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「總督先生，我們大明皇上十分仁慈，不然你們只怕已經葬身火海了。」戚宏亮倒也毫不客氣。
「謝謝皇帝陛下，謝謝大明。我們西班牙人願意合作，希望大明皇帝陛下網開一面。」
「別在這里匪患，帶我們去你的總督府。叫你們的把戰斗武器全部繳上來再說。「
「那是，那是。」這卡西利亞斯連忙下令周圍的人向龍康仔的人上繳武器，自己則帶著朱顯波一行來到總督府。朱顯波臉色一沉，示意戚宏亮繼續施壓。戚宏亮當然明白皇上的意思。
「我大明的仁慈，你們西班牙人也看到了，但是你們幾次殺戮我們華人，動則成千上萬，這個做何解釋。」
「我們錯了，我們願意承擔。」
「那好吧，拿出你們的誠意來。這馬尼拉你們肯定呆不成了，馬六甲也是葡萄牙人的了。」
「大明對我們的處境也十分了解，我也不瞞閣下了。我們西班牙確實面臨諸多挑戰。以前是我們做的不好，我們願意賠償。另外我們希望與大明合作。共同對付我們共同的敵人荷蘭和英格蘭。你們看如何？」
這個總督確實很聰明，不愧是殖民多年的政治家。不先說其他的事情，上來先結盟，結盟成功了大明也就不好意思獅子大口了。不過朱顯波喜歡跟聰明人打交道，這個總督要是不聰明，自己的艦隊也要死不少人，估計這馬尼拉港口也要被轟得不成樣子。但是不管怎麼談，先是西班牙人無條件投降。
「總督先生，我們大明是禮儀之邦。所以你放心，只要雙方有誠意，一切都好談，但是眼下你們西班牙人的軍士必須盡快集中，並上繳全部武器，所有的貴重物品必須交給大明保管。等我們雙方達成協議，該歸還的一定歸還。」朱顯波給卡西利亞斯留了一條縫。
「謝謝皇帝陛下，我們一定遵照你的旨意。關于結盟的事情請你們考慮下。有什麼條件盡管提，我會盡快請示國王。」
「我們的條件嘛……鑒于你們在馬尼拉以前的所作所為，加上馬尼拉華人已經佔絕對優勢。因此大明必須全權控制馬尼拉和周邊地區。你們西班牙可以在馬尼拉繼續設置辦事處，仿效澳門。但必須接受大明的管理和約束。大明可以幫助西班牙在東亞那或者印度洋建立另外的基地。作為盟友將來可以考慮共同進軍印度洋，至于詳細的軍事協議可以慢慢再商量。」
「那西班牙在貿易所的佔成呢？」
「為了表示誠意，允許西班牙商船進港，但總的交易所份額不得超過百分之十。」
「謝皇帝陛下，我會盡力說服國王。」
雙方第一輪談判基本上還算順利，不過這是基于大明已經完全控制了馬尼拉的事實。本來朱顯波可以將西班牙人全部趕出，或者趕盡殺絕。但是總督卡西利亞斯的話提醒了他。畢竟自己的海上勢力還只是徘徊在東南亞，而西班牙的足跡遍及全世界。雖然現在受到多國挑戰。所謂白組織中死而不僵。假如能借助西班牙的力量順利進入印度洋、波斯灣也是一樁不錯的買賣。
當然這些是後話，眼下朱顯波要的是如何處理滯留在馬尼拉的西班牙人，也許將他們作為人質和西班牙人好好談判是個不錯的選擇，但又怕夜長夢多，而且不能將整個西方列為自己的敵人，不然自己的海洋稱霸之路在進入印度洋之後只怕寸步難行。
由于西班牙人的配合，龍康仔很快在馬尼拉戒嚴，並將駐扎在西班牙的三千多軍隊武器全部收繳，另外穆友前從海港準備逃跑的穿上發現數箱黃金和數十箱白銀，以及大量豆蔻。這些當然成為了戰利品。
經過幾天的交涉，卡西利亞斯在未經請示西班牙國王的情況下答應與大明簽訂合作協議。對于馬尼拉之戰和以前西班牙屠殺華人的事實，西班牙賠償大明金幣五萬枚，白銀一噸。賠款抵達之日，大明釋放全部在馬尼拉的西班牙軍士。大明承諾允許西班牙人在馬尼拉設置辦事處和外交使節。允許西班牙商船停靠，但貿易最高上限不得超過馬尼啦交易所的百分之，作為交換，在大明商船進入美洲後可以任意選擇一個西班牙佔領的港口，大明分享交易所百分之十的份額。
雙方原則上承諾共同對付共同的敵人荷蘭、英格蘭及葡萄牙。將來大明在取得馬六甲的實際控制權後，西班牙享有和馬尼拉港口同樣的權益，作為交換，大明可以選在在西非或者印度洋任一西班牙佔領的港口*交換同等權益。兩國在各自佔領和管轄海域給予對方盟友的優先通行權，戰斗支援等等。
這樣一個協議說實在的，除了黃金白銀外，其他的都比較虛，也完全依靠世界形勢和戰局的發展，但是簽約的雙方都明白各自的處境，目前西班牙在美洲有優勢，大明在東亞，東南亞佔主動。而兩國都想染指的印度洋、波斯灣和非洲，要麼是苦于無法進入，要麼是陸續被人趕走，站在這個角度上兩個的合作前景還是比較可觀的。最主要的是西班牙殖民多年，未曾帶走的財寶已經落入朱顯波的口袋，逝者已往矣。朱顯波不能為了幾個死人不要財寶，徹底得罪西班牙人。
卡西利亞斯要做的就是保全自己和手下幾千人的性命。只要將這些人安全帶回去就是大功一件。至于其他的協議，國王認可最好，不認可，兩國只怕是都輸得結果。
不久棉蘭老島的伊斯蘭族人也派使節來到了馬尼拉，本來這些人是答應大明合圍馬尼拉的，朱顯波左等他們不來，右等不來，還好不是靠他們為主。這些地方部落雖然更加憎恨西班牙人，但也是出了命的牆頭草。如今大明將西班牙人收拾干淨了。也不敢再提其他事情，等于默認了大明在馬尼拉的統治。不過大明並未承認棉蘭老島的獨立，所以派使節前來問問大明的態度。
朱顯波也知道伊斯蘭人的難纏，何況南邊和呂宋島不一樣，這北面主要以華人為主。歸大明統治難度不大。南部主要以穆斯林為主，想要完全征服只怕是很困難。于是提出只要承認馬尼拉的大明統治事實，並仿效爪哇等國按期納貢，即可保全勢力範圍。這當然是他們所希望的。
這樣一來，整個菲律賓群島，南北出現了兩個截然不同的政權，其他島嶼因為分散沒有形成統一的管轄，這是後話，朱顯波也知道一口不能吃個胖子，另外如果大明沒精力統治，最好這些島嶼一個島一個政權，這對大明是有益的。當然，朱顯波也不敢掉以輕心，將來的馬尼拉總督必須時刻關照這些小島嶼才行。
協議談妥，朱顯波讓龍康仔暫時留在馬尼拉，讓其在穩固馬尼拉的統治同時，也要關注棉蘭老島和其他菲律賓島嶼上的各個部族。並派人將停靠東面的艦隊繞道開進馬尼拉，自己則準備和戚宏亮等繼續難行。黃金白銀、豆蔻等貴重物品等貿易船經過擇日運往杭州。朱顯波也已囑咐龍康仔優待卡西利亞斯總督，並贈予其黃金五千，向他多闡述大明的立場，並希望太回國後多多運作，爭取早日實現明西真正的同盟。
而在戰斗中受傷的水兵，朱顯波下令醫療隊必須盡心盡力，這個時候馬尼拉一個女巫說自己想回馬六甲，但是沒錢，希望能以替大明將士治病抵消回家的費用。朱顯波也沒加考慮，讓其同行，船隊稍作休整即將開往雅加達。畢竟自己對爪哇也不是很熟，多個本地人管他是女巫還是女妖，只要不造反就行，當然一個女巫想在一群荷槍實彈的男人這種造反也是比登天還難。