葉三經過一番思考，最終還是讓穆家政來負責情報工作，雖然這個工作在孤島上還不是很重要。
葉三這次到遼東視察，成功地把一小部分西大營的官兵駐扎在了孤島，建立了一塊根據地和秘密的兵工廠。從京師出來不久，葉三就給京師的人寫了三封信，一封給唐甜，讓她管理好後宮，不要出現差池。一封給了楊秋遲，讓他密切關注朝廷的動向，有官員稍有風吹草動，就就地拿下。還有一封給了內閣的王翱，讓他協助黃啟忠治理好軍隊，隨時听候他的調遣，他要在遼東掀起滔天風浪。
西大營在孤島上絕對不能再用西大營的番號，為了不引起女真人的注意，葉三給西大營另起了一個名稱——海盜。為了陪襯海盜出沒，葉三還做了一面海盜旗，那是一面黑旗，上面兩根白色交叉的大腿骨，托起一顆人的骷髏頭。夠俗的，簡直俗不可耐。
西大營的官兵滿懷欣喜地仰望著他們的海盜旗，人人都知道他們從此就要在這面海盜軍旗下奮戰了。葉三站在遠處觀賞著自己的得意之作，海盜旗就如同他的士兵一樣，他的胸中也被莫名的斗志充滿︰「這就是我的旗幟，一定要讓女真人在這面海盜旗下聞風喪膽。」不過只有兩千西大營精銳的葉三暫時也就是想想而已。
成化六年六月初，孤島上的海盜第一次出動，就收割完了遼東半島周邊成熟的麥子。收割完了糧食，隨著葉三一聲令下，孤島海盜軍團終于要釋放積聚了幾個月的攻擊能量，開始在遼東女真月復地，展開新一輪的戰略反攻。
穆家政和谷有穗還真被葉三任命為把總，葉三在任命他二人時發火，主要還是因為嫡系部下企圖質疑他的決定。如果就事論事，葉三也認為這兩人的資歷太淺，還有待考驗，畢竟他們跟隨自己的時間太短，部下還沒有對他二人消化吸收。
此時在遼海千里海岸上，明軍各督司都在竭力生產物資，擴充兵員。遼東經略經韓雍經過一番斟酌思量，認為經過這段時間的休養生息，遼東明軍已經重新具有了進攻的能力，幾次出擊就迫使女真人放棄了很多堡壘。
「大人，韓軍門又大舉出兵了。」馬文升意氣風發地道。這一個多月來明軍在一些小的戰役上，連戰連勝，讓孤島上的海盜士氣大振︰「大人，我們也應該出島殺敵，奪取戰功！」馬文升極力主張海盜軍團全體出動進攻復州，但是葉三對這種冒險的軍事行動並不看好。遼東明軍塘報上形勢確實一片大好，估計殲敵數有一兩萬。不過葉三可沒有這個信心，他知道塘報上有多少是虛假內容，不可足信。對遼東戰況，雖然具體情況他不是很清楚，但他覺得這個數字用在給關內振奮人心還是不錯的，可絕對不能作為軍事情報依據。
葉三為此事召開了海盜軍團緊急軍事會議，把孤島上當官的都找來商議，如果請戰的呼聲太過強烈，那麼葉三也打算把海盜帶上陸路，偷襲一下復州的女真小股部隊來練練兵。
「韓軍門大約有三萬戰兵，一個月就殺敵一兩萬，這似乎有點多。」軍議上葉三表示了懷疑，一個月殺敵近兩萬的總戰績也忒牛B了︰「平均每個士兵要殺三個女真騎兵，多了點？」
「大人，一天殺三人，這不算什麼，屬下一人一天就能殺七八個。」徐虎滿不在乎地道。其他幾個當官的都不說話，而是在各自揣摩葉三話中要表達的意思。
「軍中殺敵舉報十倍，外攝不臣，內按人心。」葉三並不希望被部下看做是很悲觀的人，所以他說話非常小心︰「也許韓經略也有這方面的考慮。」雖然葉三說得很委婉，但徐虎已經有些不滿了︰「女真蠻夷這次也損失慘重啊！大人，我們新建的海盜軍團再不抓緊時間搶功，屬下就沒得搶了。」馬文升終于也出來幫忙了，他覺得已經讀懂了葉三的上意︰「女真騎兵的兵力大約有三萬，還有漢軍旗和無甲兵，還是較我明軍實力雄厚。」
葉三的本意想采取游擊戰，游擊戰一般是劣勢方使用的戰術，力量強大以後自然更傾向會戰，所以經過幾個月的整頓後，遼東明軍紛紛開始轉入反攻。但葉三擔心遼東明軍上下頭腦發熱，他太了解女真人的真正實力，歷史告訴他女真人絕對不是什麼好捏的軟柿子。各部將官都有可能往自己的戰績里兌水，然後相互影響制造出攀比之風，造成整體軍情和戰功判斷失誤。
「島上的新兵訓練的如何了？」葉三不等徐虎再說話，就問起了馬文升。馬文升抱歉地看了一眼葉三︰「回大人話，屬下無能，我海盜軍團可用新兵不足五百。」
「這不關你的事，是人力資源太少的緣故。」葉三大度地揮了一下手，這個答案他心里事先也有數︰「兵器不足，這也是沒有辦法的事。」
「下官無能。」這次輪到李雲亮謝罪了。雖然孤島名義上讓幾個人分管，但是孤島初建，島上就兩千多人，葉三有時也要事必躬親。開墾土地，造船捕魚，修建港口，搭建營房，等這些工作做完，能剩下用來制造軍械和組織訓練的時間就很少了。
這幾個月以來，葉三總算開墾出六千畝耕地，並依照谷有穗的建議，全部種上芝麻，徹底壓制住雜草。同時還制造出幾百支棗木長矛，本來還想制造出一些弓箭的，可時間有限，而且工藝復雜，威力也小，最後還是放棄了。
「就目前的情況，我海盜軍團無力出征。」葉三看著一臉失望的徐虎，毫不留情地否決了手下的議案︰「進攻復州的提議，我不許可。」
不去復州送死不等于海盜們不進行任何軍事行動。經過仔細偵查，葉三覺得出動幾百名海盜還是沒有問題的，現在關鍵的是作戰必須要能保存自己，消滅敵人。
「我先說說作戰目標。」葉三在海盜軍團最新立下一項規矩就是做作戰任務簡報，務求使在坐的每一位將領都理解作戰目的和粗略計劃。所有將領都靜靜地期待著。葉三清了清嗓子︰「本次出擊，目標是一個村落，共有四十多戶人家，海盜軍團必須要把這個村落的村民一個不留，全部搬遷到孤島上來，並掠走全部糧草、牲口、農具和家具。」好嘛，葉三堂堂大明太師，一人之下萬人之上，竟要下令海盜打劫村落，還要施行三光政策，這也忒現眼了︰「另外，出擊的海盜，不準裝備精良的武器，人手一支長矛，每兩個新兵由西大營一個老兵帶著。」
這次行動雖然海盜沒有傾巢出動，但葉三非常重視︰「我們要去的村落離海岸線二十里，距離復州五十里。先鋒是徐千總，到達時間是晚上十點，其余海盜隨後到達。」葉三沒打算用模糊的傍晚、黃昏這種字眼來下達時間，而是用了近代的計時法，這樣更準確。
「今夜完成行動，天明必須返回海岸，乘船回孤島。現在海盜軍團還沒有偵查能力，所以一切都要嚴格按照計劃行動。」葉三這次來遼東視察是坐船來的，連他自己的坐騎算上也只有十匹戰馬，所以陸地偵查能力十分低下。
「本次行動，雖然你們是海盜，但絕不允許傷害平民百姓，他們將是我們海盜軍團的一部分，將來也是你們的部下。」說到這里，葉三狡猾地一笑︰「這個當然不必事先和村民說明，如果有人害怕，你們要學會安撫，但不能說是命令，要讓每個海盜都會說一句︰我們不會傷害你們的。總之，要用海盜的名義進行安撫，但也不能讓他們肆無忌憚，听明白了嗎？」
「屬下明白。」
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