階段二，顧名思義就是天啟星一干新神對所選中的目標，被達克賽德所分化的神格所侵蝕，腐蝕的第二階段。目前為止，在天啟星新神掌控中的只有超人，閃電俠和被放逐到天啟星的萊克斯•盧瑟，而在地球上，同樣被選作目標的蝙蝠俠，沙贊還有柯文也在這場針對他們的布局中苦苦掙扎著。
中心城內，已經被閃電俠巴里•艾倫用聖賢力洗腦的柯文，在確定後天就能夠見到便利貼中所提醒自己去尋找的諾拉•艾倫後，也恢復了日常的生活。駕駛著賽特朗號戰車回到自己所住的公寓，下車的柯文回頭看了一眼自己這輛愛車，不知為什麼，他總感覺之前一直沒有動靜的愛車，今天好像一直在看他，但，車子怎麼會看人呢。
「一定是我想多了，這年頭外星人雖然存在，但也不能莫名其妙蹦出來個汽車人啊，寫小說也不能這麼扯不是。」
低聲嘟囔一句，柯文這才離開，在確定柯文回到公寓後，原本停在停車場中沒有任何動作的賽特朗號，那裝載著AI蝙蝠俠顯示界面的Drive驅動器也亮起白光，儀表盤投射，就在車內將柯文之前進入中心城，從第一次遭受巴里用聖賢力屏蔽記憶到最後這次洗腦的一切畫面都播放了一遍。
在確認沒有任何遺漏後，這才結束了投影，同時，AI蝙蝠俠的聲音也從Drive驅動器中傳了出來。
「為了你的母親，你選擇了這條路嗎，巴里，還真是跟不義蝙蝠俠分析的一樣，你太善良，但也太容易動搖了，你從來沒有想過你母親的感受，即使只是一個機器。也罷，柯文，讓我看看即使沒有了記憶，你能做到什麼程度吧，作為假面騎士的你。」
低聲自語的AI蝙蝠俠也陷入了沉寂，從柯文一開始進入中心城受到巴里的聖賢力影響時，在柯文即將被屏蔽掉關于Drive一切記憶的最後一刻，他被柯文從系統空間里召喚了出來。繼承了不義宇宙蝙蝠俠全部記憶，閱歷再加上氪星的幻影科技，從AI蝙蝠俠誕生開始，他就是一個獨立的個體了。
繼承了蝙蝠俠的一切，但比蝙蝠俠更理性，更能夠以旁觀者的角度看待一切問題。所以從被柯文召喚出來後，AI蝙蝠俠就沒有表現出任何異常，就是把自己當成一輛有點智能的高級跑車，全程記錄著一切，作為柯文不知道的後手在必要的時候翻盤。這也是柯文將自己召喚出來的意義，一個連自己都不知道的底牌才能騙過暗中搞事的敵人。
只是在沉寂之際，AI蝙蝠俠也說道︰「其實，你也想要我們阻止你的對吧，不然，你又怎麼會忽略我呢，當初他就在你們面前召喚過我，巴里，夢該醒了。」
說完這最後一句話，活躍過來的賽特朗號再次變回那輛平平無奇的跑車。而就在柯文和AI蝙蝠俠等待著後天那場與諾拉•艾倫的見面時，在天啟星，從天啟星的敵對星球新創世星出發，成功潛入到天啟星中的新神，奇跡先生斯科特也與天啟星反抗軍領袖萊克斯•盧瑟接觸了。
此時的奇跡先生正與萊克斯•盧瑟一塊，試圖潛入到達克賽德的宮殿中，而在斯科特身後，這位在地球上呼風喚雨，依靠著自己那絕頂聰明的智慧，數次拯救過世界的光頭盧瑟，也在天啟星這個磨練人的星球上成為了一名合格，優秀的戰士。哪怕是作為新神的奇跡先生，也不得不對眼前這位人類感到驚訝。
雖說他也成功從天啟星上逃月兌了，但作為新神，本身他的.asxs.就比萊克斯高出了許多，再加上從小接受的教育，訓練，只需要一分運氣，機會，自然能夠做到逃出天啟星。可萊克斯不是，在重新潛入到天啟星這段時間，奇跡先生也在暗中觀察著這位混在天啟星反抗軍中的人類。
從他被反抗軍接收，然後再依靠著自己的智慧，指揮逐漸在反抗軍中掌握話語權，一直到成為反抗軍領袖，這才讓奇跡先生選擇出現在萊克斯面前，並且與之合作。就像現在，由萊克斯掌控的天啟星反抗軍在達克賽德的領地上制造騷亂，吸引著那些達克賽德爪牙的注意力，而他們兩個，則是進入到達克賽德宮殿，尋找達克賽德已死的真相。
「把我扔到這顆星球上受苦受難，然後就這樣什麼都不知道的離開了？我萊克斯•盧瑟從來沒做過這麼吃虧的生意，達克賽德已死？就是真死了，我也得親眼看到他的尸骸成灰，把他的一切拿走我才覺得自己不虧！」
這是奇跡先生在跟萊克斯•盧瑟合作的時候，萊克斯跟他說的，雖然對于萊克斯這番厥詞感到好笑，但奇跡先生得承認，在智慧這一方面，他沒有眼前這個人類強大，他的智慧，配合自己的技術還有經驗，讓本該困難重重的潛入變得輕松起來，就像現在，在他的帶路下，兩人已經來到了達克賽德宮殿的地牢。
「到了，從這里就可以進去，就能到達克賽德的宮殿了。最後再問一次，你真的不打算離開？現在父盒還能將你傳送走，如果待會進去了，就算到時候想走，也不好說了，天啟星強大的存在，可不止達克賽德一個。」
通過自己手中的父盒，將路線確定下來的奇跡先生也再度對身後穿著一身用天啟星材料打造的裝甲的萊克斯。因為環境原因，萊克斯這次的裝甲審美倒沒有那麼惡趣味了，基佬紫配力量綠的搭配沒了，取而代之的紅色和黑色相間，依舊是把自己那顆大光頭給露了出來。
「那我也重復一遍我自己的話，他死了我也得從他身上取走我應得的東西，這段時間在天啟星受苦受難的損失，不拿一點回來，我不爽。搞快點，我的人可沒法在達克賽德軍隊手里堅持太久。」
對于奇跡先生的勸告，一向自負的萊克斯也不爽催促道，自己為什麼會被放逐到天啟星，這個原因他不想跟眼前這個自稱為新神的家伙說，但萊克斯心里也明白，要想在天啟星上得到些什麼，還得依靠眼前這位新神的幫助，這個家伙就跟自己認識的超人一樣，一樣善良好忽悠。
「為什麼這麼堅持呢，」對于萊克斯的執著，完全不明白原因的奇跡先生只是在那多問了一句，天啟星就是一個永遠沉淪的地獄，每個人都想逃出來，但都沒有辦法，而眼前這個人類，卻要在這個地獄里獲取想要的東西，有什麼東西能比自由更寶貴，他搞不懂。
「要你管？！做你的事吧，神！」
懟了奇跡先生這位新神一句，在奇跡先生轉頭用手中的父盒破解進入程序的時候，萊克斯也悄咪咪打開自己手部的護甲，一張照片也從中露了出來，里面是兒時的自己和妹妹萊娜•盧瑟的合照，原本在他們身後應該還有父母的影像，卻被萊克斯撕掉了。在看到照片中的妹妹時，萊克斯的眼神也變得柔和起來。
‘很快的，老哥就會回去了，萊娜，別擔心，超女有超人撐腰，那個扎塔娜也有個魔法老爹，你也不差，你還有老哥我，媽的，我就不信那個臭小子敢欺負你，誒，那個臭小子是誰來著？’
心中，萊克斯也在那對著自己僅有的這張照片說著心里話，同樣的，他也受到了曼哈頓博士修改現實的影響，沒有了與柯文相關的記憶。只知道自己一定有著給自己妹妹撐腰的力量，才能暴打一個自己氣到連名字和長相都忘了的臭小子一頓。就在萊克斯想著回去怎麼給自己妹妹撐腰的時候，在前方帶路的奇跡先生，也用自己手中的父盒打開了通往達克賽德宮殿的道路。
隨著道路的指引，兩人也有驚無險的進入到了達克賽德宮殿之中，而擺在萊克斯和奇跡先生面前的，則是天啟星的生物科技結晶，母盒電腦，而在電腦上，則是用投影顯現出一塊塊大屏幕，屏幕上有著超人，蝙蝠俠，閃電俠，沙贊，萊克斯，以及柯文的頭像。而在這些投影的屏幕後方，則是蜷縮著一具尸骸，那巨大的身軀，還有盔甲上那個歐米伽符號，以及這個地方。
都讓萊克斯和奇跡先生明白這具尸骸是誰——天啟星的君主，達克賽德！
只是他們無法明白的是，為什麼在這里會有正義聯盟成員的頭像跟一個自己不知名的年輕人，天啟星把這些人放在電腦這里，又是為了什麼。
「這•••到底是怎麼回事！」看著電腦上投影屏幕上的頭像，奇跡先生也疑惑了。
他自然知道正義聯盟，畢竟是整個宇宙里，唯一一個除了新創世星外，打退天啟星和達克賽德入侵的文明。但那個年輕人，他卻不認識，在看到這樣的畫面後，也將眼神轉向了自己身後的萊克斯，想知道這個聰明絕頂的地球人，能否從這些圖像中找到一些相關的線索，還有那具尸骸，到底是不是達克賽德。
「這你問我，我也沒法第一時間回答你啊，我只能說，我被放逐到天啟星，一定是這些家伙搞的鬼！」
對于奇跡先生的質問，此時的萊克斯•盧瑟也只能做出這樣的回答，畢竟眼前所看到的畫面對他沖擊也不小。誰能想到自己還有正義聯盟的成員，包括蝙蝠俠都成為了天啟星某個計劃中的一部分。還有這具尸骸，如同小巨人一樣的尸骸，如果真的是達克賽德，那麼現在，在天啟星擁有著最高話語權的，又會是誰？！
「很高興，你們終于到了這里，還有，好久不見，斯科特。」
就在奇跡先生和萊克斯為眼前的景象感到震驚時，一道聲音也在他們身後響起，聞聲轉頭，奇跡先生斯科特和萊克斯就看到一個高大的身影站在黑暗中。無法看清全貌，但是那雙赤紅色的雙眼，在黑暗中是如此的顯眼。還有那氣場，讓曾經直面過達克賽德的奇跡先生第一時間驚叫出聲。
「達•••達克賽德？！」
「誰讓你直呼我父親名諱的，斯科特。」
站在暗處，一道赤紅色的射線就從這道身影雙眼釋放，朝著奇跡先生攻擊過來，面對這樣的攻擊。作為新神的奇跡先生自然釋放出了護盾進行防御，只是這道射線直接無視了奇跡先生所釋放的護盾，輕松在其大腿上穿了一個洞，在給奇跡先生造成傷害後，這道身影才從黑暗中走出來，也讓奇跡先生看到其全貌。
與達克賽德如出一轍的裝甲，只是在裝甲下的這個人，他認識。
「奧利安？！」
「是的，是我，斯科特，我得感謝你，你把我要的人帶來了。」
話語一出，被射線擊倒在地的奇跡先生也看向一旁的萊克斯，這時候的他，也明白自己從進入天啟星與萊克斯接觸開始，就已經在奧利安，這位達克賽德的兒子監視下了。
「還有你，你想要從偉大的達克賽德身上取走你應得的東西？很好，我滿足你，你來了，我也不用自己動身了，來吧。」
「父盒，帶我們離開這里！」
【遵命】
奇跡先生手中的父盒放出光芒，就打算帶著奇跡先生還有萊克斯離開，而早就在這等著的奧利安又怎麼會讓他們這樣輕松逃離。這里可是天啟星，一個一旦踏入就永遠無法逃月兌的無間地獄，雙目紅光凝聚，滿功率釋放的射線也與奇跡先生手中的父盒撞擊到一起，巨大的光芒也覆蓋了整個達克賽德宮殿，將一切喧囂掩蓋。
光芒閃爍了許久，才從達克賽德宮殿中消失，而在之後，原本發生在天啟星各處的反抗軍暴亂也一下安靜了下來。只剩下穿著達克賽德裝甲的奧利安從宮殿中飛出，手中也出現了母盒，對其說道。
「傳訊，階段二即將結束，階段三成神開始，一切，都是為了達克賽德。」
【是，一切都是為了達克賽德！】