蘇醒的美洛耶塔通過現行鏡找出了三雲神的所在，但結果卻令王皓和鵬禹感到無比的詫異。因為他們正是從那個地方來的，倘若三雲神真的還在三雲島，那為什麼豐饒神社會荒廢？王皓不由的質疑起美洛耶塔那所謂尋找三雲神的辦法，可卻听到了一些驚為天人的話！
「人類！你敢質疑我的辦法？當初這個現行鏡可是我的梳妝鏡，我能不知道它怎麼用？別說是這個破鏡子，就是那三雲神，我想要他們哭，他們就得哭；想要他們笑，他們就得笑！」
這話乍听一下十分驚人，但王皓冷靜的想了想，又好像是那麼一回事。三雲神雖然是傳說中的寶可夢，但他們嚴格上來說只能算是二級神，種族值除了土地雲略高一些，達到六百之外，其他兩只都是五百八十。而作為幻之寶可夢的美洛耶塔，單是種族值就六百，確實可以壓制三雲神。當然，傳說寶可夢並不是只靠種族值來定強弱的，他們中一些寶可夢的能力就非常的棘手。
美洛耶塔所說的內容也不為過，她確實可以隨時讓三雲神哭哭笑笑，畢竟她的能力是通過歌聲去控制寶可夢的情緒。甚至王皓懷疑當初美洛耶塔無法控制自身情緒的時候，或許三雲神也都遭過殃！不然這個時候的美洛耶塔怎麼敢如此信誓當當的說出這樣的話來呢？
既然美洛耶塔已經蘇醒，並且她也已經確定了三雲神的位置，那麼就算是在三雲島，王皓覺得也應該去探查一番。于是，一行人回到了通道外，並通過胡帕和耿鬼構建的空間通道離開了海底遺跡。因為曾經由三雲島的豐饒神社穿梭到海底遺跡，所以胡帕和耿鬼在構建空間通道的過程中沒有受到太大的阻礙。就這樣，王皓一行回到了豐饒神社的前面。
「這里怎麼變成這樣了？以前總是往這里跑的人類呢？他們真的舍棄了土地雲，舍棄了豐收嗎？似乎這座島上發生了很大的變化啊！」
美洛耶塔一出現在豐饒神社前就感知到周圍的情況了。對她來說，周圍的一切都是陌生的，和她記憶中的豐饒神社完全不同。她不知道自己沉睡這些年究竟發生了什麼，也不知道為什麼這里會變成這樣，就只剩下一陣感慨了！
「三雲島這些年有了自己的發展，港口的建立和其他行業的發展使得這里的人們不再依靠農業，就連曾經引以為豪的復活草也都已經沒有人再種植了！大概是因為這樣的變化，所以再也沒有人祭拜豐饒神。這里也就被徹底的荒廢了！」
因為能夠感受到美洛耶塔嘆息中的無奈，所以王皓也就給出了解釋。這或許就是發展的必然吧？不過，這樣的解釋其實有些太過蒼白了！畢竟，如此徹底的拋棄過往的神，確實有些匪夷所思。就算島內再怎麼發展，島民中都還是會有一些執著的老一輩存在的，他們為什麼也會舍棄豐饒神社，舍棄莊稼呢？
「你知道為什麼我們會被你們人類稱之為傳說中的寶可夢嗎？並不是因為我們有著強大的力量，也並不是因為我們的數量稀少。而是因為人類與我們之間有了間隙！這是雙向的。在你們人類當中，有人畏懼我們的力量，對我們進行驅逐和封印，讓我們只能存在于一些古老的傳說之中。而在我們之中，也有相當一部分則因為對人類感到失望，不想與人類接觸，所以躲藏了起來。這也導致了有些人一輩子都不見得能夠見到我們一面。土地雲應該是經歷了被人類舍棄的過程吧，所以才會任由這里荒廢成這樣，不然就算沒有人拜祭了，他也會好好的收拾收拾的！畢竟這里是他非常喜愛的一個住所，不管去到哪里，最終都會回到這里休整一段時間！」
听著美洛耶塔解說「傳說寶可夢」的含義，王皓一下子愣住了。因為他怎麼都沒想到，這些寶可夢的分類是這樣由來
的。數量稀少，實力強勁並不只是他們的真正樣貌，更重要的是他們與人類之間有了間隙。越來越多的人們只能通過傳說去了解這些寶可夢，而不是真正的與他們有所接觸。這樣的話里有著多少的無奈和可惜，就是小威和鵬禹听著也都默默不語了。
「現行鏡不是表示三雲神現在就在這座三雲島上嗎？豐饒神社這里是肯定沒有的，他們還會在什麼地方？」
王皓一行的目的本就是為了三雲神，雖然意外的喚醒了美洛耶塔，但他們最迫切的事情還是找到三雲神。美洛耶塔自然也是清楚的，所以她也沒有再繼續感概，而是緩緩的飛上了高空，然後釋放出一股龐大的能量。美洛耶塔是一般屬性和超能屬性的寶可夢，此時她所釋放的自然便是超能屬性的能量。這是在利用這些能量尋找三雲神嗎？
王皓一行沒有去打擾美洛耶塔的動作，就這麼默默的等候著。美洛耶塔也沒有讓他們久等，一分鐘之後便落了下來，然後說到︰「他們果然是在這里！只不過現在聚在一起了，多半是又發生了爭執吧！你們跟我走吧，不是有事情要跟他們談嗎？這個時候去正好可以勸架！」。
三雲神起爭執了？美洛耶塔的話瞬間就讓王皓一行聯想起了有關他們的傳說。據說，三雲神中的龍卷雲和雷電雲脾氣不是很好，經常因為一些事情而起爭執。土地雲很多時候都要充當和事佬的角色，去調停兩者之間的爭斗。畢竟，這兩個不省心的家伙一旦發生爭執就會掀起暴雨和雷霆，給寶可夢世界帶來災難。一想著要給這麼危險的兩個家伙充當和事佬，王皓就覺得有些頭大，不過現在也只能硬著頭皮上了。
跟在美洛耶塔的身後，王皓一行穿過了樹林進入了一條特殊的通道。到了現在，王皓已經大致清楚三雲神的所在了。三雲島除了豐饒神社所在的主島之外，還有連接著兩座小島。根據流傳在三雲島的傳說表示，這兩座小島分別就是龍卷雲和雷電雲棲息的地方。之前美洛耶塔也有提過，這兩座小島上也存在著神社，而且是分別對應龍卷雲和雷電雲的神社。
雖然王皓現在不清楚美洛耶塔正在前往的地方究竟是龍卷雲神社所在的小島，還是雷電雲所在的小島，但起碼到時候可以一下子見到三雲神，不用再去跑多一趟。至于怎麼勸架？這個王皓是真的沒有任何的概念，只能說盡量不要偏袒任何一方吧！通道並不長，只是走幾分鐘就到頭了。
走出通道之後，王皓一行就感受到了一陣強烈的颶風，雖然沒有雷霆和暴雨，可那風的威力也一點都不弱，給人一種隨時會被掀飛的感覺。王皓展開波導的力量，形成防御壁壘，將小威、鵬禹都給護在身後。這才勉強抵擋住颶風所帶來的影響。而這樣的颶風並沒有持續很久，在美洛耶塔的歌聲之中戛然而止了。
因為美洛耶塔的歌聲，三雲神統統聚攏了過來。在外形上，三雲神其實是十分類似的，特別是在化身形態的時候。上半身都是肌肉健碩的模樣，而下半身也都是雲霧的形狀，較大的區別應該就在于三者身體的顏色了。龍卷雲為綠色的身軀；雷電雲為藍色的身軀；土地雲則為土黃色的身軀。此外，他們的尾巴也有些區別。龍卷雲的尾巴為紫色綴有黃色螺旋花紋的樣式；雷電牙的尾巴為紫色連環流星錘的樣式；土地雲的尾巴則是一根棕色的、卷曲的樹枝樣式。
當三雲神出現在美洛耶塔的眼前時，他們的神情都是一致的，那就是詫異。其中以土地雲的神情最為夸張，因為他很清楚美洛耶塔沉睡的事情。美洛耶塔也只能解釋一遍自己是怎麼從沉睡之中蘇醒過來的，同時也向三雲神介紹了一番王皓一行人。三雲神怎麼都沒想到是一群人類喚醒了美洛耶塔，土地雲更是一臉不滿的對王皓說到。
「人類！美洛耶塔比較單純，被強制喚醒之後並沒有表現出不滿，但我覺得你們還是要為自己的行為付出一些代價才是！你們知道私自將美洛耶塔喚醒的後果有多麼嚴重嗎？我現在恨不得就地把你們打一頓！難道人類都這樣嗎？自以為是，又自私自利？」
土地雲的責備讓王皓覺得有些莫名其妙，雖然他們確實魯莽的喚醒了美洛耶塔，但並沒有強制美洛耶塔做任何事情。王皓原本的想法很簡單，那就是增加己方的戰斗力。可沒想到會因此而受到土地雲的指責。王皓覺得自己還是有必要爭辯一下，不能莫名其妙就成為了自私自利、自以為是的人類了。
「現在整個寶可夢世界都在面臨一場危機，我相信作為傳說寶可夢的你們早就已經感知到了吧？雖然我們確實是強制喚醒了美洛耶塔，也確實想要借助美洛耶塔的能力去對抗究極空間中的異獸和究極奈克洛茲瑪。但，我們並不是為了自己，而是為了這個寶可夢世界！試想一下，倘若寶可夢世界被究極奈克洛茲瑪奪走了所有的光，那將會變成一個怎樣的世界？」
「你倒是會說一些冠冕堂皇的話，遇到不可敵的對手了，危及到生命了，你們人類就想起我們這些寶可夢來？我們只存在傳說之中，救不了你們人類的世界，也不想救！看在你們並沒有對美洛耶塔做出任何不利的事情來，這次就放過你們！趕緊離開這個地方吧！我們並不想見到你們！」
王皓怎麼都沒想到土地雲會說出這樣的話來，這跟他之前所想的完全不同。這段時間，王皓一直在尋找卡洛斯地區和和合眾地區的傳說寶可夢，也了解到這些傳說寶可夢與人類之間的故事。就算是討厭人類的波爾凱尼恩、不信任人類的聖劍士，也都在听到寶可夢世界充滿危機的時候選擇出手。為什麼三雲神的情況卻是完全不同，直接了當的拒絕了呢？
倘若是龍卷雲或雷電雲說出這樣的話來，王皓都多少能夠接受一些。偏偏如此堅決的竟然是土地雲，這就很奇怪了。作為豐饒之神的土地雲，不是應該和人類最為親近的嗎？當初他可以對人類的事情有求必應，給人類的農作物帶來了一次又一次的豐收啊！為什麼現在他會變成這個樣子？
透過波導的感知，王皓能夠察覺到土地雲語氣中的不滿和嫌棄，但他不明白這究竟是為什麼？同樣充滿困惑的還有美洛耶塔，她睜大了自己的雙眼，向土地雲詢問到︰「我沉睡的這些年究竟發生了什麼？為什麼你對人類好像多了一份敵意？作為豐饒之神的你，不是一直都很親近人類嗎？」。
因為提問的是美洛耶塔，土地雲也就顯得沒有那麼的咄咄逼人。他有些無奈，又有些憤懣的說到︰「我已經不再是什麼豐饒之神了！從前人類希望風調雨順，希望農作物豐收，所以經常會祭拜我，稱呼我為豐饒之神。可現在，他們已經不需要我了，你也應該看到，我的神社荒廢了！那便是我不再被需要的證明！曾經我也嘗試著去等候，但等來的只有遺忘！這座島上的島民甚至連我的存在都已經模糊了，他們只是依稀記得一些所謂的傳說而已！」。
豐饒神社的情況，無論是美洛耶塔，還是王皓一行都非常的清楚，確實徹底的荒廢了。而島民們對于土地雲的認知，也確實有些模糊了。王皓尋找豐饒神社之前就從民宿老板那里了解了一些情況，他雖是這里的島民，但對于三雲神的認知也僅僅只是停留在傳說之中。可以說，土地雲的話並沒有任何的夸大成分。只是為什麼這個地方會變成這樣？三雲島上的島民難道不是因為信仰豐饒之神才建立的豐饒神社嗎？信仰這東西是一瞬間就能改變或是淡忘的嗎？王皓總覺得這座三雲島或許發生過什麼事情才導致現在三雲神被舍棄的結果！