因為人民黨軍事委員會已經在很大程度上代替了蔣百里的總參議職責，沒有了張作霖頭號參謀的這個頭餃，蔣百里光靠一個已經被總裝備部取代很大職權的國防科工委主任的職務難免讓他幾乎被架空。
幾方人馬雲集華東後，沒有一個得力的人鎮住局面是不行的。蔣百里的職務、級別和威望足夠，張氏父子都屬意他。而人民軍的軍事戰略已經基本成型，所以一心想學有所用的蔣百里被臨時調崗，來一次理論聯系實踐。
南京本來是易守難攻之地，但當蘇錫常相繼失守後，惟恐「黯然金陵城下」的齊燮元還是決定放棄這座東南重鎮，趁著滬寧線還沒被控制之前逃離。
在隨後一路狂奔至上海後，這位「斜眼司令」又覺得上海也不安全。不得已，他逃到了日租界，後來又逃往日本。
捷報傳來，張漢卿「詩」興大發，于當賦詩一首，題目即是《七律﹒人民軍佔領南京》︰
鐘山風雨起蒼黃，百萬雄師過大江。
虎踞龍盤今勝昔，天翻地覆慨而慷。
宜將剩勇追窮寇，不可沽名學霸王。
天若有情天亦老，人間正道是滄桑。
這一仗打得是痛快，但也發生了很不好的情況，那就是齊燮元的敗兵潰退後，在南京造成了暴力排外事件，險些造成中外沖突。11月25日晚，未過江的部分齊軍潰兵在南京城內進行搶劫活動，但除兩名正在街上行走的外國人及兩座已撤空的外僑住宅外，齊軍並未襲擊其它外國目標。
人民軍先頭部隊開入南京城，沿途鳴槍搜索，並向駐南京的各國領事館詢問有無戰犯藏匿其中。得到否定答復後，這些部隊即平靜離開外國領事館。
但次日從上午8時許起，南京城內突然爆發大規模的搶劫外國人的排外風潮，一直持續到下午5時。南京城內和下關的外國領事館、教堂、學校、商社、醫院、外僑住宅均遭到侵犯和洗劫。不久後，這一浪潮轉移到上海。
新生的奉軍政權還需要得到列強的承認，節節勝利的人民軍不允許節外生枝。在獲悉暴亂發生，張漢卿即下令渡江各軍立即擔負維護地方治安之責，對頑固不冥者從重從快處理︰
「在此關鍵時期，悉得軍管。若有乘機擾亂社會治安、危害百姓生命及生存之舉動，及妨礙各國友人之正常生活之行為，即以當場槍決，勿得置疑！」
對齊燮元之第六師，人民軍也作了大量宣傳，要求各級「反正」軍官務須約束手下，平安度過此一時期，戴罪立功。當天南京城即槍斃上百名潰兵，省城治安逐漸恢復。
就在這個時候，長江上傳來一連聲沉悶的聲響，誰也無法預料的事情發生了。
原來因為亂兵迭起，駐扎在長江上的英美軍艦在未作任何警告的情況下，即以護僑為理由，對南京進行了炮擊。這既是一種武力的炫耀，也是對奉系打敗直系後的一次試探︰在人民黨即將在事實上統一中國的大勢下，他對英美國的態度究竟是如何？
這個事一下子被放大，段祺瑞、孫逸仙等甚至包括下野的直系骨干都在看奉系如何做。
不能討回公道，人民軍可以直接被定性為內戰內行的窮兵黷武之輩；向英美施壓，能不能有效果不說，張漢卿為首的一幫親美派不說要和美國締結友好關系的嗎？他敢嗎？
踫到這個事，要是往屆政|府，只能自嘆流年不利。中國人和外國打交道，只有吃虧上當沒有佔便宜的份，從無例外。
不少人都認為此時該忍，這年頭列強在中國帶來的侮辱已經夠多了，個把條人命根本就不在話下。
接到前線的報告，張漢卿心里的那根久未撥動的弦開始起了波瀾。國家孱弱，于小民何？當年中國韜光養晦，仍然免不了有銀河號事件、有南斯拉夫大使館被炸的屈辱，這一幕與之何其之相同？
他下令進行強烈的譴責，指出炮擊南京「為萬國公法、為文明國通例所嚴禁」，一方面緊急派人與航行在長江上的兩國軍艦交涉，一方面安排對所受損失進行評估和救援。
說是交涉，也無非是表明立場，在南京城各沿江口岸豎起人民軍的大旗。對于英美軍艦如果擴大挑釁該怎麼辦，奉系內部沒有一個明確的決心，很多人擔心好不容易獲得如此良好形勢，不宜在此時節外生枝。
因為多年來的強硬，奉系已經深深得罪了日本，如果英美再有不滿，奉系的外部形勢便很不妙。
本來的局勢是日本人挺奉，英美人挺直。經過張漢卿的乾坤大挪移，變成了日本人向直系伸橄欖枝，從吳佩孚的軍事顧問都是日本現役軍官可知。
而美國對奉卻逐漸友好，從直奉大戰前對曹錕的總統之職不予置評到大戰時的置身事外可知。
這是一種無法言語的悲憤，退一步海闊天空，進一步則極有可能在其後統一中國的步伐中得到列強的干涉。不用說英美直接介入，就是默認日本對華激進就大大不妙。
真是一個艱難的選擇，張漢卿決定忍，但不是無節制的忍，適當的聲音要表達出來。他召見英國駐華總領事巴頓（非美國後來有名的巴頓將軍），氣勢逼人地問︰
「人民軍打過長江去行使護國救民的職責，南京發生的這起騷亂，正是無政|府狀態下亂兵騷民的典型！不但各國僑民都有損失，我國居民亦深受其害。
值此動亂之秋，英國政|府更要協助我軍盡快打敗割據力量，以行使中央權力，達到穩定的目的，我想這是雙方政|府都想看到的。英國兵艦悍然炮擊平民，是體現其勇敢的嗎？！」
他沒有直接抗議英國軍艦的暴行，只是用諷刺和質疑想讓英國人收斂些，不然再發生同類的事情不實施些對應措施就讓虎視眈眈的異見分子有造謠生事的余地。只要英國人服軟，哪怕是口頭上的道歉他都自信可以體面收場。
可是他根本想不到英國人的態度。事件發生後，英國報紙均認為南京事件「（人民）黨軍應負其責，南京所發生之事項，系為預定之計劃。」
《字林西報》是英國人在中國出版的歷史最久的英文報紙，撰文說這是人民軍故意用此事件著意體現出來的一種政治狡黠，意圖模清英美人的底牌雲雲。這種說法也讓英國總領事對此事件抱有個人的成見，他對人民黨如此激烈的回應有些「困惑」。
「少帥先生，據我的理解，保護英國僑民的生命和財產安全，這是長江巡邏隊應有的職責。我不知道貴國政|府為什麼對這件事的反應如此激烈？貴國的軍隊首先對平民開火，我們只是自衛！重申一句，我們只是自衛！
不但如此，我們還要向中國政|府提出嚴重抗議，你們惘視我們僑民的利益和安全，不能夠行使保衛職責，我們的損失也要你們來償付！」
不但沒有一句好話，還倒打一耙，軍艦殺了人，竟然還要讓人民軍來償付損失！張漢卿很憤怒，但也只是憤怒而已——一切都以實力為後盾。他終于體會到袁大總統對日本二十一條的反應是忍，要「埋頭十年與日本抬頭相見」了，他也終于明白，後世的中國政|府為什麼多抗議而少行動了，非不敢耳，時不對也！
面對這樣一個對手，先前的所有勝利都是微不足道的︰建立了民國最強的陸軍、海軍和空軍，打敗了直系，籌建了中央集權的政|府，比正史強大多的經濟力量和工業能力…只要中國人民的恥辱不日不雪，中國的真正勝利就沒有到來，他的肩上的重擔就一日不能卸下！
「難道說聲抱歉有如此之難嗎！領事先生？讓我們打開窗戶，還原事實的真相！是英國的軍艦、在中國的長江上、炮擊中國的城市、造成中國民眾的傷亡！禍首不是人民軍、不是南京城里無辜的市民而是被你們一直支持的直系亂兵！八十多年前，你們就憑這樣的辦法嚇倒了當時的晚清政|府，現在，你們又想憑借這樣的辦法來體現英國在華的優越性？時過境遷了！」
覺得語氣有些硬了（唉，這個苦逼的年代，有些話不吐不快啊！），張漢卿的語調從激昂轉到沉穩︰「英國政|府既然承認中華民國是合法的政|府，就要保證它的合法地位和合法行使國家權力，對它的子民的傷害，一定要有一個公平的說法，我的要求不過分吧？領事先生！
如果英國政|府是這種態度，我是不是可以這樣理解為，英國政|府仍然堅持著扶持直系的方針不變，要與人民黨政|府敵對？在人民軍過江之際有這種行為，作為人民軍的負責人，我必須有此懷疑！」
他已經改變策略，現在舉國上下都在看人民黨對此事的反應，以目前的形勢，不可能指望得到英國立場的軟化，畢竟驢死不倒架，人家也是有「尊嚴 」的。他又沒有過多的牌可打，只能把事件引向英國政|府對華各派系的立場上來。
炮擊南京，就是為直系撐腰，因為正值這種敏感時刻。張漢卿故意這樣理解，通過這種方式來表達對英國支持直系的不滿，讓巴頓理解為人民黨、人民軍的憤怒來源于此。