鈴木一郎說，今年被黃蜂叮的受害人特別多，同樣的事情已經發生很多次了，但是並沒有鬧出人命。小五郎忽然大叫，「我知道凶手是誰了！」千鈞和柯南都吃驚地看著大叔，「真的假的？」毛利叫道，「這個殺人凶手絕對就是這里的黃蜂！」千鈞和柯南差點摔倒，「叔叔真是太有才了！」「還以為他小宇宙爆發了呢！」毛利見大家吃驚，很是得意，「你們听著，我想山崎社長一定是被那些從煙囪里飛進來的黃蜂攻擊致死的。」
毛利推理，雖然山崎順手抓了身邊的殺蟲劑對黃蜂噴灑，不過因為過度害怕還是撞破了窗戶逃到了陽台上。但是，不幸的是，陽台的扶手因為年久失修，就這樣順勢跌了下去。「所以，社長的死可以說是件意外。」千鈞覺得大叔的推理還蠻靠譜的，大致的過程應該不會錯。柯南提出疑問，「可是山崎社長為什麼不從入口這里逃出去？反而要從窗戶逃出去呢？」小五郎道，「人在慌亂的時候，就沒有辦法在短時間內做出正確的判斷了。」千鈞贊成，「尤其是女性，常常會做出些離譜的行動，這不奇怪。」
柯南卻在入口房門的把手上發現了粘粘的東西，千鈞低聲道，「是蜂蜜。」柯南添了添，果然是蜂蜜。柯南跑到陽台觀察扶手斷裂之處，千鈞有些疑惑，「我看過了，沒有什麼問題啊。」柯南指給千鈞看，「下面的斷裂處的確是腐朽的，但是兩側扶手的木頭中間卻不是。正常的話，扶手不會斷裂的，而且這些腐爛也像是人為的。」千鈞一愣，「你的意思是說……」柯南點頭，「也許這一次根本不是意外。這很有可能是某個人設計的殺人陰謀。」
柯南很快在別墅倉庫找到了取蜂蜜時用的那種防護衣，千鈞也發現兩瓶藥品用過，分別是硫酸和乙醚，地上還有3瓶液態氮氣桶。千鈞奇怪，「怎麼會有這種東西？」柯南一下子明白了，「等一下……」二人來到別墅外面，柯南想起飄走的氣球，那邊是下游的方向，就讓千鈞快點去找。千鈞只好快速奔去下游尋找，費了一番功夫，在下游的一棵大樹上找到了氣球，氣球被掛在樹枝中間了。氣球下面有一條釣線和破掉的塑料袋。氣球上面還有些黑色的污跡，不知道是什麼。
千鈞將氣球帶回了，給柯南看。柯南立即讓千鈞找來梯子，二人爬到別墅屋頂，到暖爐煙囪那里觀察。煙囪上面本來應該有的雨水痕跡都被磨掉了。千鈞用手電向煙囪里照射，柯南發現里面沾附的煤灰好像也有被磨掉的痕跡。二人又回到別墅里面，柯南爬到暖爐下面檢查，找到一塊殘留的膠帶，並且在地板上發現了一個細微的洞。柯南大喜，「我知道凶手的手法了。」千鈞笑道，「我也猜到凶手是誰了。」柯南笑道，「唔，你說說看。」千鈞道，「準備了這麼多亂七八糟的東西，外人是辦不到的，只有一個人可以……」柯南點頭，「這人一定是凶手。」
小蘭的聲音傳來，「柯南，你在哪里？」毛利也嚷嚷，「千鈞又帶著那個小鬼跑到哪里了？」千鈞帶著柯南走過來，柯南問道，「干嘛？」小蘭生氣，「你不要突然跑掉嘛，害我擔心死了。」千鈞笑道，「這個小鬼比較好奇，我帶他在別墅四處轉轉。」小五郎哼了一聲，「柯南，你不要到處亂跑了。你們一起來吧，我們要告辭了。」千鈞急忙拉住大叔，「別急，大叔，先等一下啦。」毛利生氣，「又怎麼了？」柯南故技重施，射出麻醉針。
沉睡的小五郎出現，千鈞將其扶到鋼琴旁邊的椅子上坐好。千鈞大聲喊叫，讓大家都過來一趟。小蘭有些疑惑，其他人听到動靜，也都進來了。毛利開口，宣布這次的事件是謀殺案件。大家很吃驚，相原信吾問道，「不是意外嗎？」缽八兵衛也疑惑，「你怎麼現在才說這種話？」毛利道，「我這麼做是為了讓凶手疏于防範，因為我必須爭取時間才能掌握證據。這個凶手故意制造意外的表面現象，卻暗地里將山崎社長給殺害了。」
鈴木一郎問道，「毛利先生，你有什麼證據嗎？」毛利讓大家看入口的房門門把，千鈞指給大家看。中村江里問道，「千水先生，這門把有什麼不對勁嗎？我看沒有什麼不同啊。」千鈞指著門把接縫下端的地方，「你看這里。」中村秘書走過來，用手指模了一下，「這是……」千鈞點頭，「嗯，沒錯，是蜂蜜。」毛利道，「如果說房子里遭到黃蜂的攻擊，一般來說應該由入口的這道門逃生才對，但是這門把上涂了蜂蜜自然會沾上更多的黃蜂。因此山崎社長就沒辦法打開入口這道門，而向反方向的落地窗逃生了。」
小五郎繼續推理，陽台的木頭扶手早就腐爛的不像樣子，因為凶手早就淋上硫酸讓其腐爛了，但兩側還留下了生木的痕跡。鈴木警官問道，「不過，最關鍵的黃蜂怎麼說？」毛利解釋，那些黃蜂也是凶手刻意設計好的。千鈞請大家看後方的天花板，那里吊著一個氣球。小蘭一下子想起來，「難道這個氣球是……」毛利肯定，「沒錯，就是我們往下面河邊跑的時候，被柯南和小蘭看到的氣球。」千鈞道，「這個氣球卡在這條河流下游的一棵樹枝上，我按照毛利叔叔的吩咐，將其拿了回來。」
千鈞將氣球拿過來，將下面綁著的塑料袋打開。小蘭等人看見里面竟然有黃蜂。毛利推理，凶手先將大量的黃蜂放進這個塑料袋以後，就把它放到煙囪里面。小五郎推測，凶手應該是先在蜂巢上噴了乙醚，讓黃蜂睡著後才摘下來的。「相原先生，倉庫里有一件用來采蜂蜜用的防護衣，上面就有乙醚的氣味。」相原急忙辯解，「那種防護衣這一帶每家養蜂的人家至少都會有一件。」毛利問，「那麼倉庫里平放著的液態氮氣又是怎麼回事？」
相原道，「那是我們在夏天慶典的時候，給小孩子充氣球用的，當時沒有用完。」小五郎質疑，「是這樣嗎？那里有3個氮氣桶，我看是你想試驗看看是不是能用氣球讓塑料袋升空，一遍遍地演練好做最完善的準備，對吧？」相原死不承認，「你這話什麼意思？你到底想說些什麼？」毛利偵探毫不客氣指出，「唯一能做出這種設計的人只有住在這里的管理員，所以說，相原信吾，凶手就是你！」
其他人都吃驚地看著相原，相原頭上冒汗，「你胡說些什麼？剛才山崎社長滾下河谷的時候，我明明就是在客廳里面，當時我還跟大家在一起，怎麼可能殺人呢？」毛利偵探開始詳細推理，相原開始的時候為了讓氣球暫時留在煙囪里面，就在氣球上綁了釣線。通過暖爐前面的地板上的一個小洞，連接到下面的廚房。然後將釣線綁在廚房的釘子上面。至于粘在塑料袋上的膠帶也粘著一條釣線，一樣讓釣線連接到廚房里面。這麼一來相原的設計就完成了。
毛利繼續推理，這個時候，突然來了電話，山崎社長就去二樓的社長室接听電話。同時，相原也在廚房里打電話，其實這個電話是打到山崎社長室里面的，好讓山崎依照計劃去房間里接電話。在確定山崎社長接到電話後，相原立刻將粘在塑料袋上的釣線拉了一下。于是粘在塑料袋上的那個釣線，就把塑料袋上的膠帶扯開了。黃蜂就趁機飛了出來，但是煙囪口被氣球給堵住了，黃蜂自然都飛到屋子里面。這個時候因受到驚嚇，黃蜂就開始向山崎社長攻擊。
山崎社長一面拿著殺蟲劑噴灑，一面向大門方向逃跑。可是沒有想到她根本沒辦法打開房門，因為門把上面沾滿了更多的黃蜂。在沒有辦法的情況下，山崎社長只好撞破落地窗逃向外面的陽台，沒想到這時候陽台的扶手早就被硫酸腐蝕了，就這樣山崎跌到了谷底。事發後，大家沖出去的時候，相原立刻回到廚房里，把另一根釣線拉掉。這麼一來那個氣球就順利地從煙囪飛到了空中，這一幕剛好被小蘭和柯南看見。應該說人算不如天算，這個氣球按照相原的計劃本該飛到很遠的地方，卻因為突然下起了一場小雨，不巧被卡在樹枝上了。
在千鈞的指點下，鈴木一郎在暖爐下面找到了那張膠帶，也發現了地板上的小洞。千鈞嘲諷相原，「你用來殺人的工具太多了，手法太繁瑣，所以很容易留下痕跡。」相原垂死掙扎，「那些東西怎麼能當證據呢？」毛利偵探問道，「你擺在腰間毛巾可以讓我們看看嗎？」相原怒道，「這條毛巾又哪里不對了？」小五郎道，「這個門把上原本涂滿蜂蜜的，我在想是你用那條毛巾把蜂蜜給擦掉了吧。」千鈞順手取下了相原的毛巾，遞給缽八兵衛。缽確定這條毛巾上沾滿了蜂蜜。
小五郎說，「除此以外還有一點。你放在褲子右邊口袋里的東西可以拿出來給大家看看嗎？」相原大驚失色，千鈞伸手按住他的肩頭，「鈴木警官！」相原覺得全身發麻動彈不得，鈴木立即走過來，「相原，快點讓大家看看。」說著話，鈴木從相原的口袋里掏出了一根長長的釣線。毛利道，「這根釣線就是你從原本吊在暖爐里的塑料袋上所系下來的釣線，那個時候，鎮長和柯南去廚房找你，你就慌慌張張將釣線塞到口袋里了。」鈴木一郎全都明白了，「看來，你連毀滅證據的機會都沒有哦，還是說你看到大家都判定是意外，就疏于防範了？」
相原見事已至此，不再抵賴，「雖然她在外人面前都說她感激我救了她一命才讓我到這里當管理員的。其實我根本是為了她這只女王蜂拼命工作，做牛做馬的工蜂。但是她答應過我，只要溫泉勝地完成就會提拔我做經理，為了這句話一切的苦我都忍了。誰知道這全部都是謊言，她說的一切都是騙我的。所以我再也忍不住了，其實我一直計劃著要破壞明天的開工典禮。今天是我最後的機會了！」就這樣，案件都查清了，鈴木一郎警官將相原信吾押走了。
毛利醒過來後，還有些昏昏沉沉的。小蘭大聲贊揚，「還是我老爸有一套，又順利地解決了一件案子，推理的真是精彩啊！」小五郎已經听千鈞大致講過了整個推理過程，放聲大笑，「這根本就不是什麼難題。」柯南說肚子餓了，又嚷嚷著去泡溫泉。毛利也很高興，「那好，我們就去泡溫泉吧！順便磨練男子漢的本色！」千鈞贊成，「剛下完雨，路還不好走。等明天再回去吧。」小五郎大笑，「我沉睡的小五郎，身心越來越高明了！」看著大叔厚顏無恥地吐著舌頭大笑，柯南無語了，「我看你最高明的應該只有睡覺吧！」
尾聲，相原信吾因不滿待遇問題殺死山崎裕美，被法庭判處5年徒刑。毛利小五郎因破獲蜂蜜雞尾酒殺人事件，當地警方給以b級獎勵。隨著山崎社長的死亡，岩見鎮旅游勝地計劃自然擱淺了。中村江里離開岩見鎮後，很快在東京找到了新的工作，美女秘書在哪里都受歡迎。缽八兵衛死了老相好，振興經濟的計劃又泡湯了，自然非常郁悶。千鈞對那幾瓶藥酒非常感興趣，花了一筆錢從缽鎮長那里買了3瓶，分別送給了祖父橫野一夫和外公千水一木，兩個老鬼子非常高興，知道這種鄉下特制的藥酒在市面上很難買到。藤野樹人得到了剩下的那瓶，卻是哭笑不得。