晚上，毛利侦探事务所，柯南还在看侦探电影，被小兰发现，大肆批评一番，因为已经很晚了。看完电影里枪击的片段，柯南恍然大悟，“原来如此，千钧的判断对了一半。剩下的疑点，也就可以解开了。我们全都上了那个真正凶手的当了。没想到这个案子中还有曲折。不过，要证明这点，目前的证据还不够。”
千钧宅，千钧在跟静杨、小雅、直子讨论这个案子，“所以我认为凶手一开始就是冲着高田议员去的，被波及到是石本。”小雅直接否决，“不可能的。为什么凶手不在开始照明的时候就开枪呢？”直子也道，“对啊，没必要等走到石本社长身边时才开枪吧。”静杨也道，“就算是巧合，未免也太巧了，恰好石本刚好被人恐吓。”千钧道，“这点我也想不通。的确，在高田行动过程中，开枪的机会很多。对方是神枪手，如果是我的话，我会在高田开始行动不久后就开枪，因为会场的人比较多，高田越走到后面，开枪射杀高田的机会就越少。”三女一致认为，毛利小五郎的推断是正确的，是高田遭了池鱼之灾。
第二天，山本综合医院，毛利还在房间呼呼大睡，电话一直在响。石本诚二忍无可忍，将毛利叫醒。毛利尴尬，“真是对不起，我怎么会睡着了。”小五郎跑过去，接起电话。来电话的是目暮警官，“大事不好了，毛利老弟。”原来，平冈志郎死了。
千钧大惊，“千叶警官，怎么会这样，他死在什么地方？”千叶道，“在一栋废弃的大楼里，那好像是他藏身的地方。这个，高木警官推断他不小心没有踩好，自己坠楼梯身亡了。”千钧怒道，“胡说八道！平冈是有名的职业杀手，又不是三岁小孩，怎么可能自己失足从楼梯滚下来呢？”千叶道，“说得也是，佐藤警官也是这么认为，觉得平冈的死太蹊跷了。据判断，平冈是头部受重伤死亡的。”千钧道，“可恶！搞不好平冈是被人给灭口的。”
毛利问道，“平冈的死是意外吗？”目暮道，“这些还不知道。我正要带高木和佐藤去案发现场。有进一步消息，我再联络你。”千钧也赶到了案发现场，见到了死者平冈志郎，他腰上还插着一把手枪。警察已经将那栋大楼彻底封锁了，进行详细取证。根据鉴识的取证，证实了击中高田议员的子弹，的确是从这把枪里射出来的。换句话说，凶器就是平冈腰上的手枪。
柯南从房间走出来，小兰正在接电话，毛利说在确保石本社长安全之前，他都不会回家来住。随后，千钧也打来了电话，小兰疑惑，上前接起来。千钧道，“柯南在不在？让他接电话。”小兰怒道，“那些杀人案件什么的，你不要老是找柯南。”千钧头疼，“小兰，我脑子不好使。新一又不在，我只是找柯南出出主意。你也知道，柯南聪明得很……”柯南急忙抢过电话，询问案情。千钧就将平冈志郎之死的事情讲了一遍。柯南大惊，“会不会是被杀？”千钧道，“我也这么认为。可是警视厅那帮糊涂虫，倾向于是意外。他们说什么平冈在藏身的大楼没有踩好楼梯就撞头死了，真是笑死人了！”
柯南立即判断出这绝不是意外，“如果的推断没错的话，这又是一宗杀人案件。那个凶手，因为平冈知道这个秘密，才被他灭口的。因石本社长引发这一连串案件，乍看上去简单，但其中隐藏着一个天大的秘密。最关键的是要找到证据。我们都被那个凶手蒙骗了。我一定会从这个复杂纠缠的谜团中，找出事实的真相。”小兰疑惑，“柯南，你刚才在跟千钧说什么？”柯南手忙脚乱将电话挂断，“哈哈哈，我是在模仿新一哥哥的说话口气。”小兰这才释然，“真是的，你怎么老是喜欢玩这种侦探游戏。”
随后，开车来到毛利侦探事务所，千钧带着柯南赶到石本精机公司。二人进来时，看见毛利和目暮经过前台，乘上电梯向上面去，大概是要去拜访石本诚二。千钧与服务台的前台小姐搭讪，知道顶楼处就是社长室。千钧正准备带柯南上去时，新仓常章却从旁边的电梯里面出来，手里提着个箱子。千钧诧异，“他不是高田议员的秘书吗？来这里做什么？”
社长室，目暮出示了柯南让兔女郎拍下的照片，指着照片上的墨镜男子，“这就是平冈志郎，你们有什么恩怨吗？”石本诚二却说根本不认识这个人，目暮语气严厉，“你最近接到恐吓信，你的性命可以说是危在旦夕。再说，从你肩膀上掠过的子弹，可是击中了高田议员，他还因此身亡。”毛利也劝道，“这可是一件严重的谋杀案。”石本知道问题的严重性，将手里的烟头掐灭，“老实说……”幸子急忙劝阻，石本叹气，“没关系的，幸子。我想没有再隐瞒下去的必要了。”
石本承认，他的确受到了平冈志郎的威胁。平冈不知道用什么方法搞到了石本公司的内部账本，里面的内容如果公开，公司会有大麻烦。平冈恐吓，“到时候你肯定会被逮捕入狱的，你公司的信誉也会荡然无存。”石本怒道，“就算这样，你也不能开口要10亿啊！”平冈冷笑，“这个价格很便宜。你赚了那么多了，石本先生！”由于平冈要价实在太高，石本就拒绝了平冈的要求，而且态度很坚决。石本知道平冈可能铤而走险，搞出大事来，就请了毛利小五郎来保护自己，“没想到因为我的关系，却害得高田议员无辜身亡。新仓秘书刚才来还跟我谈了一下。”
据石本讲，新仓说不要让高田议员就此白白死去，说服了石本向警方说明真相。这时，柯南打开门偷偷向里面观看，被幸子发现了。毛利大怒，“你怎么会跑到这里来的？”柯南急忙将包拿过来，“是小兰姐姐让我将你换洗的衣服送过来。”千钧走进来，“是我开车送柯南过来的。”毛利不喜，“你们真是多事。”目暮已经问清了，石本社长的确在偷税，内部账本就是关键，“请你跟我们去警局走一趟吧，也能保证你的安全。”石本头上冒汗，只好答应。
毛利大惊，“这么一来，那我就不是……”幸子道，“你还是帮上忙的，真的非常感谢你。”小五郎大为沮丧，自己的使命结束了，自然不能再找借口接近幸子。目暮将石本带走了，幸子陪同出去。毛利叹气，“我还真够倒霉的，没想到这件案子，这么快就解决了。”柯南提示，“如果说运气不好，平冈志郎的运气还真够差的。他的目标明明是石本先生，却打中了别人。最后又从楼梯上掉下来摔死了。运气真的差到了极点。”
毛利听完，也觉得有些蹊跷，“运气未免太差了吧？这件案子也太离奇了。难道说这个平冈还有共犯？”千钧道，“也许他看到平冈失败后，就将平冈给灭口了。”小五郎一惊，“这么说，这人还有可能会对石本先生下手。”毛利大喊幸子的名字，连滚带爬追了出去，“这件案子还没结束呢！”柯南满脸黑线，“大叔……”千钧好笑，“算了，美色当前，大叔是根本指望不上了。”柯南问道，“你这次怎么没有过去献殷勤？”千钧道，“幸子小姐虽然漂亮，却不是我喜欢的类型。说起来，大叔还是喜欢英理阿姨那种类型啊！”柯南笑道，“他们会结婚生下小兰，也不是巧合。”
毛利跑到外面，与一个男子迎面相撞。毛利道歉，“真不好意思，你不要紧吧？”男子摇头，没有跟毛利对话。小五郎不要意思，“我有急事先走了。”男子向社长室走来，柯南和千钧还在里面搜查。千钧一下子就听到脚步声，“柯南，有人来了。”千钧本来想出去看看，柯南摇头，示意藏起来。柯南藏到了橱柜里面，千钧闪身猫腰躲到柜子下面。男子在办公桌前翻找东西，柯南和千钧都认出来，是之前跟幸子偷偷见面的男子。男子找到一样东西，露出奸笑。由于位置的关系，千钧没看清是什么东西，不过柯南看到了。随后，男子立即离开了。
确认男子离开后，柯南和千钧出来。柯南道，“那个男子，与幸子小姐有什么关系？”千钧道，“这还用说，肯定有一腿。他拿走了什么东西？”柯南道，“是个像遥控器的东西……难道说是这样……”随后，二人离开公司，赶往平冈陈尸的废弃大楼，千钧早已跟千叶说好了。千叶将那些警员暂时支开，让千钧带着柯南进入现场。平冈的尸体已经不在了，不过警方的尸体图标都已经标示好了。
柯南道，“如果平冈自己都没注意到，他只是被真凶雇来设计成凶手的话……”千钧道，“就算注意到也一样，他本来就是专门干恐吓勒索勾当的。”柯南道，“他很有可能藏着足以作证的凭据。”二人找了一下，什么也没发现。千钧道，“如果有线索，警方肯定早找到了。”柯南却发现墙角有个奇怪的洞。千钧拔出七夕剑，将洞口撬开，从里面取出一样东西，递给柯南，“好像是个玩具马达，真奇怪！”柯南大喜，“果然，这些做坏事的家伙都喜欢留一手。”
毛利侦探事务所，小兰在打扫房间。小五郎还在自怨自艾，“幸子小姐……”千钧和柯南推门进来，小兰抱怨，“千钧，你又带柯南去哪里了？”千钧道，“出去看了一下警察档案，你知道，这小子好奇的很……”小兰皱眉，“真是的，哪有小孩子没事总去看侦缉档案的。”千钧只好打哈哈，柯南问道，“毛利叔叔，你不用保护石本先生了吗？”毛利沮丧，“他已经拜托警方了，不需要我了。真希望能早点跟幸子小姐拉近距离啊！”三人头上都汗，千钧苦笑，“拜托，你只会想这种事情啊，大叔！”柯南也讥讽，“现在是努力找凶手的时候！”
目暮警官忽然推门进来，说有件事情要跟毛利确认一下。小兰端上咖啡，目暮道谢。千钧问道，“是什么事情，目暮警官？”目暮问毛利，“你昨晚是亲自送石本去的山本综合医院吧？在那之后，他的秘书田中幸子小姐，待在医院里面有多久呢？”毛利回忆，石本去里面病房休息后，他和幸子一边喝可乐，一边闲聊。然后目暮警官打电话过来，再之后，小五郎就迷迷糊糊地睡着了。后来再醒来的时候，就是目暮警官早上打电话的时候了。当时是石本社长将毛利叫醒的，那时幸子早已不在医院了。
目暮道，“这么说来，你是不知道幸子小姐到底什么时候离开医院的？”小五郎肯定这点。千钧问道，“大叔，你是在床上睡的，还是……”毛利尴尬，“我坐在沙发上睡着了。”千钧道，“大叔你没有喝酒，却在沙发上睡过头……幸子小姐，只怕在可乐里给你下了安眠药。”柯南认可这个推理，毛利头上冒汗，“目暮警官，难道幸子小姐……”目暮点头，“这么看来，幸子小姐有充分的时间杀害平冈志郎。”毛利跳起来，“胡说八道！幸子小姐那么漂亮，怎么可能会杀害平冈呢？”柯南好笑，“这个理由还真是理直气壮啊！”