若是按照時間順序來講，這個故事應該是這樣的︰一個高度發達的文明準備建立一個實驗時空，首先他們要建立實驗時空的數學模型，為實驗時空提供理論基礎。
在這個模型的空間維度上，發達文明采用了天圓地方的樸素模型，並且改變了兩個基礎物理參數重力加速度和空氣中氧佔比，因為兩個參數的改變，實驗時空延伸出一種全新的發展模式，從自身開發開始，通過習武修行攀升境界，並且自發形成了一套獨特的修行體系。
而在時間維度上，發達文明給人間設定了初始參數，以真實世界中的古代為藍本，稍作修改和刪除添加，于是實驗時空有了上古時代，有了時代背景，新紀元正式開啟，一條巨大的時代斷層出現了。
身處實驗時空的人們汲取上古時代的知識，形成一套以人為本的感性認知體系，並沒有形成以物質觀為根本的現代科學，因為重力加速度太小，在地殼之下形成不了密閉高壓狀態，所以激發現代科學的催化劑石油並沒有出現，墨家機關術沒有了動力來源，只能停留在奇yin技巧上面，稱為不入流的細支末道。
發達文明為了減少對人間的干擾，通過天葬和天諭來指導人間，引導人間發展方向，但是一個系統無論多麼穩定，總會出現不安定分子，在人間，一名修行者為了探究天地真相，出現在天上，引發了第一次時空危機，發達文明巧妙解除了第一次時空危機，並且改進了實驗時空的數學模型，讓天圓地方的世界以一點為中心旋轉，于是人間出現了極光，產生了旋轉的磁場，人間再無神游天外之人出現在蒼穹之上。
但是發達文明不知道，第二次時空危機也在悄悄孕育，有人通過自我探究和思考，準備利用逆向方法昭告天下人，人間之上有天上人俯瞰監視人間，破壞人間的不自知性。
發達文明不得不出手，以天諭方式引導九品之上的天上人齊入太安城，最終天上又取得了勝利，將罪魁禍首囚禁在雪山之上。
整整十年的空白期，天上再無插手人間之事，直到有人死在聖人書院的花圃前，人間形勢突然錯綜復雜，天上人插手人間的次數越來越多，終于天下高手齊聚雪山。
「李元櫻，雖然我們在高處觀察你們，但是在某些範圍內，已經給予了你們最大的自由，你們可以按照自己的意識行事兒，可以讀書寫字，說話聊天。自由不是一個絕對的概念，自由永遠是相對的，不受約束的自由只存在幻想之中我不喜歡把我們和你們對立起來，因為那是一種愚蠢而且膚淺的認知，我個人永遠承認人間之人和我們有著平等的人權，並且認為天上和人間是一種相輔相成的關系，我們為實驗時空提供基本穩定的空間環境，實驗時空也在默默反補著天上，通過觀察測試，實驗時空每一年可以產生四十余本學術著作，一百多篇高水平論文，從中延伸出來直接或者間接經濟利益不計其數，我們感謝你，由衷感謝你。」凱瑟琳說著，深深鞠了一躬。
站在大殿內，李元昊細細思索著凱瑟琳說過的話語，雙耳開始嗡鳴不斷，頭腦發脹，然後漸漸歸于平靜，有些事情不能改變，只能接受︰「還有嗎？你們還做過什麼手段來監視人間？我不相信你們只做過上面那些事情！」
凱瑟琳緩緩抬起頭，臉上露出些許猶豫，似乎並不想過多提及，思想掙扎一番，最終她嘆了一口氣︰「沒有什麼好隱瞞你的了，你猜得很對，我們除了合歡樹，還有另一種手段觀察人間，而且你應該很好奇為何我和你會有相同的樣貌，也會很疑惑你和我之間的關系。」
伸手在空中一點，一棵合歡樹躍入眼中︰「實驗時空中人群千千萬，龐大的基數造成了巨大的管理難度，僅靠著合歡樹，我們很難掌控全部，實現精確定位，所以我們還需要另一種監控手段。」
「這和你我相貌相同有什麼關系嗎？」李元昊疑惑。
「關系在于內在，不在于表象。」凱瑟琳開口說道︰「人間修行的目的在于對自己進行提升，注重自我升華，不過這里的自我不夠細小微觀，停留在表面，但是我們不同，我們有嚴謹的科學體系，所以我們對人的認識遠遠高于你們，為了避免涉及過多的名詞和概念，我不說過程，只說結論，我們通過基因對人間之人進行精確定位和監測。」
「基因？」
「是的，基因。」凱瑟琳的手指微動，空中的那一棵合歡樹扭曲變形，成了一個雙螺旋盤旋形狀︰「這就是基因，孩子和父母長相相似，原因是因為基因遺傳，基因將父輩的特征遺傳給下一代，它支撐著生命的基本構造和性能，儲存著生命、種族、血型、孕育、生長和凋亡等過程的全部信息，人的生、長、衰、病、老、死等一切生命現象都和基因有關，基因即具備物質屬性，而且具備信息屬性。人和動物有很多不同，若是從最根本的出發點進行區分的話，基因不同是最好的答案。同類物種的基因具有相同的基因序列，他們之間的相同點是由基因控制，不同點也是由基因控制，所以在很長一段時間內，基因測序是一件人類認識世界和生命奧義的浩瀚工程。」
「你們即使能夠解密所謂的基因，那又如何，基因排序應該是一種固定的序列，不會因個體改變，就像你們所說的物理參數，客觀真實存在，不以人的意識轉移和物體的類別不同而改變，所以基因」李元昊的話語戛然而止，既然他們能夠改變物理參數，為何不能改變基因序列，如果凱瑟琳說的是事實，他們完全可以在人的體內設置任何他們想要的基因序列，這是比合歡樹更深層次的監控。