在天京的洪秀全也接到了英王陳玉成被圍六合城下的噩耗。
天王洪秀全坐在大殿之內，一夜之間，白發又增了許多，下面文武群臣也都沒有一個吭聲的。
太平軍在載淳到來之後，接連有六合之敗，損失三成多人馬，再有句容丟失，侖山之敗，再損失五萬多兵馬。這不到半年的時間里，接連的慘敗，已經嚴重的打擊了太平軍的氣勢，二破太平軍南、北大營之士氣已經蕩然無存。
此時的太平軍眾將對載淳都存有一絲的畏懼之心，私下里皆言，載淳用兵如神，有神鬼莫測之能，連太平軍中繼翼王石達開之後，最能戰的英王陳玉成也被困六合成，還有誰是他的對手呢？所以大殿中一片安靜。
最後天王洪秀全也無可奈何，無奈的說道︰「眾卿家，現在英王十萬大軍被困六合城下，你們看該如何是好呢？」
天王洪秀全見眾人沒有撘蒫的，心中就更不高興了，有些腦怒的說道︰「既然你們都束手無測，那朕就決定，由振王候玉田領水軍先破清妖水師，打破江面封鎖，再由弼王黃得用、就王黃盛爵、懿王蔣有福、勸王萬鎮坤領兵五萬，從燕子磯渡江攻打六合，與英王陳玉成兩面夾擊六合，復奪六合城，救出英王陳玉成。
這是我天國生死存亡之時，眾卿家要奮勇向前，共渡此難官，再破清妖大軍，顯我天國軍威。」
振王候玉田在接到天王洪秀全旨意之後，于同治元年十月五日出燕子磯，尋清軍水師決戰。
而丁汝昌已隨英吉利上校阿思本學習近兩年時間，此次隨載淳南下，也知載淳用意，就是練兵，檢驗一下北洋水師的戰力如何。雖然北洋水師是海軍，但海上比江河之中的風浪更大，丁汝昌率北洋水師進入長江之後，如走平地一般，沒有任何風浪的感覺。
丁汝昌在接到載淳的旨意之後，也是摩拳擦掌，準備與太平軍水師大干一聲，自己也不能白來江南一趟，否則空坐高位，老是有一種心里不踏實的感覺。
丁汝昌很是羨慕聶士成等人，一來江南就撈到仗到，而自己卻一直是閑著，現在終于等到機會了。
雙方在互相尋找對方蹤跡，伺機決戰。而長江雖說很是寬闊，但相對大海來說還是小了很多。
同治元年十月八日早，長江之中有些霧氣，視線並不是很好，北洋水師與太平軍水師在八卦洲附近相遇。
雙方開始之時都沒有看到對方，但直到雙方距離不足三里之時，才同時發現對方。北洋水師在見到太平軍水師之後，由于沒有作戰經驗，先是一陣大亂，在丁汝昌的大聲呼喝之下，才漸漸穩住陣角。
而太平軍水師一看就是久經戰陣，並沒有任何慌亂，迅速填裝炮彈，並率先開炮，北洋水師在一陣慌亂過後，也開炮還擊。
由于這是北洋水師的第一戰，無論是丁汝昌，還是水手、炮兵都緊張，炮兵更是發揮失常，還平時訓練的五成都不到，第一輪炮擊之後，一發也沒有命中太平軍的艦船，相反太平軍第一輪炮擊之中到是有三發炮彈擊中北洋水師船弦，雖然沒有造成太大傷害，但也驚了丁汝昌一身的冷汗，但同時也冷靜了下來。
丁汝昌心道，這樣打法不行，完全沒有發揮出北洋水師船快炮遠的優勢，必須要有所改變，丁汝昌立即下令，北洋水師靠向長江北岸，一字長蛇，全速向前，炮口調向南，準備第二輪炮擊。
眾水手與炮兵見主將沉著應戰，並無慌亂之態，也都受到了丁汝昌的影響，都漸漸的冷靜下來。
丁汝昌見自已艦隊將要與太平軍水師擦臂而過之時，下令開炮。炮手們一個個收收拾起了最起慌亂的心，按平時的操練，進行開炮射擊，現在充分發揮出了北洋水師船快炮利的優勢。在北洋水師打出第二輪炮擊之後，太平軍水師相繼有四艘艦船中彈，並有三艘起火。
北洋水師炮兵見太平軍艦船有中彈的，立刻一陣歡呼，但很快又填裝炮弱，準備下一輪炮擊。丁汝昌在北洋水師艦船沖過四里多遠後，下令調轉船隊。
而太平軍振王候玉田見剛才一輪炮擊，北洋水師與自己艦船拉開距離，使得自己一方火炮打不到北洋水師。沒有辦法，在艦隊調轉過來之後，迅速向江心使去，使得北洋水師無法再躲避。
丁汝昌見太平軍駛向江心，向自己艦隊沖來，立刻打出旗語，艦分為兩隊，分別駛向南北兩岸，將太平軍水師夾在中間。
北洋水師全體官兵受剛才一輪炮擊的鼓舞，打得越發的精準，再第三輪炮擊之後，太平軍艦船又有十二艘起火，前且還有五艘被直接擊沉。而自己這一方，由于艦船速度快，大部分成功規避，只有五艘受點輕傷。
雙方緊跟著再次調轉船對，又進行了第四輪的炮擊。一時之間，長江水面濃煙滾滾，炮聲不斷，不斷擊起數尺高的水柱。
五輪炮擊過後，太平軍水師共有十二艘艦船沉沒，二十八艘起火，沉船也是早晚的事。而北洋水師確只有十艘受輕傷，兩艘起火退出戰斗。太平軍水師艦船數量上的優勢已經蕩然無存。
雙方水師從早晨一直打到傍晚，太平軍水師共損失艦船六十多艘，只有十幾艘見事兒不好，逃回了燕子磯。
太平軍水師經此一戰，再無力在長江之上與清軍抗衡，太平天國已經再無任何水上的力量。
而北洋水師經此一戰，獲得了寶貴的實戰經驗，並成功毀滅太平軍水師，從此北洋水師在長江之上，橫行無阻。太平天國從此再無力進範江北。
丁汝昌與北洋水師也經此一戰成名天下，再無有任何聲音質疑丁汝昌的能力，丁汝昌不再是靠老師的關系才能執掌北洋水師的，丁汝昌是靠自己真刀真槍拼出來的。
其實最高興的還要屬大清同治皇帝——載淳。當初載淳在用丁汝昌也是持懷疑態度的，因為歷史教訓深刻，由于丁汝臨戰指揮不當，是北洋水師在黃海之戰中慘敗的重要原因。載淳也怕歷史再重演，葬送自己的海軍。
而此時的載淳徹底放心了，丁汝昌在自己的刻意安排之下，已經不再是原來歷史之中的丁汝昌了，他用實力證明了自己。
載淳一直在為北洋的掌舵人選發愁，因為彭玉麟年齡漸大，自己不忍心再讓彭玉麟臨戰指揮。而現在丁汝昌成熟了起來，載淳毫不吝惜，在接到北洋水師大勝的戰報之後，立刻加封丁汝昌為北洋水師副提督，實際就是這只艦隊真正的掌舵人。