安排完相關事宜後，孫宇再次進入了冬眠。
這次，他設定的蘇醒日期是危機紀元16年。
同時，大批的神盾局高管，也進入了冬眠狀態。
神盾局則交給了史蒂夫•羅杰斯，統籌接下來十二年的工作。
危機紀元12年……
三體艦隊距離太陽系4.18光年……
林格斐茲羅望遠鏡發現了三體艦隊探測器，既水滴……
太空電梯投入運行……
章北海趁著孫宇冬眠，暗殺了航天部三元老，為無工質飛船的研發奠定了基礎。
完成自己的任務目標後，章北海進入了冬眠。
危機紀元16年。
孫宇蘇醒了，當他看到霍華德•斯塔克，已經從小青年變成了大胡子後，方才感受到了已快速流逝的歲月。
這一年，希恩斯夫婦蘇醒了……
「思想鋼印」被成功研制了出來。
他們夫妻二人建立了信念中心。
希恩斯完成了當年的承諾，將其中一台「思想鋼印」秘密轉移給了孫宇。
如獲至寶的孫宇非常高興，立刻就將「思想鋼印」的原理解析了個透徹，並銷毀了希恩斯送過來的樣機。
只要得到原理就可以了，孫宇有著更高超的打「思想鋼印」辦法。
也就是在這一年，孫宇給神盾局「增援未來」計劃內的100萬冬眠者，全部打上了思想鋼印。
幾個月後……
曼努爾•雷迪亞茲被破壁成功……
而他使用的策略，就是同歸于盡戰術。
在面壁計劃听證會上，雷迪亞茲使用了核彈作為威脅，用以恐嚇參會代表。
這也使得他激起了眾怒，憤怒的民眾要當場絞死他……
在飛回委內瑞拉的途中，孫宇秘密派人將雷迪亞茲劫持到了神盾局，並強行使他進入了冬眠。
將事先準備好的ETO人奸，整容成雷迪亞茲的模樣，使用全貫通式腦機芯片加納米蟲進行控制，使得這個人奸被憤怒的百姓當成了雷迪亞茲，而被亂石砸死。
做完這些。
孫宇再次進入了冬眠。
而這一次，他的兩個孩子將隨同母親一同冬眠。
這一階段輪值局長，恢復成了佩姬•卡特……
危機紀元26年……
在孫宇的授意下，佩姬•卡特公布了肉制品種植技術。
但這項技術剛一公布，便在社會上引起了軒然大波。
對于基因食物，人們是厭惡至極。
盡管佩姬•卡特接連解釋這種技術是以備不時之需。
但公眾仍然不買賬……
抗議，游行，要求取締神盾局的呼聲此起彼伏。
ETO看中了這次機會，他們潛伏在人群中，不停地煽動著人群，他們高聲吶喊︰「基因食物違反了大自然法則，基因食物有毒，基因食物會導致慢性死亡，拒絕基因食物，從我做起……」
現在的年輕人，已經不是當年危機紀元3年時候的那批人了，那一批人現在都已經年過50……
雖然他們仍然是神盾局的堅持擁護者，但這個輿論至上的時代，光靠這些老粉絲，根本起不了多大作用。
年輕一輩，根本不買賬。
這次針對神盾局違反道德底線的游行，整整持續了3個月之久。
最終，在聯合國將這項技術列為違反國際法後，方才平息了各地的集會游行。
至此，神盾局在之前二十多年所積攢的人氣，開始走向下坡路。
因為這些年孫宇一直在冬眠，並未公布什麼新的利民技術，久而久之，人類選擇了淡忘。
俗話說得好，縱有你對我千般好，只要有一次讓我失望，那你之前所做的，都將是白費……
夫妻之間，男方常常遭受女方的家庭暴力，每天女方對男方不是拳打腳踢，就是啞鈴灌頭，當有一天女方累了，想休息一天，不打了，男方就會認為這是莫大的恩德，從而會加倍對女方好，並且感激涕零……
人性不過如此……
危機紀元30年。
年輕人開始質疑面壁計劃，聯合國開始考慮全面廢止面壁計劃。
收到消息的佩姬•卡特，下令神盾局所有外勤特工全部撤回總部。
而後，佩姬•卡特進入了冬眠，並正式將最高指揮權限交給了紅後，基地防御全部交由終結者T800來擔當。
與此同時，8艘空天母艦全部退役，隨艦官兵也同時進入了冬眠狀態。
行星防御理事會試圖聯系神盾局，突然發現神盾局已經被托管給了AI，孫宇給出的最後留言視頻是︰
「我們將直達末日之戰！」
在進行對于面壁計劃的綜合考量後，PDC決定暫不廢止面壁計劃，但無限期停滯……
其實，聯合國還是對孫宇抱有很大希望的。
不過，廢不廢止面壁計劃對于孫宇來說，已經不重要了。
第一階段計劃，已經圓滿完成。
隨著時間推移，聯合國和世界ZF再次將主流防御計劃提上日程，並且加大了投資力度。
全球工業與航天技術得到了突飛猛進的發展。
但引來更為嚴重的問題就是對于環境的污染。
全球農產量急劇下降，經濟體系面臨崩潰。
全球所有國家的ZF宣布進入了緊急狀態。
由于環境日益惡化，農作物產量達到了百年歷史新低，這也使得全世界社會開始動蕩。
危機紀元36年。
人口開始銳減，糧食爭奪異常慘烈。
直到這時，人們方才想起神盾局早在幾年前公布的肉類食品種植技術，但由于被當時的小青年過度渲染為不安全食品，違背大自然規則，而被列為違法技術。
所以，沒有任何公司去研發相關技術和相關產業鏈上的各種相關產品。
當他們想起來這項技術時，肉制品種植技術早已在互聯網上消失多年，可見當時的人，得有多厭惡這項技術。
當然，最先吃虧的也是這一群人，也是他們最先食不裹月復，餓死街頭的。
危機紀元39年。
孫宇蘇醒……
蘇醒後的他，做的第一個決策就是開倉放糧。
經過了幾十年的運營，還珠格格副宇宙中已經囤積了大量的糧食和各類種植出來的冷凍肉制品。
8艘空天航母重新啟用，這次它們的任務就是全世界各地空投糧食補給。
令人諷刺的是，控制這8艘母艦的竟然沒有一個是人類，都是T系列終結者。
大批的糧食從時空門內被運出，幾乎是24小時不停歇的向全世界各地運糧。
當寫有神盾局文字的空投補給箱落地的剎那，這些人仿佛又看到了當年那個站在萬人現場，高聲演講的面壁者孫宇。
感激之情，在這一刻涌上心頭，人們雙膝跪地，高聲大喊︰「原來你才是我們的主啊！」
就這樣，從危機紀元39年至危機紀元51年，這十二年間，孫宇每年都會蘇醒兩次，為全世界運糧。
人吃人的慘狀，在孫宇的安排下並沒有出現。
但由于公眾對ZF產生了信任危機，導致了多國ZF的垮台，全新的秩序即將來臨。
危機紀元61年。
在神盾局的幫助下，各國建立了完善的糧食種植生產基地。
這也使得大低谷時期整整縮短了50余年。
人口雖然從83億，降低至63億，但這里有很大部分原因是觀念問題，年輕人不想生育。
由于其他方面的科學，已然突飛猛進，到危機紀元145年時，人類早早就完成了第一次的科技爆炸。
政局重新洗牌，興建地下城，太空軍獨立，並成立了星艦國際……