千年獸的事情暫告一段落，陸峰開始考慮要不要把基地的重心轉到鋼鐵之島來，因為很明顯，數碼世界belldandy層就要遭遇一次人類與數碼獸的大規模沖突，而且今後還會被基路比獸和六翅獸拆一遍，實在太危險了。u
d層或許更加安全。但權衡再三後，陸峰放棄了這個想法。他的朋友、聲名、地位都在belldandy層，這就已經決定了他的主要精力將放在這里。而u2s
d層只能是作為狡兔三窟的後備。
和上次一樣，u
d層的異變並沒有引起人類世界的注意。日本政府的兩派則在激烈斗爭當中。解散dats後，羽柴長官已經任命倉田明宏負責數碼獸相關事件的負責人。盡管薩摩廉太郎想機密省申訴，據理力爭，也無濟于事。因為他們本來就是個民間科學家組織，還是個不太听話的組織。而對于機密省來說，像警察一樣收拾殘局哪里比得上入侵新世界來得功勞大，有所偏向性，理所當然。
而藤枝淑乃的回歸帶來了人類在屠殺數碼獸的消息，大門大他們這才明白為什麼墨丘利獸那些數碼獸會對人類的態度那麼惡劣，對墨丘利獸帶走比丘獸的怨恨減輕了許多。
但是緊隨著藤枝淑乃的就是神志不清正在茫然找尋大門知香的亞古拉獸，把大門大打蒙了，也是這一次引出了亞古獸s進化為完全體的契機。
在此之後，數碼特搜隊的隊員們意見發生了分歧，薩摩廉太郎、大門大都對人類屠殺數碼獸表示了質疑，而藤枝淑乃則堅信。
「這其中會不會有什麼誤會？也不然我們兩邊都求證一下。」白川惠的提議緩和了氣氛。托馬也認為這是個不錯的主意。
「我去暗中調查那個羽柴！」藤枝淑乃首先道。
「那我就去問一問那個墨丘利獸！」大門大捏了捏拳頭。
「那麼就由大、托馬前往數碼世界向墨丘利獸求證；淑乃和小惠、美樹去向機密省詢問！」薩摩廉太郎做出了最後決定。
「是！」眾人一听就要各自開始行動。
「等等！」薩摩廉太郎叫住了藤枝淑乃︰「注意方式方法……還有，要小心！」
「嗯~！」得到隊長的特別關照，藤枝淑乃干勁更足了。
而咋听到dats解散的武之內素娜這時也回到了dats基地，然後被藤枝淑乃拉進了隊伍。
而當所有人都離開基地後，薩摩廉太郎才露出了憂慮的表情。掏出口袋里的電話，撥出一個號碼︰「是湯島嗎……」
成功避過世界樹的耳目逃回人類世界的管狐獸扭頭道︰「這次的事件恐怕很難善了，如果托馬他們在數碼世界的行動不順，就讓他們去鋼鐵蒼穹吧。」
薩摩廉太郎疑惑道︰「鋼鐵蒼穹？」盡管他和管狐獸是搭檔，但卻並沒有得到多少數碼世界的的內幕消息。
「啊，如果報上那個名字的話，或許會有幫助。」
第二天，做好了充分準備的大門大和托馬踏入傳送器進入了數碼世界belldandy層，而藤枝淑乃四女也站到了政府大樓下……
和動畫一樣，托馬和大門大直接出現在距離無限冰壁不遠的森林中，然後晚一步到達的食物、信標裝置、通訊工具、計時工具全都被野口郁人一擊成灰。
「野口郁人？自稱‘數碼獸’的人類小孩，有意思！」對大門大這個主角的行蹤，陸峰可謂是十分關切，因為這關系到劇情的走向，誰讓陸峰沒看過第五部呢。
而野口郁人與大門大、托馬的戰斗讓陸峰產生了一個想法……
「分子獸，做得很不錯！」陸峰對大屏幕下操作的部下贊賞道。也許是因為對那只變異太陽獸的忌妒，也許是沒能被選上進入人類世界獨當一面，留在鋼鐵之島的一只齒輪獸「知恥而後勇」地進化成了分子獸！于是，被帶到了鋼鐵蒼穹上擔任重建工作的總負責人。
當然，比數碼寶貝第一部里的分子獸差遠了，可卻讓陸峰的研發能力一下子增強了好多倍。對這些上進的部下，陸峰一項不會吝惜稱贊。
回到大屏幕上，從野口郁人他們的戰斗情況來看，這個10歲的孩子戰斗經驗極其豐富，如果身體條件相當，近戰遠程能力應該還在大門大之上。想起湯島浩對大門大說的「對你熾熱的拳腳來說，這個人類世界太狹小，都揮舞不開了吧？怎麼樣？要是再數碼世界的話就能和許多強敵盡情戰斗了！」，陸峰都覺得臉紅。就算他真是「全日本第一的打架番長」又怎麼樣？隨便找個武術大師就由n種方法干掉他了。和托馬打拳擊都只能靠著耍賴得到平局，他也好意思。
戰斗引出了這片森林的主人祖立獸，托馬才知道「數碼世界的數碼獸並非全部服從于墨丘利獸」，陸峰一口果汁噴了出來，全部服從墨丘利獸？托馬這家伙什麼時候變成腦殘了？
不過陸峰確實討厭這種諸侯統治的方式。明明墨丘利獸掌管樹海，就相當于戰國七雄那種程度。下面卻還有許多不那麼買賬的完全體小諸侯，統治效率太過低下了。
然後因為對森林的巨大破壞，祖立獸漸漸偏向大門大一方。主角節奏漸漸出來，陸峰也就沒有興趣看下去了。吩咐分子獸繼續監視大門大，陸峰轉身向著鋼鐵蒼穹一處人類氣息濃厚的地方走去。
還記得陸峰曾經很喜歡機械邪龍獸的那片名勝建築群吧，把人類世界各地的建築匯集到一起，凱旋門、帝國大廈、羅馬斗獸場、大本鐘、天主教堂……雖然在與機械邪龍獸在地底戰斗使得一部分塌陷了，黑暗龍卷山崩碎又毀了一部分。但新世界誕生後，黑暗龍卷山的殘骸卻被陸峰搶救回來了一部分，也包括很大一片人類建築。（黑暗龍卷山本就有抗衡啟示錄獸的功能，所以即使被毀掉，殘骸也不會被那片黑暗宇宙粉碎。）而現在，這些建築中是有住戶的！
陸峰把這些建築的一小塊跨世界移植到了belldandy層，這些居民也就一起來了。（這是因為belldandy層現在空間壁壘太薄，操作難度不大，等空間壁壘加厚之後就沒這麼容易了。）
能猜出這些居民是誰嗎？好吧，按照一般奇幻魔法小說或者軍事歷史小說的套路，陸峰如果真想培養自己的班底應該最好從孤兒中挑選，從小養大。這點陸峰當然也做了，而且是以他的公司的名義在世界各地創辦孤兒院。然而，這些都是未來的事情，陸峰現在需要的，確實能夠立即派上用場的人類！
而這些居民，都是這樣的人才！他們全都是曾經加入「蓋亞計劃」的優秀研究人員。
「好了，各位，傳送裝置建立好了嗎？」陸峰把這些找來的第一件事就是在鋼鐵蒼穹上建立能夠和鋼鐵之島直接聯系的傳送器，而無需人類世界的中轉。
「基本原理已經沒有問題，傳送器的組裝也很順利，接下來我們只需要調試，找出與u
d層的象限差距就可以了……」這些研究人員的臨時負責人貝根史坦因教授向陸峰做了說明。（貝根史坦因教授出自數碼寶貝第三部）
「專業詞匯就不用和我說了，我只需要知道這東西什麼時候可是使用。」
「大概……三天吧！」貝根史坦因肯定道。這個金發中年人十分干練，一身牛仔裝，活像美國西部片里的警長，是個很有主見和擔當的人。所以才會被選為人類的臨時頭領。
這時一個叫做「萊娜」的女研究員瑟縮著向陸峰問道︰「完成了這個你真的會放了我們嗎？」
陸峰看了他一眼︰「會！」看著萊娜雙眼冒出希冀，又馬上道︰「但你們還是得回來！」
「什麼！？」萊娜驚叫道。「不能放過我們嗎？我已經好幾年沒有見過女兒了！你不能這樣對我！」
「為什麼不能？」陸峰反問，「統治著蓋亞囚禁了你們這麼多年，是我給了你們自由，讓你們重新看到藍天，看到白雲，看到這個美麗的世界。你們才能不像那些被帶走的同伴那樣被繼續囚禁。難道是我給的太多了，以至于你們貪心不足？」
「可是~！」萊娜還想反駁，卻又被陸峰打斷︰「況且我並沒有說要阻止你去見你女兒，甚至我還會幫助你！」
「什麼！？」被陸峰拋上拋下的萊娜有些愣神。
「你們其實也回不去了吧！失蹤了這麼多年，你們一回去就是一次大轟動，尤其是帶回去了那麼多數碼世界的信息，我想51區之類的地方就是你們永遠的歸宿了……而我，也勢必不能容忍你們講消息泄露出去，到那時候……」在救出這些研究員的時候，陸峰可是從無比感激的他們嘴里得到了最詳實的信息。
「你到底想說什麼！」還是貝根史坦因更冷靜，他拉住萊娜，親自和陸峰對話。「說出你的目的吧，或許我們會同意。不要用這種手段了！」