朱由棟知道在王進財的心里，皇權是根深蒂固的。見王進財一直糾纏這些，立即轉移話題道︰「王老來找我有什麼事？」王進財這才罷休，道︰「你回來這些日子，我一直在整理我們的賬務。今天好不容易給整理出來了，就拿來給侯爺你看看。」
朱由棟讓人將賬目放在桌上，笑道︰「王老經手的事，還有什麼可說的。我相信王老不會騙我，你老說個數就好了。」王進財道︰「侯爺還是好好看看吧，老頭子我本事也沒有，一些賬目我是記都記不住。現在就記住了最後一個數，我們結余的錢倒是不少，有銀一百萬兩，金四十萬兩。」
朱由棟一听，頓時大吃一驚，復明軍如今根本就沒有其他什麼收入。現在各地的稅收，也還沒有開始征收。所有的錢糧都靠向清軍繳獲，或者是在各地官府，和投靠清廷，並且死心塌地幫助清軍的一些士紳家里抄來的。
所以復明軍的糧草一直很緊張，朱由棟也時常發愁。現在突然听見王進財說有大量的錢財，朱由棟有些不信的問道︰「怎麼有這麼多？」
王進財道︰「其實這也不算多，我們從清軍那里繳獲的，還有各地府庫里的存銀都在這里了。由于戰亂，大家都只想要糧食，就算是我們發了銀兩出去，營里的將士們也不會存留。我們這邊軍餉和錢財剛發下去，所有人隨後就來換成糧食，出去的錢就又會來了。」
由于復明軍的軍隊擴充太過迅速，所以糧食一直都緊缺。之前朱由棟為了統一管理糧食，最大限度的控制糧食。也方便將士購買，不讓其他糧商抬高糧價。讓林壯在各地，都開設了軍隊專營糧店。專供退伍士兵和家屬購買，也方便林壯的情報系統發展。
朱由棟一听道︰「也就是說我們發出去的軍餉，繞一圈就又回來了？那這銀子不就根本沒用了，士兵們拿了銀子就去換糧食。」朱由棟突然有個想法，就是徹底的廢除金銀錢幣，該用紙幣，這樣也讓軍隊的輜重和後勤減少很多。
朱由棟正要詳細的說說想法，林阿三就帶著幾個郎中進來了。朱由棟一見，便對王進財道︰「王老先等一下，我這邊先處理點事。」然後對林阿三道︰「你找的這幾人是醫術最高明的嗎？」
林阿三頓時道︰「回侯爺，他們都是城里醫術最好的大夫，不知道侯爺有什麼不適？」林阿三還以為是朱由棟生了病，所以急著要找最好的郎中。
朱由棟道︰「沒有什麼不適的。」然後對著幾位大夫道︰「今天找你們來，是有件事讓你們去做，你們中有擅長婦科的嗎？」
听見朱由棟的話，林阿三頓時一愣，朱由棟怎麼還看婦科病了。左邊一老頭道︰「回侯爺的話，老朽來是德濟堂的杜德鴻，老朽就擅長婦科，不知道侯爺要為哪位夫人治病？」
朱由棟道︰「我這里沒有人生病，我是想讓杜老醫天下人。」所有的人都愣住了，看著顫顫巍巍的杜德鴻，這麼也不想是能醫治幾個人的模樣。朱由棟居然要讓他去醫治天下人，這不是找開心，逗人玩嗎？
杜德鴻也是一愣，想朱由棟問道︰「老朽不明白侯爺說的這個醫天下人，什麼意思，還請侯爺明示。只要是老朽能做的，老朽一定盡力而為。」
朱由棟道︰「如今天下，由于戰亂，大量人口減少，加上清軍四處屠城，天下百姓更是所剩無幾，我想鼓勵百姓生育人口。」
王進財道︰「這是好事啊，侯爺監國後，就能有如此仁政，可謂是百姓之福。」朱由棟道︰「那里是福，如今百姓家徒四壁，就是多生育人口也不一定養活的了。何況這生育孩子對于婦人來說，就是進鬼門關的事。」
杜德鴻道︰「侯爺說的是，但是侯爺找我們來也沒用。這婦人生育我們可控制不了。」朱由棟這才想起，看婦科的大夫和女人生產是兩回事。朱由棟一拍額頭道︰「我這是昏頭了。」
然後對著杜德鴻道︰「沒事，反正也要來找你們的，就是想讓你對婦人的生產年齡做一個統計。然後對婦人生產過程中，那個年齡出現意外的情況多，那些年齡適合生產做出判斷，然後推廣到民間，減少百姓中婦女生產時的死亡。」
杜德鴻道︰「這個我到是能去做，但是就我一個人也做不來，就算能做出來也推廣不出去，人們也不相信啊。」
朱由棟道︰「沒關系，我讓林阿三帶著你們做，然後讓復明軍，讓官府來推廣。」杜德鴻道︰「那這樣應該沒有問題了。」
朱由棟又對其他幾個大夫道︰「你們都擅長什麼科的？」其他四人依次介紹自己，有一人是軍中的郎中，另外三人是重慶本地的幾個大藥房的大夫，都各有擅長。
朱由棟听完後，道︰「好。」然後指著一位擅長兒科的大夫道︰「你叫萬正平，擅長兒科。」萬正平忙答道︰「是的，侯爺。」
朱由棟道︰「你要去統計一些養育兒童需要注意的事項，還有兒童常患那些病癥，然後需要怎麼防治，將這些整理出來，也讓官府來推廣。這樣我們的人口才能快速的恢復，百姓也才能快速的增多。」
萬正平听了，道︰「侯爺，這事做是可以做，但這每一樣，都不是我們一個人能做出來的啊。」其他幾人見朱由棟每說一件事，都不是輕易能做出來的。
根本就不是向以往的那些將軍，只要些錢糧就算了，而是讓他們長期的去做這些事。雖說做成了，肯定是萬古留名。但是這需要消耗的錢糧，也是不可估量的，當下所有人都有些不願意了。
杜德鴻道︰「侯爺，不是老朽們不願意去做這些事，也不我們不願意拯救蒼生。但是這些事一做下來，可就不是幾天，或者一年時間能完成的，所耗的錢糧也不是哪一家能承擔的。」
其他幾人也都紛紛附和，朱由棟想了一下也確實不行。但是現在讓復明軍全部拿錢出來推行，估計也承受不了。
朱由棟看著幾人，突然道︰「要不大家把幾家藥鋪全部合在一起，然後讓官府來給你們推廣。」朱由棟這邊說著，就見幾人面露難色。只是在朱由棟面前，不好表現的太過明顯。
林阿三道︰「侯爺，這各家都有各自的藥方，都是獨家經營，不對外出售的。如果大家合在一起，到時這藥方泄露，這損失可就大了。」
朱由棟這才想到，這個年代，大家都抱著自己的秘方不肯松手。朱由棟道︰「要不這樣，我們將幾家藥房合並，然後各家分股。最後將經營所得利潤按股份分成，你們看怎麼樣？」
朱由棟見眾人還是不願意，朱由棟道︰「至于各家的藥方，我看這樣，我們再成立一個專項得利司。這個專利司，不做經營，只負責登記各項所長。凡他人需要用到這些所長的，就需要交納使用費。由
專利司收取，然後返回給專長所有者。」
杜德鴻道︰「侯爺，那這個使用費怎麼收取呢？」朱由棟道︰「我看就按使用者的收入，然後百中取一。由專利司收取後，按七成返回給所有者。」
杜德鴻等人立即就開始籌算，過了一會，杜德鴻道︰「但是我們怎麼知道使用者賣了多少錢？這也無從查起啊，何況專利司就佔有三成，這也太高了。」
朱由棟道︰「你不要認為這三成多，你想想，一旦你們的藥大量入市。難道不會有人仿制，專利司的人是要負責去打擊這些仿制的人。」
听朱由棟這麼一說，杜德鴻才明白過來，道︰「可以，合並的藥房各方股份該怎麼分呢？」朱由棟道︰「我佔兩成，你們五家各家佔一成，朝廷佔兩成，書院佔一成。」
听見朱由棟居然只給各家一成股份，當即幾人就有些慌了，心里也十分舍不得。朱由棟道︰「你們先不要急著反對，你們想想，我不佔兩成，你們的藥房要是大了，各方官吏，你們對付的過來嗎？」
朱由棟讓他想了一下，才道︰「何況官府要宣傳你的藥方，和你們做出來預防、治療的方法，也是需要人員去配合的。至于書院，他們學了你們的東西，以後能不用你的藥嗎？這怎麼算你們都是不虧的。」
杜德鴻道︰「可是這一成，也太少了。」朱由棟道︰「你現在覺得少，那是因為你們現在伙計掌櫃都是自己請的，而且大家都在重慶一個地方。但是一旦合並，一個地方只需要一套班子，就你們幾家的人，可以在五個州府開藥店，你覺得還少嗎？」
對于朱由棟的說法，幾人也不敢全信，但是朱由棟可不只是跟他們商量，朱由棟現在是給他們股份。要是惹怒了朱由棟，直接讓軍隊抄了幾人的家，一樣能拿走藥方，那樣他們可就什麼都沒有了。
幾人對望一眼，只好答應了。朱由棟見幾人答應，便道︰「好，既然你們都同意了，那以後這合並的藥房，就叫惠民醫局。」
杜德鴻道︰「惠民醫局？侯爺要真是這樣，我們還拿什麼去賺錢啊。」朱由棟笑了笑道︰「你還怕賺不了錢啊，這惠民醫局到時候，怕你數錢都數不過來。」
杜德鴻等人都不相信，朱由棟道︰「這平常百姓常得的病，我們可以把藥便宜點，甚至直接制出一些藥丸，藥膏什麼的。這些藥治的都是一些平常的病，便宜一些沒什麼。」
朱由棟走到幾人面前，道︰「但是那些有錢的士紳家，他們誰會得這些便宜病呢？我們再弄一些養生，延年益壽的出來。這些藥才是那些有錢人用的，當然就貴一些。那里會不賺錢，如果就算不賺錢，你們也不用怕，難道我還會差你一份俸祿嗎？」
當即朱由棟又封幾人做了醫官，然後讓林阿三帶著他們，組建一個醫藥局。當然這些人都掛職在醫藥局，還讓林阿三再找一些穩婆來，對婦女生產該注意的事項進行整理。
這女人生孩子的事，在古時候可是不吉利的事，林阿三一听讓自己去做這些事，頓時就有些抵觸。但是朱由棟跟不理，讓林阿三必須去，還說要是不去，就直接蹲大牢去。在朱由棟的威脅下，林阿三不得不答應。
就這樣，大明的第一個醫藥衛生部門算是建立起來了。朱由棟一想，似乎把專利局和第一家公司也給成立了。