从旗本岛旅行回来，静杨、小雅抱怨没能赶上这次行程，也没看到沉睡小五郎的推理秀。直子却喜笑颜开，心情非常舒畅，静杨搂住直子笑着问一些亲密的细节问题，直子脸红岔开话题，谈起了夏江和小武之间的故事。静杨好奇，“他们的爱情跟松本老师的爱情故事好像啊，都是通过爱情来报仇的。”直子摇头，“可我总觉得有什么不一样的地方，不过，最后的结局都很好啊，没有酿成悲剧。”
小雅拿起桌子的水果，“不一样，松本老师与高杉俊彦小时候就是青梅竹马，而且当年松本警视也只是误伤了俊彦的母亲，俊彦也受到了惩罚，误会解开了就没问题了。夏江和小武却不一样，小武从一开始就处心积虑想要利用夏江摧毁旗本家，万幸的是旗本一郎抢先做了坏人，否则不一定会发生什么事情呢。”
千钧也认可小雅的推断，“不错，而且他们以后极有可能还会互相防备着对方，幸好他们也算是真心相爱，不然婚姻早就维持不下去了。”一身漂亮制服的由美从外面拎着包走进来，“没你们想象的那么严重了，等他们两个有了孩子，这个问题就解决了。到时候他们的孩子将会继承旗本家，之前的恩怨情仇就都不存在了。”
千钧笑着赞成这个观点，直子故意戏弄，“我怎么觉得你好像酸溜溜的，你帮夏江有些热心过头了吧。”静杨她们几个仔细询问，直子就把千钧和夏江非常要好的事情添油加醋的说了一遍，几个女孩一起奚落千钧一番。千钧哀叹，“直子，你以前从不喜欢煽风点火的，这次有些过分了吧。”直子从果盘中拿起橘子放到嘴里，“我觉得不能总是纵容你，你要好好反省一下，你不要说没有做对不起我们的事情哦。”
静杨掐腰道，“谁让你看见气质俱佳的美女就喜欢套近乎，还每次找借口说什么本性。”小雅削完苹果后补充，“没错，就是心里想想也不行，那叫做意y，红楼梦里说更坏。”千钧无语了，用求助的眼光看由美，由美吃着水果，摆手表示爱莫能助。千钧决定转移话题，“那今天晚上我好好补偿大家一下，保证让你们满意，这次你们应该没意见了吧。”四女一起笑骂他流氓，结果就是千钧这天晚上孤枕难眠。
过了几日后，千钧与三个女孩约好一起去看电影，直子曾经说这次花井也会来的。到了约定地点，静杨和小雅姐妹都到了，等了半天，直子也没出现。静杨随手打手机过去，结果提示对方关机。千钧恼怒，“真是的，直子搞什么鬼，是不是忘了充电了？算了，不等了，我们直接去她家里找她吧，顺便看花井在不在。”
千钧一直对花井惹火的身材和独特的风情念念不忘，静杨冷笑，“你少打花井小姐注意，她可看不上你。”小雅继续打击，“花井小姐也说过，她要找男朋友，就找个帅哥，至少也要像工藤新一那样才行，不错，她还挺喜欢柯南的。”千钧挠了挠头，“拜托，我可什么也没说啊，真是的，喜欢柯南，再等十年吧。”
事情有些出乎意料了，“什么？花井小姐，你说直子被绑架了，有没有搞错啊？”千钧从花井这里得到了非常雷人的消息，静杨和小雅也大惊失色，旁边直子的父亲武居胜彦脸色也很不好看。花井点头，“嗯，我们还接到了绑匪的电话，要求社长亲自去送赎金。”千钧有些疑惑，直子身上佩戴的水之晶石没有向自己的自然晶石发出危险信号，可以肯定直子现在还没有危险。回过头，武居胜彦让花井先回公司处理事情，绑架的事情他要自己解决。
花井犹豫，劝了几句就离开。千钧皱眉，“武居社长，你打算怎么解决这件事情？5亿元可不是个小数目。”武居胜彦冷笑，“当然是马上报警，不然绑匪万一拿到钱不放人怎么办？”静杨焦虑，“可是这样，直子会不会有危险？”小雅也非常紧张，“武居叔叔的话也有道理，不过，要小心点，尽量不要让绑匪发现，对了，千钧，你快通知毛利侦探吧，请他帮忙也许会有帮助的。”
随后，得到消息的目暮警官带领一批人马赶来过来。毛利小五郎、小兰、柯南也都到了，刚刚拿到持枪证的文良也闻讯而来。大家商量一下，决定分头行动，千钧、静杨、小雅伙同高木警官、文良带着黑闪进行追踪，希望能提前找到直子。毛利侦探和目暮警官，按照绑匪的要求，跟随武居社长去交付赎金，希望能一举擒获犯人。千钧提醒大家，“毛利叔叔、目暮警官，对方能绑架武艺高强的直子，绝非易于之辈，不是人数众多就是手中有枪，大家都要小心些。”只有武居胜彦有些心不在焉，让柯南有些奇怪。
千钧他们带着黑闪搜索的结果非常失败，对方好像知道了黑闪的弱点，故意经过了市区中心的河流和几个气味很大的地方。交付赎金这边，目暮警官已经在武居胜彦的手机里装了窃听装置，并吩咐一群手下千万小心，务必确保人质安全。目暮警官看着相片上抱着小狗的美丽直子，叹气说，“我觉得她不是武居胜彦的女儿。”
旁边的毛利侦探大有同感，柯南汗。这时候绑匪打来了电话，武居社长要求释放自己的女儿，自己愿意交付赎金。对方开着面包车过来，车上挡着布帘，不过还是让大家看到了一个被蒙着双眼的女人。如果千钧在这里，就会一眼认出这个女子根本不是直子。然而，由于距离太远，警官们和武居社长都没有看清楚，下意识地都认为就是直子了，连柯南、小兰也都没有觉察异常。
武居社长拿钱下车，不料，绑匪发现了警察在附近，当即宣布交易取消，立即开车逃逸，目暮警官大惊，命令手下随后追赶。经过一番追逐，直子被绑架时所乘的车子冲出了栅栏，沉在了海里。众人都大惊失色，目暮警官急忙指挥人进行打捞，小兰急得眼泪都快掉下来，她跟直子的感情还是非常好的。柯南也是恼怒，万一直子出了事情怎么向千钧交代。
车子打捞上来后，千钧和高木他们几个也都回来了，他们也没有找到直子。等听到直子随车掉到海里后，千钧都快要发疯了，文良拼命抱住他，让他不要冲动。这时，搜救人员前来报告，车子里面什么都没有，当然也没有尸体，他们怀疑人可能被水流冲走了。静杨和小雅激动地过来，请搜救队务必好好找找，因为直子的水性是非常好的，应该还没有生命危险。千钧也冷静下来，也想到了直子佩戴的是水之晶石，如果真的落在水中反而会非常安全。武居胜彦过来，对目暮警官大加斥责，认为警方辜负了他的信任，害得他的女儿出于危险中。
柯南有些疑惑，打开落水的车进行查看，他惊奇发现车子只有车窗损坏了，座位上还有一个锤子。小五郎发现柯南捣乱，过来大加斥责。千钧好奇，低声询问柯南，柯南把自己的疑惑告诉了千钧，“喂喂，千钧，你怎么好像不是很焦急了？刚才还大喊大叫，直子不是你最喜欢的人吗？”“柯南，我现在不知道直子的确切位置，但我可以肯定她现在应该没有危险。不明白吗？小孩子就不懂了，我们这叫心有灵犀，如果她真的有危险了，我马上会知道的。”柯南一头黑线，什么跟什么嘛。
夕阳西下，大家回到庄重幽雅的武居宅，武居胜彦将警察都赶走了，请毛利小五郎务必帮自己抓获绑匪。小五郎作出承诺，武居让秘书花井将一些详细情况告诉毛利侦探。花井说她跟直子约好一起去看电影，但是没有等到直子，却等到了绑匪将电话打到她的手机上，“都是我不好，如果那天不去看电影就好了。”
小雅安慰，“花井姐姐，看电影是我们几个先商量好的，你不要自责了。”静杨也补充了他们也没等到直子的事情，毛利侦探明白了，站起身询问武居社长有没有什么仇人，因为武居社长最擅长的就是并购和放高利贷。柯南暗自称赞大叔问到点子上了，千钧苦笑，武居胜彦的仇人只怕海去了。武居社长大怒，用手指指着小五郎吼叫，“我哪记得了那么多啊，做生意就如同打仗，输得只能怪自己，你懂不懂啊？”大叔立马歇菜了，柯南汗，有没有搞错，人家一凶就没胆子了。
随后，小五郎带着大家，在花井的陪同下观看了直子的闺房，看得出来，直子一直把花井当做亲姐姐一样，桌上摆放的照片是花井和直子开心的合影，二人在一起的合照很相配的。床头上有千钧和直子搂住一起的亲密照片，小兰看见满是羡慕。静杨抱怨自己跟直子这么多年姐妹，也不见她把自己的照片放在这，小雅好笑，“姐姐，你真是的，在千钧宅直子的房间里，床头上不就放着你们两个非常要好的照片吗？”
静杨有些羞赧，千钧也回忆起往事，“对于直子而言，她的母亲从小就过世了。父亲又不大关心她，跟她最好的人就是静杨姐妹、花井，还有我了。”小兰翻看直子的相册，第一张是大照片的合影，就是她们五个要好的同班同学合影，小兰笑起来。柯南好奇过去看，原来是静杨、直子、小雅、小兰、园子五个人的合影。
第二天，大家一起到坠海的地方进行查看，因为搜救人员没有找到直子或者绑匪。不过，几个女孩都坚信直子一定还活着，这次连园子、云灵都来了。这时大家看到了花井小姐也站在栅栏的破坏处发呆，大家一起过去询问。花井有些感伤，“你们大家都很担心直子吧，可是动用了那么多人还没有找到她，她到底在哪里啊？”说完后向大家鞠躬，哭泣着离去了。
柯南和千钧商量去船只管理处询问，看看有没有什么线索。一位老船长提起，那天他们这些行船人也都帮着警察搜索过，没有找到任何尸体。不过，有一个人把快艇开得飞快，差点撞到老船长的船。随后，二人找到了这艘快艇，柯南发现快艇上有潜水的装置，柯南立即断定直子与绑匪都活着。
柯南经过思索，明白了绑匪的手法，就是车子里面根本没有人质，只有犯人自己，当时人质被蒙着眼睛，谁也看不清人质到底是谁。之后犯人开车冲到水中，用锤子击碎车窗离开，利用早就准备好的快艇和潜水设备，在警方将注意力放在寻找落水的面包车和人质的空隙时间逃走。
千钧也认可了柯南的推理，有个疑点二人都想不明白，为什么绑匪没有带人质前来，难道他事前有了准备，只是耍警察玩的？他是怎么提前知道警察来了？文良跑到管理处证实了那条快艇放在那里很久了，主人几乎很少来过，园子疑惑是不是那位老船长看错了，云灵认为不大可能，那些行船人的眼力是非常好的，绝不会弄错的。
众人一起随小兰回到侦探事务所，小兰大惊，“等一下，爸爸，为什么要放弃调查啊？”小五郎恼怒，“我怎么知道，是他们那方擅自决定，可恶，有钱人都是小气鬼。现在好了，女儿死了，就更舍不得花钱了。”千钧大怒，“喂喂，大叔，直子肯定没有死，对吧，柯南。”小五郎回头，“你们怎么知道的？”
二人一时语塞，小兰、园子、云灵、静杨、小雅她们五个女孩也一起大喊，“没错，直子一定没有遇害的。”毛利好笑，“真是的，一群天真的女孩，想想看，那种情况下，车沉到水底，谁还能活下来，不可能的了。”几个女孩悲伤地奋力争辩，可都说不到要点上。柯南假装可爱，“也许她想耍耍名侦探毛利小五郎呢。”千钧也补充，“拜托了，毛利叔叔，直子她是我女朋友，这次委托费就由我出了，而且是双倍，怎么样？”小五郎一听大喜，“好，哈哈，那就让名侦探小五郎干到底吧。”
天亮后，大家再次前往武居宅，却遭到了武居胜彦的拒绝，他坚持女儿已经死了，让毛利侦探离开。毛利叔叔上前争辩，武居社长扔给他一个钱袋，说是解约金，让小五郎立即带着这群学生离开。不过，武居社长向千钧单独表示了歉意。这次，真的惹恼了小五郎，他气急败坏地声称自己不是为了钱来的，带着大家转身离去。出了门之后，叔叔破口大骂，千钧带着柯南单独离开，他们决定独自展开调查。柯南认为绑匪一定再次与武居社长联络了，于是二人再次潜回武居宅。
房间内，花井与武居正在商量，“社长，现在应该怎么办？要是不准备好赎金，直子小姐真的会被杀死的。”武居还在犹豫，“这个，直子她还活着吗？”花井拿出了绑匪寄送来的照片，上面直子被绑着手脚，嘴也被胶带粘住，戴着红色的帽子，膝盖上放着昨天的报纸，上面的日期是，1996年7月21日，发行馆是中学馆新闻社，平成8年。花井亚希子进行催促，“直子小姐相信社长一定会去救她的，所以她一直在等着。”
武居社长却舍不得那5亿元白白打了水漂，以及他宏伟的并购计划。花井忍无可忍指责，“钱跟直子小姐到底哪个比较重要？”武居社长无奈，“当然是直子重要些，如果她能嫁入横野家的话对我的帮助会很大。不过，这笔交易也很重要啊。”花井冷笑，“这次如果不成功，公司就会破产对吗？但是，公司是无法取代直子小姐生命的，你难道不懂吗？”
武居大吼，“公司是我好不容易才建立起来的王国，我不可以轻易放弃的。”花井讥讽，“这个王国是吸别人的血养大的……”武居大怒上前打了花井的耳光，“我的生意都是正当行为，没有违反任何法律。只有懦弱的人才会输，失败者只能怪自己不好。”花井的脸色变得严厉起来，门外偷听的柯南暗骂这个混账父亲，结果不小心弄出了声音。
武居和花井急忙出来观看，千钧发现不好，抓着柯南飞快逃了出去。到了外面，千钧叹气，“拜托，你小心点好不好，你看现在都被发现了，真是的。你说武居胜彦那个wbd会交付赎金吗？”柯南摇了摇头，“我看不会，喂喂，你难道不能出这笔钱吗？”千钧苦笑，“那是5亿元，不是五百万，我倒是可以从公司把钱借出来，但是手续太麻烦了，就是银行也不能一下子给出这么多钱啊，最快也要2天时间，当然转账的话就简单多了。”
柯南一愣，“是啊，绑匪也应该知道时间不够，奇怪，他们怎么知道武居社长手上刚好有5亿元现金呢？”千钧突然想起来，“花井曾经说过武居社长重视的只有金钱，他手上现金的具体数目知道的应该只有……”柯南也回忆起花井的手腕上有白色痕迹，那是游水装置留下来的。
二人对视一眼大惊，都觉得不太可能。千钧立即打电话给阿笠博士，请他帮忙调查一下花井的背景，阿笠博士抱怨现在好多东西都还没有放到网上，查起来有些困难。柯南恼怒，时间有些来不及了，千钧又打电话给静杨，询问花井的一些情况。静杨有些奇怪，“花井啊，直子曾经告诉过我，花井曾经有个叫做昌作的弟弟在4年前死了，她特别疼爱这个弟弟，所以对柯南这样的小男孩特别喜爱。对了，花井的父母好像也是因为生意失败自杀死的，所以花井在这个世上其实已经没有至亲的人了。喂喂，千钧，你不敢快想办法去救直子，怎么还打听花井的事情，都什么时候还乱想这些事情，混蛋……”千钧揉着耳朵挂断了电话，柯南觉得太好笑了。
花井发现武居社长准备的钱，大多数都是用报纸充数的，“你以为他们会上当吗？”武居低头，“不要再说了，现在也只能这样做了。”花井觉得自己已经仁至义尽了，就随着武居一起坐车出发，前去交付赎金。千钧开车带着柯南随后悄悄跟了上去，并打手机通知由美，让交通课的人协助暗中注意武居胜彦的汽车去向。柯南已经确定了花井亚希子就是幕后的绑匪，因为只有她知道警察的所有布置，以及武居社长手中的现金数目，她手腕上留着戴潜水手表的印子，也是最好的证明。