首先，美軍封鎖了巴拿馬通往哥斯達黎加等鄰國的主要通道，切斷諾列加由陸路潛往國外的退路。
第二，包圍或暗中監視尼加拉瓜、古巴、利比亞、秘魯等國駐巴使館，防止諾列加溜進這些使館，尋求政治避難。
第三，將經過專門訓練的第7步兵師以及第82空降師的部分部隊，從城市移到鄉村，配合駐巴美軍的搜捕行動。
第四，從本土緊急抽調高級電子偵察機赴巴，從空中協助地面部隊捕捉諾列加的行蹤。這種電子偵察機性能先進，只要諾列加用電台同巴軍或國外聯絡，哪怕功率再小，也逃不過它的信號接收器。
但是，曾在美陸軍泛美軍事學院受過訓的諾列加，既不使用電台，也不隨大部隊活動，而是與他的衛隊長一起躲在隱蔽處，通過"耳目"模清美軍動向，再采取相應對策。
24日下午，精疲力竭的諾列加听說他的心月復、奇里基省的巴軍司令路易斯•德爾•西德已向美軍投降，頓時心情沮喪，失去了全部信心。
在兩名保鏢的陪同下，他駕車來到"女乃場皇後"冰淇淋商店，撥通了梵蒂岡大使館的電話，向塞瓦斯蒂安•拉沃亞大使請求政治避難。
不久，一輛梵蒂岡使館的轎車到冰淇淋商店接回了諾列加。諾列加進入梵蒂岡使館後，即交出了自己的武器，隨後一直呆在一間小屋里，不得隨便與外人接觸。
華盛頓五角大樓作戰室里，國防部長切尼、參謀長聯席會議主席鮑威爾將軍和趙繼統通宵坐鎮。軍方當晚宣布，「關鍵軍事目標已經實現，有組織的抵抗已被粉碎」。
但同時承認，整個局勢「既未完全控制，也未失去控制」。
從巴拿馬傳來的消息說，在巴拿馬城和第二大城市科隆雙方仍在交火。忠于諾列加的軍隊在首都城外「瑪麗奧特」飯店扣押了40余名美國人質。
一天之內巴方軍人和平民至少100人喪生，1000余人受傷。
諾列加的去向是個謎。晚8時左右，就在巴國家廣播電台被火箭擊毀前，廣播中傳出諾本人不到1分鐘的簡短講話。
他以平靜的語氣說，「這里是曼紐埃爾•安東尼奧•諾列加……我向國防軍、全體巴拿馬人致敬！我們絕不後退一步，必須抵抗，前進直到勝利……」
美軍方已懸賞100萬美元活捉諾本人。鮑威爾將軍下令美軍挨家挨戶搜尋諾列加的下落。諾列加躲進梵蒂岡使館的消息傳出後，美軍旋即派出500多名士兵和10多輛裝甲車以及直升機包圍了梵蒂岡大使館，並要求梵蒂岡大使交出諾列加。
美軍的要求被拒絕後，美國開始向羅馬教皇施加壓力。與此同時，美軍特種作戰部隊在梵蒂岡使館外架起高音喇叭，並開始向諾列加展開心理戰。
使館外，10多輛裝甲車把使館團團包圍，直升機在空中盤旋，高音喇叭在狂吼，數千名巴拿馬人在舉行游行示威，要求把諾列加交給他們。
"諾列加滾下台，不要獨裁分子"的新聞，在反復地播放，幾乎是在呼喊。一首名為"無處可逃"的樂曲直對著諾列加住的小屋。
這種世界軍事史上絕無僅有的音樂"攻心戰"是美國人的獨創。
使館內，美軍南方司令部司令瑟曼和美國官員同梵蒂岡官員緊張地進行了一輪又一輪談判。在美軍的心理戰攻勢下，諾列加身心受到巨大打擊，惶惶不可終日，只能祈求上帝保佑。
他原以為羅馬教皇能保佑他逢凶化吉，但卻萬萬沒想到，梵蒂岡最後終于屈服于美國的壓力，改變了初衷，于1月3日向他下了最後通牒，要他必須在1990年1月4日中午之前離開使館，向美軍投降，否則便請巴拿馬新政 府來人把他帶走。
在美、巴、梵三方的種種壓力下，諾列加被迫作出了"自願投降"的選擇。
1990年1月3日晚8點48分，美軍駐巴陸軍司令馬克•西斯內羅斯少將接受了諾列加的投降。
守候在此的海豹突擊隊隊員給他戴上了手銬，將他帶上"黑鷹"直升機送往霍華德空軍基地。
隨後，諾列加被美國司法部緝毒署逮捕。次日上午9點半，布什總統發布了諾列加投降的消息，並宣布巴拿馬問題已得到基本解決。
"正義事業"行動就此正式結束。隨後，諾列加被帶上"黑鷹"直升機飛往霍華德空軍基地。
從那里，他被送往美國佛羅里達州邁阿密法院。至此，巴拿馬的頭號人物變成了邁阿密聯邦法院的第41586號囚犯。
1992年諾列加被邁阿密法庭判處40年有期徒刑，又改判為17年，諾列加在2007年9月9日出獄。
2010年諾列加被引渡至法國，判處7年有期徒刑。
2017年5月29日，曼努埃爾•安東尼奧•諾列加在醫院過世，享年83歲。
美軍侵巴作戰歷時15天(不包括撤軍階段)，美巴雙方都遭受了不同程度的損失。
美軍亡23人，傷324人;毀直升機4架，傷41架;傷運輸機14架。美軍繳獲巴拿馬軍用車39輛、飛機(包括民用)36架，巡邏艇7艘，各種小型武器76500余件。
巴軍亡314人，傷124人，被俘2969人。巴民兵與平民死亡約400人，傷約2000人。巴拿馬遭受的直接經濟損失達20~25億美元。
美軍在侵巴作戰行動中，以較小的代價，順利地達成了其侵巴作戰目標，實現了美國國家戰略目的。
首先，美軍在10多個小時內摧毀了巴國防軍和諾列加政權，使美國可以隨心所欲地行使巴拿馬運河條約的"權利與義務"而不受任何威脅。
其次，美國扶植了吉列爾莫•恩達拉新政權。1989年12月20日凌晨美軍侵巴行動開始後，恩達拉便宣誓就任巴拿馬總統，里卡多•阿里亞斯和吉列爾莫•福特就任副總統。美國政 府馬上宣布承認恩達拉新政權，支持"自由選舉的巴拿馬政 府進行統治"。
第三，建立了支持恩達拉新政 府的公共安全部隊。