阿鵬乘著快龍迅速的趕往雷之島，正趕上閃電鳥的出現，此時收藏家的飛行器也趕了過來。
「閃電鳥，小心上方，火焰鳥就是被他們抓住的！」阿鵬朝著閃電鳥大喊，閃電鳥沒有理會阿鵬，直接向飛行器沖過去。
飛行器中……
「閃電鳥似乎發現我們了，正在朝我們飛來。」超高智能的計算機對它的主人，也就是那位收藏家說道。
「自投羅網嗎？」。那位收藏家微笑了起來，並沒有做出任何的指示。
閃電鳥快速飛向飛行器，接著使出了十萬伏特，如阿鵬所料的飛行器下端伸出了一根大柱子，上面有很多的天線狀物品，接著十萬伏特自動打到了那些天線上，也不知道是故意的還是被強制吸過去的，不過阿鵬的話是更贊同後者，閃電鳥的電力被完全的吸收了，十萬伏特根本沒有對那飛行器造成任<何的傷害……
阿鵬沒有繼續呆在那，因為他知道閃電鳥被抓住是遲早的事，與其白白浪費時間，還不如趕快收集到三個寶物，然後讓海之神洛奇亞解決三神鳥的事，最後再靠芙盧拉吹響笛子解決整個事件
不久，阿鵬便看到了那只會說人話的河馬王，阿鵬走上前去。
「傷腦經誒，世界即將毀滅，沒有優秀的控制者的話是無法平息眾神的憤怒啊。」河馬王說道。
「我想我可以阻止這件事！」阿鵬說道，河馬王繼續無視阿鵬，「要怎麼辦才好呢，傷腦經誒。」
「難道你是優秀的控制者嗎？」。情形倒過來了，變成了河馬王問阿鵬。
「控制著說不上，不過我的確可以平息這場戰爭！」阿鵬說著，看了看手中的零度球，絕緣球，耐熱球。
阿鵬簡單的說明了情況，然後迅速趕往雷之島的寶珠所在地，還好，有了快龍的飛行速度，阿鵬很快地就拿到了雷之珠。
阿鵬一刻也不敢停息，迅速趕往火之島，路上阿鵬覺得事件發展的有點不對頭，再抬頭看看上方，收藏家的飛行器就在上面。
「看來得先救出它們倆呢！」阿鵬一臉堅毅的說道，然後乘著快龍向飛行器飛去
「快龍，瞄準那個點，全力使出破壞死光！」阿鵬手指了指飛行器的艙口喊道，快龍聚集了好一會的能量，然後一發強力的破壞死光轟擊了上去，雖然沒有完全打破，但進去的空間是綽綽有余了。阿鵬剛一進去，就有幾個鐵環罩住了阿鵬。
「你是什麼人？怎麼到我的飛行器里來了！」收藏家降落到大廳，然後朝著阿鵬喊道，阿鵬說︰「就是你吧，把雷之神和火之神抓了起來，導致現在天氣那麼差，神奇寶貝都騷動了起來！」
收藏家沒有理會阿鵬，反而笑著說︰「你可是第一個沒有接到邀請函就來到這里的人啊，覺得怎麼樣啊？火之神，火焰鳥，雷之神，閃電鳥，冰之神，急凍鳥，這些都是我的新收藏品。」
「是啊，的確是很厲害沒有錯，不過利用科技來捕捉神奇寶貝不管理由是什麼都是非常骯髒的手段啊，這點你不會反駁吧？」阿鵬說道。
「在一個收藏家的眼中，沒有神奇寶貝，或者說神奇寶貝和別的一些寶物一樣，都只是收藏品而已，就像散落各地的寶物，當它不屬于任何人的時候，我去尋找，並且找到了，那麼它就變成了我的收藏品，而神鳥對我來說也是一樣，並不存在骯髒不骯髒，你的那個說法是神奇寶貝訓練家之間的說法，我們收藏家是不會在意的。」那個收藏家說道，似乎真的並不在意，「我現在沒有空來管著你，也不想管你，你可以好好觀賞我的收藏品，不過可不能用手踫哦，這可是基本的禮節啊。」那個收藏家說道，接著籠子從下面打開了，阿鵬早有準備，安全落地。
「好了，冰之神差不多該出來了，我要好好準備一下才行啊，哈哈。」那個收藏家冷笑道，接著電梯又升了上去。
「哼，你會因為把我放出來而後悔的！」阿鵬心里暗暗想到。
「出來吧，我的伙伴們！」阿鵬一下子拋出了除三神鳥以外所有的神奇寶貝球，暴蠑螈，快龍，噴火龍，化石翼龍，耿鬼，沙基拉，尼多王出現在阿鵬面前。
阿鵬先準備救火之神，「化石翼龍，先用破壞死光轟擊火之神的鐵圈！」阿鵬下令道，化石翼龍直接從嘴邊射出一道強力的橙色能量，打到鐵圈上居然毫無效果！
阿鵬想果然設這樣，隨後又下令道︰「快龍和尼多王使出急凍光線，噴火龍和暴蠑螈使出噴射火焰，耿鬼使出黑夜詛咒，！」阿鵬很後悔把皮卡丘傳了回去，不然的話就靠電解水產生氫氣和氧氣，再靠噴射火焰引爆就行了
快龍和尼多王都打出急凍光線把鐵圈凍結，隨後暴蠑螈和噴火龍吐出熾熱的噴射火焰轟擊到鐵圈上，接著耿鬼打出一道黑色的光線，漸漸地，鐵圈出現了裂痕
「就是現在，化石翼龍使出億萬沖擊波，沙基拉使出雙刃頭槌！」阿鵬看見裂痕就知道攻擊奏效了，再堅硬的物體，受到火和冰的雙重攻擊就會變軟，然後黑夜詛咒再打出一道裂縫來完全在阿鵬掌握之中。
化石翼龍開啟了紫色加黃色花紋的沖擊罩，沙基拉全身閃爍著深藍色的光華，億萬沖擊波和雙刃頭槌一起轟擊到了鐵圈上，終于打破了火之神的束縛。
火焰鳥吼叫一聲，然後噴出一道熾熱的火焰打在困住閃電鳥的鐵圈上，阿鵬想這下不妙了，噴射火焰把鐵圈打爆了，閃電鳥沖了出來，接著就攻擊火焰鳥，這正是阿鵬所擔心的，火焰鳥本來是要救受困的閃電鳥，卻被閃電鳥誤解成要攻擊自己，隨後找火焰鳥報復
阿鵬現在腦子里都亂成一鍋粥了，可是現在的情況已經不允許他多想，阿鵬迅速收回神奇寶貝然後乘上快龍，想著要趕緊拿到冰之珠才行。
一出飛行器，阿鵬就呆住了，急凍鳥已經和火焰鳥和閃電鳥打做一團了，這下事情變得更棘手了，三只神鳥看到阿鵬，接著噴射火焰，急凍光線，十萬伏特同時向阿鵬打來，阿鵬連忙指揮快龍避開，然後拿出零度球，絕緣球，耐熱球拋向空中喊道︰「拜托你們了，一定要阻止它們啊！」急凍鳥，火焰鳥，閃電鳥點頭然後又飛向火之神，雷之神，冰之神。（注︰因為有了阿鵬的三神鳥，所以就把對方稱作火之神，雷之神，冰之神）
「那是~能控制三神鳥作戰的神之指揮者」河馬王在遠處說道。
阿鵬不敢懈怠，到了火之島去取火之珠，路上看到自己的三神鳥正處于下風︰冰之神使出急凍光線，火焰鳥使出噴射火焰抵抗。本以為火焰鳥會成功，誰知噴射火焰對上急凍光線，當時抗住了，可是冰之神的急凍光線卻慢慢的將噴射火焰推了過去，這讓阿鵬感到自己和神獸的差距，不過阿鵬還是堅信神奇寶貝是沒有界限的，神獸絕不是不可超越的，自己的神奇寶貝才只訓練了一年多而已，時間還很長，早晚自己的神奇寶貝會超越神獸的水平的。
「可惡，這樣下去會來不及的！」阿鵬抱怨著，降落在亞西亞島，誰知河馬王正等待著他。
「嗯，只有兩個寶珠是不行的啊，沒有冰之島的寶珠是無法平息三神鳥的憤怒的，唉~」河馬王看著阿鵬拿出兩個寶珠說道。
此時三神鳥也在激烈地戰斗，火焰鳥和閃電鳥還好了，雖然絕招的威力不及火之神和雷之神，但在絕招反彈的過程中就引爆了，可急凍鳥就慘了，急凍光線硬是被推了回去
這樣下去很快就撐不住了，阿鵬想了想面向大海，然後大喊到︰「海之神，請你出來平息三神鳥的憤怒吧！」阿鵬也沒把握能叫來洛奇亞，只是踫踫運氣，水面便開始震動起來。
「來了嗎？洛奇亞！」阿鵬馬上想到。
果然，一道巨大的水龍卷風從冰面上沖了出來，撞開了冰之神和雷之神，火之神也是險險才避開，接著，水龍卷風的中間，有一個發光的球體，然後整個水龍卷炸了開來，一個白色略帶藍色的神奇寶貝現身。
「果然是海之神，洛奇亞啊。」阿鵬感嘆道，「阿鵬！」一個聲音從自己的身後傳來，阿鵬回頭一看，是芙盧拉開著快艇來了，後面還跟著小瑩和小優。
洛奇亞鑽回了海底，然後一道水龍卷出現在了快艇的下面，把快艇頂了起來，水龍卷就帶著快艇移到，方向是亞西亞島，接著快到時，一下把快艇扔了出去，扔到了海邊的神廟旁邊…….