「萬歷四十四年，皇爺爺下旨禁止你們在大明傳教，並將你們驅逐，那場教案為什麼會發生，孤不知道你們有沒有去想過這其中的原因？」
說這話的時候，朱由楫還特意瞧了眼一直沒有說話的龍華民神甫，也沒有要他們回答的意思，而是自顧自的對眾位神甫說到，「你們是虔誠的基督徒，無論是公教還是正教，都是一神論宗教，包括穆斯林同樣是一神論的宗教。
所以很排斥其他的宗教或者說是多神論。
但是本王要告訴你們的是，在東方這片土地上只允許一神論的宗教信仰存在是不可能的。
孤的第一個疑問，便是你們在我大明傳教，要如何調和教民們在信仰天主基督的時候，與他們原本的文化、信仰上的矛盾？是否依舊堅持只允許教民信仰基督，排斥儒家思想，而繼續嚴禁中國教民祭祀天地、祖宗，祭拜三清、孔孟?」
「孤信奉宗教信仰自由，不會去管大明百姓信奉何種宗教，所以不會排斥你們在大明傳教，但是如果這個問題你們無法解決，任舊如此前一般視我華夏傳統禮儀文化為異端，那麼本王只能對你們說抱歉，孤不會去向皇爺爺奏請解除朝廷對你們的傳教禁令。」朱由楫神情嚴肅的對他們說到。
「孤尊重你們的信仰，尊重尊你們的宗教，所以孤也請你們能夠尊重我大明百姓原有的信仰和宗教。
其實對本王而言，我大明的百姓可以不拜朝廷官員、不跪大明天子，甚至于可以不敬諸天神佛、不祀孔孟，但是不祭祀自己的祖宗，這一點是絕對不被允許的。
大明朝從太祖開國至今雖然只有200多年，但是從我們的祖先開始繁衍至今天我們這一代人，5000年的歷史和文明，敬天法祖乃我漢家的傳統美德與禮儀文化，是根植與我們血脈之中的信仰，是任何人都不能去破壞的！」
朱由楫的這一番話說出來，讓這些神甫們頓時神色各異，更有其中幾名神甫向龍華民投去了稍顯有些復雜的目光，尤其是見朱由楫在說這番話的時候眼神不時往龍華民神甫看去，他們都能听得出來這是意有所指。
他們這些人當中，有些人曾經有過一段在大明境內傳教過的經歷，只是後來在萬歷四十四年的那場教難中被驅逐了，有的人是第一次從遙遠的歐洲來到大明，但是他們對當年的那場教難為什麼會發生，他們多多少少的都知道其原因的。
那場教難，是他們在東方傳教事業遭受的一次重大挫折和損失，而龍華民神甫，便是誘發這場教難的直接兩個關鍵人物的其中之一，另一個是當時南京禮部尚書沈榷。
不過龍華民神甫的養氣功夫似乎修煉的不錯，縱使听出了朱由楫話多半是有專門說給他听的意思在里面，面對身邊同伴對他復雜目光，竟然依舊能夠泰然自若。
「非常感謝尊貴的殿下，您的這番提醒，」金尼閣
只能再次站出來說話到，「我們會非常認真的考慮您所說的這個問題的，爭取制定一個兩全其美的辦法。」
朱由楫頷首︰「如此最好！」
「孤知道，你們的羅馬教會有著自己的教廷，在教宗之下還有著樞機主教、樞機神甫、樞機執事三級主教，而且皆穿紅衣。
在外的每一個教區又有相對應的主教，管理該教區的教務。
孤的第二個疑問便是，如果孤說服了皇爺爺下旨，取消了你們在我大明傳教的禁令，允許你們在中國自由傳教之後。
關于在中國教區的主教人選如何確定？我大明的本土基督教徒能否擔任主教？
主教又要如何任命？是由遠在羅馬的教宗親自任命，還是由我大明的基督教徒選舉產生？」
「這個」朱由楫這一連串的問題頓時就把在場的諸位神甫給問懵了，一時之間竟然不知道該要如何回答，他們沒有想到，朱由楫想的竟然如此長遠。
因為他們前來大明傳教，現在想的最多的還是要如何重新在這片神秘的東方國土上打開局面，能夠恢復傳教活動，壓根兒就沒有想到過這麼長遠的事情。朱由楫提出的這一連串問題他們一時半會根本就沒有辦法回答，這些問題比之前面的第一個問題要更加敏感和棘手，而且他們也沒有權限對這個問題做出圓滿的回答。
「尊貴的殿下，不得不承認，您在看待事物的眼光上真的非常長遠，」神甫郭居靜神情認真的對朱由楫說到，「但是我也不得不說聲非常抱歉的話，對于您提出的這第二點問題，我們沒有辦法回答您，也沒有權限可以做主，必須要寫信或是有人返回歐洲親自覲見過教宗陛下之後，才能有所回復。」
「孤可以理解，所以，孤也不要求你們能夠馬上解決這個疑問？不過，孤以為中國教區的主教任命最好還是以大明本土教徒選舉產生，由大明朝廷任命的好，而不是通過羅馬教廷指派，教宗任命。」
「不！」朱由楫這話還沒有說完，眾位神甫的臉色便猛然一變，尤其是一直沒有說話的龍華民，表現的很激動，更是直接叫到︰「這絕不可能，主教的人選可以從中國本土的信徒中產生，不經過教宗陛下的指派而由信徒自己選舉這是非法的，主教必須要右教宗陛下親自任命才行！」
一下子，眾人之間的氛圍變得有些尷尬和詭異。朱由楫神情頓時再次變得嚴肅起來，眼神直視龍華民，語氣也變得有些生硬起來，「尊敬的龍華民神甫，看來你還沒有認清形勢！」
「我大明的百姓原本就是有著自己的文明禮儀、宗教信仰的，儒、釋、道、回，甚至以對你們的耶穌基督，信仰哪一種其實都無所謂，因為生活在這片土地上的人們，從幾年前的祖先開始倒現在，百姓們無論什麼神靈，似乎什麼都願意去磕頭祭拜，但是孤可以很明確的告訴你們，我大明的百姓其實是沒有什麼宗教信仰的，只
是敬神而非信神！
大明百姓真正的唯一的信仰，便是敬天法祖，祭拜炎黃！」
「在你們的《聖經》創世紀中有這樣一個關于滅世大洪水的故事，說耶和華見人在地上罪惡極大，于是宣布將使用洪水，毀滅天下地上有血肉有氣息的活物，無一不死！
又讓義人諾亞建造一個巨型的方舟，把這個世界上的每一種生物都留下至少一對，放入方舟里面，等方舟建好以後，天上降下暴雨，水位不斷的往上漲，把方舟從地上漂起，大水涌來，洪水泛濫地上40晝夜，水勢在地上極其浩大，所有的扇嶺都淹沒了，把地上一切的生物都消滅掉了，唯有在諾亞方舟里的人和動物得以保存。
5個月後，方舟停在拉臘山上；又過4個月後，洪水退去了，諾亞離開了方舟
諾亞便是你們的祖先。
你們西方在遇到大洪水這樣的滅世災難的時候，是靠著神的幫助和救贖！
在我們大明也有一個關于滅世大洪水的傳說，但是我們的祖先卻並沒有去祈求神的幫助予救贖，而是在一個叫做大禹的人帶領下去與大洪水搏斗，抗爭，治理大洪水，最終把大洪水全都成功的引導流入了大海。
我們的祖先靠的不是宗教和神靈，而是智慧、勇氣和勤勞的雙手，以及吃苦耐勞、不畏艱險的精神。
所以，你們的宗教和神靈，與我大明百姓而言，可有可無！
而且你們要來大明傳教，現在是你們有求于我大明！」
「孤的這第二點疑問，希望你們可以好好思量一下，這不是條件，也沒有轉圜的余地，而是要求，如果你們以及你們的教宗陛下無法接受這個要求，那麼，本王只能非常遺憾的告訴你們，你們將會再次驅逐，只要這大明朝還在，你們便沒有可能進入中國傳教。」
朱由楫嚴厲的語氣，讓所有神甫的神情也不由的嚴肅了起來，他們開始在心里面重視起朱由楫所提出的疑問，同時在心里面開始衡量分析，希望能夠尋求出一個解決的方案！同時，原本因為徐光啟告訴他們朱由楫這位少年王爺很開明，很好說話，以及一開始朱由楫對天主教並不排斥的態度都讓他們感到興奮，以為終于有了機會可以再次進入大明傳教的激動，也在這個時候冷靜了下來。
所有的神甫都因為朱由楫嚴肅的神情，以及這番嚴厲的話語，不由的有些緊張的在他們的胸前畫起了十字。
金尼閣在畫著十字，在心里面默默的禱告一番，然後深呼吸了一下，平復了一下自己的情緒，讓自己的聲音顯得盡量的更加穩重，「尊貴的殿下，請您再談一談您的第三個疑問吧。」
朱由楫微笑著道，「若是孤的第二個問題你們以及遠在羅馬的教宗陛下都無法接受的話，想來，孤的第三個疑問也是無法得到有效解決的。」