「水師無法上陸，所以，接下來就靠我們自己了。」于通環視左右，見與會者大多表情緊張，便輕描淡寫介紹道。「本官早年曾經參與過陡門江商棧保衛戰，在萬余建虜的圍攻下守過博和哩商棧，還在山東堅守過威海、打退了漢奸耿仲明等多次進攻，對守城是有充分經驗的，不是本官自夸，區區萬余不到的紅毛夷，在本官眼里根本不算什麼事，大家伙且都放寬了心，這仗大明不會輸的。」
于通說這話還真不是自吹自擂，他可是發現了荷蘭陸師火力不足的弱點——荷軍的運輸船逃的太快了，以至于部分搭載的攻城炮、野戰炮都沒來得及卸下來——既然對手沒有敲門槌，那還有什麼可擔心的呢？
見主官似乎成竹在胸，在場的眾人頓時心安了不少，臉色也放緩了下來︰「有都帥這樣的干城在，倒是我等之幸事，還請都帥布置守御，我等一定全力追隨都帥••••••」
巴達維亞城系由城堡、市政府-市政府廣場以及荷蘭居民區、倉庫區、商業區、中國居民區、爪哇居民區等組成，但官府在城堡之外的這種城市布局顯然不符合中國人的傳統，所以，在明軍攻佔巴達維亞的2年多時間里，橫海都司對椰城進行了一定程度的改擴建，最終在市政府-市政府廣場外圍豎起來了城牆，並使之與舊巴達維亞城堡相連，從而形成了新的椰城城區，至于原本的荷蘭居民區、中國居民區等椰城城區則以中國古典城市的城關出現（即巴達維亞東關、巴達維亞南關、巴達維亞西關）。
說起來，城關當然也有城牆和城門拱衛，不過相比以羅城-子城方式重建的椰城城塞，城外東南西三關及三面圍牆這邊的防護程度就薄弱了許多，平日里也就一些捕快和稅吏把守關門，巡查走私而已；等到荷軍陸師開抵椰城後，鑒于明軍的守城兵力有限，于通便直接放棄了守備城外三關的想法，從而把手上僅有的兵馬都聚攏在椰城城內。
但即便如此，于通手中的4000人也不足以面面俱到，所以，在荷軍陸師從容易遭到明軍艦船炮擊的北-東-西三面轉移到椰城南關方向後，于通便根據自己多年守備城市及要塞經驗，重新規劃了椰城的防御。
根據于通最新的守備計劃，明軍僅在城北毗鄰碼頭區的方向布設了300士兵作為警戒；而在東西兩面城牆，于通各布置了600士兵執行警戒任務；剩余2500人中，1800人布置在了城內，700人作為總預備隊，隨時增援有需要的方向。
1700人守備1500米長的城牆，只能說是中規中矩，不過這1800人顯然也不可能一下子全部布置在了城牆上，正常情況下會分為三班日夜巡守，只有敵軍發起猛攻並且給南城造成沉重壓力時，三班才會齊齊上陣。
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