朱玫自兼左右神策十軍使，令蕭遘寫冊命襄王的文告。蕭遘婉言拒絕，于是朱玫讓兵部侍郎鄭昌圖撰冊那。再由李拜受，然後朝見百官。授鄭昌圖同平章事，調蕭遘為太子太保，蕭遘托疾辭官。朱玫奉李到京師，加封自己為侍中，大行封拜，藩鎮多半受封。
淮南節席使高駢，進爵中書令，充江淮鹽鐵轉運副使。淮南右都押牙和州刺史呂用之，升嶺南東道節度使，兩人很是喜歡，奉表勸進。唯獨鳳翔節度使李昌符，本來是和朱玫同謀奉立李。李已經受冊，朱玫自專大權。李昌符沒有得到任何好處，不免大為失望。于是通表行營，報稱朱玫擅立襄王，應加征討。于是僖宗升李昌符為檢校司徒，令他就近進攻朱玫。
田令孜因人心憤怒，自知不被眾人所容。因而舉薦樞密使楊復恭為左神策中尉，自任西川監軍，去依附陳敬暄。楊復恭排斥田令孜的黨羽，派王建出任利州刺史，晉暉為集州刺史，張造為表州刺史，李師泰為忠州刺史。一面與新任宰相孔緯、杜讓能等，共商還都事宜。忽然接報朱玫遣大將王行瑜，率兵五萬，進逼過來。已經佔住鳳翔，各道貢賦，都被截斷，轉運長安去了。
僖宗居在興元，從官衛士，卻也不少。此次運道不通，上下頓時驚惶。杜讓能獻議，說道︰「從前楊復光與王重榮，同破黃巢，極為親善。楊復恭是楊復光兄長，如果讓楊復恭致書王重榮，曉以大義，想必王重榮能回心轉意。王重榮既來，李克用也會服從，誅逆就不難了。」僖宗于是頒敕慰勞王重榮，並附上楊復恭書信，遣使前往河中。
王重榮果然听命，獻絹十萬匹，願討朱玫贖罪。使者回報僖宗，僖宗再想慰勞李克用，可巧李克用也上表僖宗，願討伐朱玫以及襄王李。原來李也賜書至晉陽，通知李克用，說自己由藩鎮推戴，受冊繼位。李克用大怒，毀來書，囚來使，上表請求進討。僖宗又詔令扈駕都將楊守亮，率兵二萬出金州，會同王重榮、李克用，共討朱玫。
朱玫部將王行瑜自鳳州進拔興州，勢如破竹，僖宗急命神策都將李茂貞等，出兵抵御。李茂貞頗有能力，與王行瑜交戰數次，連得勝仗，奪回興州。楊復恭又發檄關中，說能得朱玫首級者，立賞封靜難節度使。王行瑜被李茂貞所敗，正在惶急。
忽聞檄文中的獎賞，王行瑜不禁轉憂為喜，和部眾們商議，說道︰「今無功回去，也是一死。死也無益，不如和你們一起斬了朱玫首級，安定京城，迎回帝駕，取得邠寧節鉞，不是絕好的機會嗎？」眾人欣然同意，于是引兵返回長安。
朱玫剛立李為帝，改元建貞，攬權行事。听說王行瑜擅自回來，即召他入問。王行瑜率眾直入，朱玫怒目相視，喝道︰「你擅自回京，想要造反？」王行瑜厲聲答道︰「我不造反，特來誅殺反賊。」說完，麾眾向前，將朱玫擒住，立刻斬首，並殺朱玫同黨百余人，京城大亂。