刺刺耳皮丘︰小智的初始神奇寶貝，是由大木博士給的蛋里孵出來的，特性是避雷針，左耳上有三個刺刺，不可以進化，可以學會許多普通皮丘無法學會的技能，小智一直攜帶的神奇寶貝
迷你龍——哈克龍︰野生原野區收服，後來打敗水晶大岩蛇而進化為哈克龍sg
河馬王︰巨大神奇寶貝之島收服，後來通過攜帶王者之證通信進化為河馬王，智慧較高，能舉一反三，學習力較強
伊布——月精靈︰彩虹市游戲廳兌換而來，在化石盔之島沐浴在紅色的月亮之下而進化
伊布——太陽精靈︰彩虹市游戲廳兌換而來，在神奇寶貝豪華游輪打敗火箭隊而進化
蛋——好運蛋——吉利蛋︰彩虹市游戲廳兌換而來的蛋，在奈普魯島小智與小霞確立關系的夜晚孵化為好運蛋，是幸福的見證，在大神奇寶貝之島攜帶圓石打敗火箭隊進化為吉利蛋
大嘴雀︰真新鎮外的森林收服，是烈雀群的老大，剛剛進化而來
超夢︰自己歸來，願意跟隨小智，一直呆在小智身邊
走路草——臭臭花——美麗花︰是在內木博士那里收服而來，後對大鯉魚王使用了睡眠粉後進化為臭臭花，在柚子島用太陽石進化為美麗花，因為水土原因，顏色鮮艷異常
乘龍︰因暴風雨而走失的乘龍，後來小智舍身救它，從而跟隨小智
水晶大岩蛇︰椪柑島的水晶洞窟中收服，因為長期的變異，地面屬性轉換為了水屬性，不過由于本身是水晶的緣故而非常的怕火，是一個另類的存在
哥達鴨︰哈撒島收服，本身非常的喜歡漂亮的女生
大鯉魚王——大暴鯉龍︰擱淺的大鯉魚王，小智因此收服，後來在小智的指揮下打敗了火箭隊而進化，是喬伊小姐從小的玩伴
白酣︰小智在幫喬伊小姐忙的時候，在水中收服的
卡比獸︰果實七島中收服，是大胃王
螳螂︰馬克特島收服的螳螂群的新的老大，臉頰上有十字形疤痕，實力強勁，不服輸
三合一磁怪︰小橘子島的大平原收服，原先是佛得先生的神奇寶貝，不過小智救了它，而且它喜歡小智，小智向佛得先生討要了過來，它的磁鐵不是筆直的，邊緣向外彎曲
大比比鳥——大比雕︰在大神奇寶貝之島收服，後來在大木博士研究所打敗小茂的伊布而進化
大鐵甲暴龍——大超鐵暴龍︰在大神奇寶貝之島收服，後攜帶保護甲通訊進化而來
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