初步于寧遠城外重新修築了一條臨時驛道後，多爾袞即率領約6000清軍護送34000余名八旗眷屬退往盛京，而阿濟格則率剩下的13000余清軍繼續駐防在寧遠城外，以接應後續豪格等部通過寧遠地段。
由于寧遠渡實際在寧遠城的目視範圍內（炮擊範圍外），所以吳三桂、施大瑄等指揮官站在寧遠城頭能清晰的觀察到清軍的動向，因此能給判斷出減少了護送車團的清軍後，寧遠城外清軍兵力遭到相當程度削減的事實。
不過吳三桂並沒有盲目出城攻擊，而是耐著性子等到了十一月十六日的中午，這才在吃過中午飯後再次領兵出城，對留守的阿濟格部展開進攻。
由于施大瑄率領的鄭家水兵及三省水手依舊不合適參加陸地決戰，所以此戰依舊以吳三桂部為主力；而清軍這邊，雖然在十四日的戰斗中，折損了近千老八旗兵，但由于多爾袞帶走的多是蒙八旗兵馬——1000滿八旗及5000蒙八旗——故而戰斗力依舊相對于吳三桂部來說更為強大一些，因此在16000打13000的情況下，吳三桂部依舊沒能討好，若非于通見勢不妙，果斷率領僅剩下1400多人的濟州水師陸戰營投入戰斗，只怕吳三桂部會被再一次打崩了。
最終，在于通部的支援下，吳三桂部以再次損失了三千人的代價，才擺月兌了阿濟格部的攻擊，得以退回了寧遠城中——明軍布置在寧遠城頭的幾門紅夷火炮也是清軍不敢進一步追擊吳三桂部的原因之一——從而徹底喪失了再次出擊的能力，被迫困守寧遠城內。
當然，阿濟格部此番也折損了小2000人，且因為缺醫少藥的緣故，傷員根本救不回來，所以，這2000人實際是硬損失，足以讓阿濟格和滿清高層為之淚流滿面——主要是，傷亡都是數量有限的滿八旗和漢軍旗，人數較多的蒙八旗及新附漠南蒙古兵卻因為戰斗模式和戰斗習慣的緣故，損失不大。
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