能做了。」
周大柱知道朱國治說的離不開他是什麼，朱由棟是想找一個人來背清欠的惡名。但是對于朱國治自己說離不開他，卻不同意。當初復明軍在四川，雖然沒有清欠，但是也把四川的那些士紳給全部清除了。
當即冷笑一聲，看向跟著王進寶又進來的汪士榮道︰「你也是這樣想的？怕殿下不能護住你們，所以才不肯江南是士紳決裂的？」汪士榮雖然沒有說，但是表情也看出來，這正是他擔心的事情。
周大柱又看向王進寶，道︰「你怎麼看？」王進寶頓時站了起來，挺直了身體道︰「我沒有想什麼，殿下讓我們做的事，我們就去做。對于其他，沒什麼好考慮的。殿下說過，他保證我們的後事，我們不需要考
慮。」
周大柱欣慰的道︰「好了，你立即召集軍隊，蘇州的捕快也先歸你管轄。凡是敢對抗朝廷的，不管是抗稅不交，哭廟抗政的，一律全部收押。」王進寶頓時答應，然後轉身出去。
汪士榮見周大柱直接跳過他和朱國治，頓時有些慌了。忙道︰「周將軍，那我去做什麼？」周大柱看了汪士榮一眼，道︰「你能做什麼？你會做什麼？」汪士榮一愣，不明白周大柱為什麼突然說出這樣一句話。
于是想汪士榮道︰「周將軍這話就可就辱人了。我汪士榮雖然不敢說是能治國安邦，但是也不至于一無是處吧。」周大柱道︰「是嗎？這里還真有一件事情，不知道汪先生敢不敢去做？」
汪士榮頓時笑道︰「還真沒有我不敢做的事情，周將軍不防說來听听。」周大柱道︰「倪用賓，金聖嘆等人，擅自煽動百姓對抗朝廷政令，齊心可誅。更因為他們哭廟，造成了百姓混亂，導致復明軍將士被打死。如果復明軍不能為將士找回公道，那幾十萬復明軍將士，將回怎麼看待官府？他們的心里又會怎麼想？」
汪士榮有些不解道︰「那周將軍想要怎麼做呢？是將他們革除功名，然後永不錄用嗎？」在汪士榮的理解里，對于讀書人來說，革除功名，永不錄用這就是很嚴厲的事情了。
但是沒想道，周大柱直接道︰「不，這樣的處置太輕了。他們對抗朝廷，這就是造反。既然造反了，就不能讓其活在世上。所以，你要是敢去做，就將他們給斬首示眾。」一旁的朱國治大驚道︰「周將軍，這不可以啊，要是這樣。江南的讀書人，豈不是要徹底與朝廷對立了。」
見汪士榮也要開口說，周大柱打斷道︰「好了，事情就在這里，你要是願意去做，就直接去。不願意，明天你就返回南京去，到時候殿下自然會給你安排另外的事情。」
說完便不再理會兩人，出門的時候，對外面的復明軍將士道︰「看好他們兩人，在沒得到我和殿下的命令，朱國治不準在踏出巡撫衙門半步。汪士榮要是願意去，處決那幾個鬧事的士子，就跟著他一起去。」
周大柱能直接囚禁朱國治和汪士榮，當然不是他自己的決定。朱由棟已經給周大柱傳來的消息，他對朱國治處理這起請願和哭廟十分失望。也發現了朱國治，根本就不敢對江南士紳動手，所以才讓周大柱接手和從嚴處理。
周大柱離開後，汪士榮看著朱國治。想起跟剛才周大柱的話，又看向朱國治的情況，估計朱國治是完了。當初朱由棟能留下朱國治，就是看到他再滿清那里，能夠心狠手辣的對江南士紳清欠。
朱由棟要的也是他這一點，但是朱國治自從投降了復明軍後。清欠的事情，就辦的越來越不得力了，除了最開始的五百萬兩。後面又過了一個月，朱國治的清欠也不見起色。所以朱由棟對朱國治開始失望了，上次來的時候，就已經說過朱國治了。
結果沒有起到作用，反而是朱國治也發的偏向江南的士紳。這才金聖嘆鬧事，先生抗議請願，不能及時處理。後來又鬧出了哭廟，還是沒有及時制止。最終導致了復明軍將士被殺，所以現在周大柱已經將朱國治給囚禁了。