淺井久政雖然對淺井長政招致上杉將軍家的大舉討伐感到極度不滿，但鑒于淺井家此時正值危難之際，為了不讓淺井家家名斷絕、一族覆滅，他只能再一次放段，一面致信織田信長、下間壽法求援，一面致信上杉將軍家世子上杉氏虎要求進行停戰和談。
雖說淺井家中有不少人對此感到羞恥，但為了讓淺井家獲得一線生機以及休養生息的機會，淺井久政也想不出更好的辦法來。
畢竟犧牲淺井久政這一張老臉，從而避免淺井家因與上杉將軍家開戰所帶來的巨大災難，這筆買賣總體來算還是不太虧的。
但作為上杉軍軍師的竹中重治卻並不想讓淺井家繼續割據在北近江諸郡，他才被上杉將軍家任命為近江守護代不久，深知京極高吉這個近江守護只不過是一個花瓶，上杉將軍家高層並不會讓其在寸功未立的情況下就領有近江一國。
為了能讓自己獲得更多的領地，有朝一日可以衣錦還鄉，竹中重治就力勸上杉氏虎、齋藤朝信二人，不用理會淺井久政的請求，繼續切斷赤尾城的水源以及糧道。一旦淺井家無力出兵救援赤尾城，那麼剩余的北近江諸將就不再會繼續效忠于淺井家，必然會一個接著一個的主動向上杉將軍家開城投降的。
于是，上杉氏虎就采納了竹中重治的建議，直接將赤尾城圍了一個月，對淺井久政不做任何回復。
由于赤尾清綱、雨森清貞、海北綱親、遠藤直經等人並沒有提前做好籠城固守的準備，以及因兵力寡少、士氣低落等原因，就在倉促之下驅趕了周邊一千余領民進入城中協防，這就導致淺井軍只能依托城池據守，並不敢主動出城迎擊城外的上杉軍。
可人畢竟是要吃飯的，就算減去一頓，一天至少也要吃上兩頓。
原本，赤尾城中就有赤尾清綱、雨森清貞、海北綱親、遠藤直經等人所率的兩千四百軍勢，但入城協防的那一千余淺井家治下的領民也是要吃飯的。
結果，城中本就不多的存糧很快就告罄。還不到半個月的時間，赤尾城中的軍民半數以上都被餓死。
赤尾清綱、雨森清貞、海北綱親、遠藤直經等人是盼星星盼月亮，始終沒有等到淺井長政所派出的援軍，感到又氣又悲，只能心中默默念叨著︰「主公啊主公，你難道就打算拋棄家中宿老嗎？！」
其實，淺井長政並沒有拋棄這些擁立他繼承家督之位的宿老，只是他當時還在淺井郡、阪田郡、犬上郡、愛智郡等地征召軍勢，因為赤尾清綱、雨森清貞、海北綱親、遠藤直經等人身陷重圍之中，根本得不到消息罷了。
就算是赤尾城到了如此山窮水盡的地步，赤尾清綱、雨森清貞、海北綱親、遠藤直經四人仍然執迷不悟，意圖負隅頑抗，甚至偏執的認為淺井長政必然會派遣援軍前來救援赤尾城的，只需繼續堅守下去即可。
然而，隨赤尾清綱、雨森清貞、海北綱親、遠藤直經等人參陣的下阪若狹守、田那部式部丞、河毛清旨等淺井家奉行人、旗下國人領主為了自己能夠活命，只能對不住同僚了。
元龜元年，七月十五日，深夜。
趁著夜深人靜之時，下阪若狹守、田那部式部丞、河毛清旨等人率部突襲了赤尾城的本丸，將毫無防備的赤尾清綱、雨森清貞、海北綱親、遠藤直經四人討取，而後大開城門向上杉軍投降了。這就讓原本準備大展身手的山崎兵庫頭毫無表現的機會。
然而，上杉氏虎卻並不打算在這赤尾城多做停留，在安排收繳城兵武器、安排領民返回各自村落後，他就留下上野出身的山名義季率五百軍勢留守赤尾城，以防自己的退路被切斷。
由于如今的淺井長政縱酒作樂、窮兵黷武，很快就引起了淺井家治下諸郡各大領主以及領民的反抗，野村直隆、熊谷平次郎、多賀賢長（多賀長則）、藤堂嘉房（多賀賢長之弟）、藤堂虎高等淺井家家臣見上杉將軍家勢大，以及為了優先確保家名存續，還沒等上杉軍進入淺井郡，他們就爭先歸附上杉將軍家。
其中，野村直隆為了討得新主的歡心，更是直接將自己治下的國有村獻給上杉將軍家作為直領。他的這一舉動讓上杉氏虎感到非常滿意，直接下發給他雨森城兩萬石的安堵文書。
等到赤尾城陷落的消息傳至南近江諸郡後，一時間南近江諸郡大震。作為織田家南近江諸郡旗頭的柴田勝家急忙對觀音寺城、長光寺城、箕作山城、永原城、山中城、小川城、勢多城、三雲城等地進行加固城防、囤積糧草，以防上杉將軍家趁機發起對南近江諸郡的侵攻。
因為，如今的南近江諸郡並沒有太多的兵力留守，大部分青壯都被織田信長調走去用于攻打尾張奪回失地，再加上愛知郡、犬上郡、阪田郡的不少國人領主倒向上杉將軍家，瞬間切斷了織田家留守在南近江諸郡家臣與織田信長的聯系，使得柴田勝家完全不敢輕舉妄動，只能眼睜睜看著淺井家的領地被上杉將軍家蠶食鯨吞。
淺井久政在得不到上杉氏虎的確切回復後，為了做好最壞的打算，就在小谷城附近的大岳山上新築一座名為燒尾城的支城來增強小谷城的防御力。
但令淺井久政、淺井長政父子二人都沒有料到的是，他們前腳配置的守將小堀正次、速水守久等人，後腳他們就通過先前倒向上杉將軍家的山本山城城主阿閉貞征、磯野城城主磯野員昌二人向上杉軍主動獻出了大岳城，甚至還主動擔任先導役，引上杉軍向小谷城的月所丸、六坊寺、丁野丸、山崎丸等地。
山崎兵庫頭因為先前沒能在攻打赤尾城中表現一番，故而在攻打小谷城的過程中極為活躍。直接率部一鼓作氣連克丁野丸、山崎丸，甚至還將周邊的寺院智善院、天德寺燒毀。