四年春正月辛巳朔，大軍至榛子鎮、沙河驛，俱降。壬午，至永平。先是，劉興祚自我國逃歸，匿崇煥所。至是，率所⺬巂滿洲兵十五人、蒙古兵五百欲往守沙河。聞大兵至，改趣永平之太平寨，襲殺喀喇沁兵于途。上怒其負恩，遣貝勒阿巴泰等禽斬之，裂其尸以徇。癸丑，上授諸將方略，乘夜攻城。城中火藥自發，敵軍大亂，黎明克之。貝勒濟爾哈朗等入城安撫。丙戌，上率諸將入城，官民夾道呼萬歲。貝勒濟爾哈朗、薩哈廉守永平。以降官白養粹為永平巡撫，孟喬芳、楊文魁為副將，縱鄉民還其家。是日，上率大軍趣山海關。敖漢、奈曼、巴林、札魯特諸部兵攻昌黎，不克。台頭營、鞍山堡、遷安、灤州以次降。建昌參將馬光遠來歸。丁酉，明兵攻遵化，貝勒杜度擊敗之。明兵入三屯營，先所下漢兒莊、喜峰口、潘家口、洪家口復叛。庚子，達海等復漢兒莊，貝勒阿巴泰守之。辛丑，喀喇沁布爾噶都為明兵所圍，遣軍往救，未至，布爾噶都自擊敗之。其帥明兵部尚書劉之綸領兵至，樹柵。我軍砲毀其柵。之綸屯山中。大貝勒代善圍之，勸之綸降，不從。破其營，之綸被箭死。壬寅，移師馬蘭峪，毀其近城屯堡。丙午，喀喇沁蘇布地上書明帝，論和好之利，且勸以愛養邊民、優恤屬國之道。不報。樂亭復叛。
二月辛亥朔，諭貝勒諸臣，凡將士驍勇立功者，勿與攻城之役。甲寅，宴明降將麻登雲等于御幄，謂之曰︰「明主視爾等將士之命如草芥，驅之死地。朕屢遣使議和，竟無一言相報，何也？」登雲對曰︰「明帝幼沖，大臣各圖自保，議和之事，儻不見听，罪且不測，故懼不敢奏。」上曰︰「若然，是天贊我也，豈可棄之而歸。但駐兵屯守，妨農時為可憫耳。且彼山海關、錦州防守尚堅，今但取其無備城邑可也。」己未，遺書明帝，仍申和好，並致書明諸臣，勸其急定和議，至是凡七致書矣。甲子，明榆林副將王世選來降。上班師，貝勒阿巴泰、濟爾哈朗、薩哈廉及文臣索尼、寧完我等守永平，鮑承先守遷安，固山額真圖爾格、那木泰等守灤州，察喀喇、範文程等守遵化。駐灤三日，論功行賞。壬申，諭曰︰「天以明土地人民予我，其民即吾民，宜飭軍士勿加侵害，違者治罪。」上至永平，降官郎中陳此心謀遁，事覺論斬，上赦之，听其所往。
三月壬午，上還沈陽。庚寅，遣二貝勒阿敏、貝勒碩率兵五千往守永平四城，貝勒阿巴泰等還。庚子，阿魯四子部遣使來盟。
夏四月壬子，明兵攻灤州，不克。己卯，貝勒阿巴泰、濟爾哈朗等自永平還。上問是役俘獲較前孰多，對曰︰「此行所獲人口甚多。」上曰︰「財帛不足喜，惟多得人為可喜耳。」
五月己丑，諭諸臣厚撫俘眾。壬辰，阿敏、碩等棄永平四城歸。時明監軍道張春、錦州總兵祖大壽等合兵攻灤州。那穆泰、圖爾格、湯古代等出戰，屢敗明兵，然兵少，阿敏、碩畏不往援，明兵用砲攻灤州，那穆泰等不能支，棄城奔永平。會天雨，我軍潰圍出，無馬被創者死四百餘人。阿敏、碩聞之恐，遂殺降官白養粹等，盡屠城中士民，收其金幣，乘夜出冷口。察哈喇等亦棄遵化歸。上方命貝勒杜度趨永平協守，且敕阿敏善撫官民，無侵暴，將整兵親往。庚子，聞阿敏棄城，且大肆屠戮，乃止。
六月甲寅，收系棄城諸將，數其罪。乙卯，御殿宣阿敏十六罪。眾議當誅。上不忍致法，幽之。碩、湯古代、那穆泰、巴布泰、圖爾格等各奪爵、革職有差。諸將中有力戰殺敵者釋之。先是阿敏既屠永平官民，以其妻子分給士卒。上曰︰「彼既屠我歸順良民，又奴其妻子耶！」命編為民戶，以房舍衣食給之。
秋九月戊戌，申諭諸大臣滿、漢官各勤職業。
冬十月辛酉，諭編審各旗壯丁，隱匿者罰之。
十一月甲午，那堪泰部虎爾噶率家屬來歸，阿魯四子部諸貝勒來歸。壬寅，阿魯伊蘇忒部聞上善養民，留所部于西拉木輪河，而偕我使臣察漢喇嘛來朝。
十二月戊辰，科爾沁貝勒圖美衛徵來朝。
五年春正月庚辰，諭已故功臣無後者，家產給其妻自贍。壬午，鑄紅衣大砲成，金雋曰「天祐助威大將軍」。軍中造砲自此始。乙未，以額駙佟養性總理漢人軍民事，漢官听其節制。己亥，幸文館，入庫爾纏直房，問所修何書。對曰︰「記註所行政事。」上曰︰「如此，朕不宜觀。」又覽達海所譯武銓，見投醪飲河事，曰︰「古良將體恤士卒，三軍之士樂為致死。若額駙顧三台對敵時，見戰士歿者，以繩曳之歸，安能得人死力乎！」庚子，朝鮮貢物不及額，卻之，以書責其罪。
二月庚申，敕邊臣謹斥堠。甲戌，孟阿圖征瓦爾喀，奏捷。
三月乙亥朔，瓖藍旗固山額真、額駙顧三台罷，以弟之子篇古代之。書諭大貝勒代善、三貝勒莽古爾泰及貝勒諸大臣，求直言過失。丁亥，閱漢兵。甲午，誅劉興祚、興治家屬，赦其母。丁酉，朝鮮復遣使來貢。辛丑，遣滿達爾漢、董訥密遺朝鮮王書，索戰船助攻明。不許。
六月癸亥，定功臣襲職例。黑龍江伊札訥、薩克提、伽期訥、俄力喀、康柱等五頭目來朝。
秋七月甲戌，黑龍江虎爾哈部四頭目來朝貢。庚辰，始設六部，以墨勒根戴青貝勒多爾袞，貝勒德格類、薩哈廉、岳、濟爾哈朗、阿巴泰等管六部事。每部滿、漢、蒙古分設承政官，其下設參政各八員，啟心郎各一員，改巴克什為筆帖式，其尚稱巴克什者仍其舊。更定訐告諸貝勒者準其離主例，其以細事訐訴者禁之。諭貝勒審事冤抑不公者坐罪。除職官有罪概行削職律，嗣後有罪者，分別輕重降罰有差。並禁官民同族嫁娶，犯者男婦以奸論。又諭貝勒諸大臣省過改行，求極諫。甲申，鬧雷虎爾哈部四頭目來朝貢。癸巳，定小事賞罰例，令牛錄額真審理，大者送部。明總兵祖大壽等築大凌河。檄諸蒙古各率所部來會征之。己亥，大軍西發，命貝勒杜度、薩哈廉、豪格留守。庚子，渡遼河，申誡諸將恤士卒。
八月壬寅朔，次舊遼河而營，蒙古諸部率兵來會。癸卯，集蒙古諸貝勒，申前令，無擅殺掠。于是分兵兩路，貝勒德格類、岳、阿濟格以兵二萬由義州入屯錦州、大凌河之間，上自白土場入廣寧。丁未，會于大凌河，乘夜攻城。令曰︰「攻城恐傷士卒，當掘壕築壘困之。彼若出，與之戰，外援至，迎擊之。」乃分八旗兵合圍，令蒙古兵承其隙。辛亥，明馬步兵五百人出城，達爾哈擊敗之。壬子，射書城中，招蒙古人出降。癸丑，明兵出城誘戰。圖賴先入，達爾哈繼之，四面環攻，貝勒多爾袞亦率兵入。城內砲矢俱發，圖賴被創，副將孟坦、屯布祿、備御多貝、侍衛戈里戰歿。上以圖賴等輕進，切責之。以紅衣砲攻明台，兵降者相繼。乙卯，遺祖大壽書曰︰「往者我欲和，爾國君臣以宋為鑒，不我應。爾國非宋，我亦非金，何不達若此。朕今厭兵革，更以書往，惟將軍裁之。」大壽不答。丁巳，明松山兵二千來援，阿山、勞薩、土魯什擊敗之。甲子，貝勒阿濟格、碩托遮擊明援兵。丁卯，明錦州兵六千來攻阿濟格營。會大霧，覿面不相識。忽有青氣沖敵營，闢若門，我軍乘霧進，大戰，敗之，擒游擊一，盡獲其甲仗馬匹。辛未，上詣貝勒阿濟格營，酌金卮勞諸將。明兵突出，師夾擊，又大敗之。
九月丁亥，上以兵趨錦州，見塵起，上命諸軍勿行，自率擺牙喇兵二百，與貝勒多鐸緣山潛進。明錦州兵七千突出進上前。上甫擐甲，從者不及二百人，渡河沖敵軍。敵不能當，潰走。諸軍繼至，又大敗之，斬一副將而還。己丑，復以書招祖大壽。庚寅，上設伏山內，誘大壽出，將擒之，大壽驚遁，自是閉城不出。時城中穀止百石，馬死盡，煮馬肉為食，以鞍代爨。乙未，明太僕寺卿監軍道張春，總兵吳襄、鍾緯等，以馬步兵四萬來援，壁小凌河。戊戌，明援兵趨大凌河，距城十五里。上率兩翼騎兵沖擊之，不動。右翼兵猝入張春營，敵遂敗，吳襄及副將桑阿爾寨先奔。張春等復集潰兵立營，會大風，敵乘風縱火，將及我軍，天忽雨，反風，復戰，遂大破之，生擒張春及副將三十三人。春不屈，乞死，上赦不殺。是役也，祖大壽仍以我為誘敵，故城中無應者。是夕黑雲龍遁去。
冬十月丁未，以書招祖大壽、何可剛、張存仁。己酉，再遺大壽書。壬子，以紅衣砲攻于子章台。台最固，三日台毀，守台將王景降，于是遠近百餘台俱下。甲寅，遣降將姜新招祖大壽。大壽亦遣游擊韓棟來會。癸亥，議三貝勒莽古爾泰上前持刃罪，降貝勒，奪所屬五牛錄。乙丑，祖大壽約我副將石廷柱議降。丙寅，大壽遣其子可法為質。