相比起澹路、阿波兩國的迅速淪陷，留守讚岐的十河存保並沒有逞能，他深知留守岐的三好軍與上杉軍進行正面交鋒是絕無勝利的可能，就算自己集中兵力在讚岐、阿波兩國的境目地帶布置防御也無法抵達上杉軍凌厲的攻勢。
故而，十河存保就只好將防線進一步收縮，以現有的兵力固守岐一國的幾處重鎮要地。另一方面，他還趕緊派同族家臣三好隼人左前去攝津報信求援。
但上杉軍卻並沒有給十河存保足夠的時間來設置防線。
大西賴武、森村春等人為先導役，引上杉軍的宇都宮定綱、齋藤朝信、直江景綱、色部勝長等部兩萬余軍勢從西阿波白地城北上；葛西義定、高梨政賴、里見義弘、太田資正等將率三萬軍勢從東阿波勝瑞城出陣，攻向東讚岐重鎮要地之一的引田城；宇左美定勝、本莊繁長、岩城政藤等將率兩萬余軍勢從澹路渡海向讚岐雨瀧城發起攻擊；甘糟景持、上野家成等將率三千軍勢聯合長宗我部家對本山家發起南北夾擊；加地春綱、千阪景親等將率三千余軍勢聯合長宗我部家東西夾擊安藝家；四條虎定、今川氏定等將負責留守澹路一國••••••
在面對上杉軍的三路大軍，十河存保左支右絀，留守讚岐的三好軍很快就全線崩潰。
宇都宮定綱、齋藤朝信、直江景綱、色部勝長等將在率兩萬余軍勢攻入西岐後，一路接連攻落本筱城、藤目城、大平城、高丸城、九十九山城、麻城、西長尾城、天霧城等地，並討取細川氏賴（岐細川家家督）、香川景全、財田常久、長尾高勝、奈良元信等諸多岐有力國人領主，上杉軍很快就壓制了岐半國。
與此同時，葛西義定、高梨政賴、里見義弘、太田資正等將所率的三萬軍勢在進入東岐後，還沒對引田城發起攻擊，引田城城主四宮光武就主動開城投降了，並引導上杉軍對虎丸城、雨瀧城、志度城、池戶城、十河城等地發起攻擊。
宇左美定勝、本莊繁長、岩城政藤等將在與葛西義定、高梨政賴、里見義弘、太田資正等將南北夾擊後，就討取雨瀧城守將安西忠澄，之後更是兵鋒直指十河城。
十河存保在得知岐一國絕大部分地區淪陷後感到驚懼不已，甚至打算棄城逃往尹予來躲避上杉軍的兵鋒。
最後，在前田宗清（岐弓之名人）、吉成信長、加地盛時等多名十河城守將的勸說下，十河存保才暫時打消棄城而逃的想法。
但十河存保因此也錯失了最佳逃亡的時機。
而這時的三好三人眾、三好長治、筱原長房等人還在繼續 攻著本國寺。
天色微明，細雪漸止，本國寺內外烈焰熊熊。
「明智十兵衛••••••你還是快些逃離此地吧••••••余恐怕是看不到泰平盛世到來了••••••」足利義昭有氣無力的說著。
如今的足利義昭正躺在血泊之中，身上的白衣已被鮮血完全染透，而明智光秀則是右手緊握太刀，緩緩扶起足利義昭，打算帶著他一同離開本國寺。
「公方殿，只要臣一息尚存，就絕不會將您拋棄的！」明智光秀目光非常堅毅，雖然他身上還中了兩箭，但他依然忍著疼痛準備隨時投入戰斗。
「帶著余，你是無法離開此地的••••••三好軍的目標是余••••••十兵衛，你已經為余做得夠多了••••••余已經很滿足了••••••」足利義昭雖然雙眼渙散，但還是強行擠出一絲笑容。
「公方殿••••••」
「攝州、雍州諸將距離此地近在遲尺••••••但出兵來援者寥寥無幾••••••看來，余與兄長皆不得人心啊••••••十兵衛，你有王左之才，還是前去出仕山內內府吧••••••能靜謐天下的就只有他了••••••」足利義昭的話還沒說完，已經瞑目而終，臉上還帶著一絲微弱的笑容。
「公方殿！」明智光秀見足利義昭咽氣後不禁痛哭失聲。
「明智十兵衛大人，突入寺中的三好軍越來越多了，我等還是盡快突圍吧！」先前還在與三好軍進行混戰的和田惟政說完就將手中已經斷成兩截的長槍丟棄，開始收攏殘軍準備撤離本國寺。
「罷了，公方殿，臣在有生之年一定會為您復仇的！」明智光秀萬般無奈之下只好與和田惟政、細川藤孝、山岡景友、三淵藤英等剩余奉公眾一同向河內方向突圍而去。
而三好義繼、尹丹親興、細川藤賢、森彌五八郎、阪井與右衛門等人則是在本國寺外圍與三好軍混戰之中先後力戰而亡。
盡管三好三人眾、三好長治、筱原長房等人成功將本國寺攻落，並將足利義昭殺害。但周邊形勢對于三好家來說卻並沒有絲毫好轉，三好軍在攻打本國寺的過程中也損失慘重，根本無力繼續向山城月復地進發，只能退入攝津越水城、富松城等地進行休整，並等待來自四國的補給。
另一方面，八條景定卻面色凝重的拿著一份戰報，走到正在庭院中喂魚的綾姬身後，並將戰報遞給了綾姬。
「阿綾，京公方殿于本國寺遇害，剩余的奉公眾已突圍至北河州，我已經安排中條越前守前去接應了。」景定倒是沒有料到足利義昭竟然沒能撐到上杉軍完全奪取阿波、讚岐、澹路等國。
「七郎，你在京公方殿遇害之前按兵不動，如今該如何收場？你該不會是打算讓賴純公去繼承足利將軍家的家名吧？」綾姬稍微撇了一眼戰報的內容後就扔到了一邊。
「我軍因分兵協助松永霜台討伐筒井家以及出兵攻打四國，自然沒有余力來出兵救援京公方殿。」景定倒是立即想到了冠冕堂皇的借口，誰讓足利義昭在入主山城後就開始重用自己的親信鎮守山城、攝津兩國的重鎮要地，就連織田信長都無法安插親信進入。
「這就有些牽強吧？我軍此次出兵京畿可是有十六萬余的大軍，就算去除了已經返回飛州和信州的部分軍勢，那還剩下十五萬五千以上的兵力在。」綾姬听完景定那冠冕堂皇的借口後不禁搖了搖頭。
「如今拘泥于這些已經無濟于事了，我等應立即發兵聯合部分攝州諸將將進入雍州、攝州兩地的三好軍擊敗。之後還需出兵上洛，盡快穩定洛陽周邊的局勢，恢復洛陽御所周邊的治安等等。」景定覺得如今確實是上杉家奪取山城一國的最佳時機。
「希望虎千代她在得知京公方殿遇害後還能保持理智••••••」綾姬如今最擔心的就是坐鎮江戶城的上杉謙信，生怕她會一時沖動趕到京畿來。
「那麼我等需要盡快將京畿諸州再度靜謐，而後想方設法獲得朝廷的將軍宣下，並向西國諸州下達總無事令。」景定並不打算繼續拖延下去，他打算畢其功于一役，迫使天下大名承認上杉家接替足利將軍家成為天下共主。
「將軍宣下？！七郎，你該不會是想••••••」綾姬隨即意識到有些不太對勁。
「不錯，我打算上書朝廷，請朝廷指認山內屋形殿為新一任征夷大將軍，之後就由阿綾你代她接受即可。」景定打算來個生米煮成熟飯。
「七郎，你覺得朝廷方面會同意你的請求嗎？」綾姬並不認為朝廷方面會很快同意景定的請求。
「如今不論是天子還是朝中公卿，早就希望山內屋形殿來擔任征夷大將軍來使天下六十六州靜謐，只是山內屋形殿一直沒有同意罷了。」景定隨即向綾姬解釋了一下。
「只要能名正言順就行。」綾姬在嘆了一口氣後說道。
「那是自然。」景定點了點頭，他可不會像三好三人眾那樣用大軍進駐京都迫使朝廷服軟。
畢竟朝廷的幾處御料所還在關東，加上如今的上杉家已經壓制了紀尹、和泉、河內、澹路、阿波等國，朝廷方面若是想增加幾處御料所那就得看他們的表現如何了。