在大地恍惚之間，艾克斯就已經出現在了一個密閉容器之中了。
作為實驗小隊的一員，大地在短暫地觀察四周之後，立馬意識到他和艾克斯，居然被關押在了一個錐形燒瓶之中。
而他們就處在一張實驗桌上，周圍都是玻璃器皿之類的儀器。
「這里是哪里？」大地有些驚惑地問道。
就在大地正在四處張望的時候，身後傳來了腳步聲。
「是誰？」大地轉身向著身後望去，看到了一只巨大的拿著放大鏡的猩猩，正在觀察著他。
在大地驚懼的目光中，大猩猩走到實驗桌的前面，開始講述著它的故事。
「我是M1號，是過去被科技力量所創造出來，而又被人類拋棄的人工生命。」大猩猩蔚藍色的眼眸猛得一張，關于它的影像就被投影在了半空中。
大地喃喃道︰「人工生命？」
艾克斯則有些擔憂︰「大地，我們現在沒時間理它！阿守也有可能被他傳送到某個地方了。用賽羅奧特曼的力量，逃離這里吧！」
「好，我知道了！」
大地從腰包之中，取出了虛擬賽羅卡片，準備以空間穿梭的方式，逃離大猩猩的魔爪。但終端機並沒有開始讀取塞入卡槽中的虛擬賽羅卡片。
「什麼？為什麼？」這讓大地感到十分驚懼和困惑。
「在這里，無法使用那些卡片！」大猩猩回過頭，看向在燒瓶中的艾克斯。
艾克斯見到無法使用虛擬卡片的力量之後，就準備以暴力打破燒瓶，來月兌離困境。但令艾克斯沒有想到的時，無論他使用著多大的氣力，都無法打破著看似脆弱的玻璃器皿。
「哥莫拉終于恢復了它本來的樣子！」大猩猩催動著念力，懸浮在了半空之中，面前出現了Ex哥莫拉的實時景象，語氣越發冷漠︰「但是，你們為什麼還要奪走它的自由？」
……
神木正太郎︰「空戰馬斯凱迪使用梵頓光子炮，作威脅攻擊，以此限制它的行動！讓阿守去制服他！」
隼人︰「明白！」
就在艾克斯和大地被大猩猩傳送走之後，哥莫拉就鑽地前往了最近的一座城市。
盡管海克斯奧特曼和空戰馬斯凱迪，以虛擬賽羅卡片的力量，在極短的時間內趕到了現場。但哥莫拉仍造成了不可預計的破壞。
明日奈從實驗車輛阿拉米斯上下來，拿出終端機對著神木正太郎隊長匯報道︰「K-5地區的市民已經全部避難完畢！」
「叮叮叮！」是終端機收到緊急信息的聲音。
明日奈眯著眼楮听著琉依發送過來的語音︰「哥莫拉身上有著實體化粒子，這種粒子會與阿守他們的射線沖突，而產生劇烈的爆炸。所以，並不能通過海克斯奧特曼的必殺光線，將哥莫拉復原！」
明日奈听完之後，便有了決斷，立馬駕駛著阿拉米斯前進著。
「讓我們來阻止哥莫拉吧！」隼人朝著哥莫拉身周的地面，發射出數枚梵頓光子炮，來限制著哥莫拉的行動。
三日月守原本想用虛擬賈戈爾貢卡片，來封鎖哥莫拉的行動。但三日月守覺得這張卡片太霸道了，在吉奧基地中實驗時，曾將一個靶子真的變成了石頭，並且再也變不回來了。
三日月守怕真把哥莫拉變成石頭，所以，只能在遠處控制著岩石，封鎖住哥莫拉的行動。
但哥莫拉根本不受這些限制，一條巨尾就將三日月守控制的岩石打成了石粉。
「現在該怎麼辦啊！」
就在三日月守一籌莫展之際，明日奈出現在了哥莫拉行進方向的前方。
……
「哥莫拉，冷靜點！」大地看到哥莫拉被暗黑雷暴能量操控著，心中愈發焦急，便對著大猩猩喊道︰「喂，快讓我們回去！」
「回去後，你們要做什麼？」大猩猩轉頭看向了燒瓶中的艾克斯，眼中滿是嘲弄︰「要消滅哥莫拉嗎？」
「不是的，我要保護它！」
「保護它？」大猩猩將空戰馬斯凱迪發射梵頓光子炮，和三日月守操控著岩石的畫面放了出來︰「這就是保護嗎？」
「呵呵，哥莫拉可是怪獸！看到它四處破壞的樣子後，你真的還能和它共存嗎？」
大地使勁地搖頭，堅定地反駁道︰「這並不是真正的哥莫拉，哥莫拉被虛空怪獸格利扎用暗黑雷暴能量控制了！」
「你，是格利扎的幫凶嗎？」
大猩猩冷笑了一聲，用著一副看著愚蠢的人類的厭惡面孔對著大地︰「你們人類果然會這麼想！一旦發生不利于自己的事情，人類就會覺得是別人懷揣惡意而做的。這是你們一貫的做法！我才不會做這種事！」
……
哥莫拉的頭角光芒持續的閃爍，胸口的硬質甲殼也彌漫著橙色的光芒。
三日月守時刻盯著哥莫拉面對的方向，召喚出岩石牆壁來擋住哥莫拉的超振動波。
實在是哥莫拉釋放超振動波時的前兆過于明顯了，這就讓三日月守將哥莫拉的超振動波全部攔了下來。
但哪怕將超振動波全部攔了下來，墜落的岩石仍然對城市造成了不可估量的破壞。
「不行，沒辦法了！我下令消滅哥莫拉！」神木正太郎盯著受害的城市，忍痛下達了指令︰「隼人，使用金古橋卡片，用金古橋破壞炮消滅哥莫拉！」
虛擬金古橋卡片，是繼梵頓光子炮之後，博士的又一大力作。金古橋破壞炮的威力遠在梵頓光子炮之上，是能夠與艾克斯光線炮媲美的武器。
「明日奈使用奧特手槍支援隼人！」
明日奈站在了哥莫拉前進的路線上，對著終端機回答道︰「明白！」
「正在注入奧特英雄之力！」
「虛擬金古橋，正在載入！」
……
「不要啊！」大地看到了這一幕，撕心裂肺地哭喊道。
大猩猩冷笑著︰「這就是人類，嘴上說著共存，但是一旦遇到不利于自己的情況時，就會毫不猶豫地消滅對方！」
「人類是無法與其他物種共存的！而這樣的人類勢必走向滅亡！」