某个周五，小雅、静杨、直子从棒球社打完棒球后，换好衣服出来，却没有等到千钧过来，静杨抱怨，“千钧这家伙肯定去足球队踢球了，每次踢球都特别花费时间。”小雅笑着说：“不如我们一起看看吧，我好久没见到他们踢球了。”直子也没什么异议，“也好，催促他快点，我还等着他送我们回家呢，花井姐姐今天晚上特意做了一桌子菜等我呢。”三人就挎着手一起到了足球场地。
千钧、飞霄、普立、立彬、文良、会泽、中道这些家伙全都在这里，大声地呼喊，球场上不断飞驰着，终于哨声吹响，练习赛结束了，大家都累得够呛。文良等人也都看到了附近观看的诸女，当然云灵也来了。普立过来低声对千钧说：“喂，千钧，听说最近有外面学校的高中生在追小雅，你要当心哦。”千钧一愣，“不会吧，我们几乎天天在一起，我怎么不知道？”立彬好笑，“我们也是听你们班的园子说的，听说是个帅哥呢。”
飞霄也微笑，“据说那人也是个棒球选手，一次来我们学校观看棒球比赛，就被小雅的英姿吸引住了。”千钧心里难免有些吃味，会泽、中道也都过来证实了小雅已经收到情书了。文良与云灵打过招呼后，笑着打趣，“千钧，你要把小雅看好了，别让外校的人把咱们帝丹高中的美女给翘走了。”千钧摇了摇头，心说小雅早就是我的人，哪里那么容易移情别恋。
大家在更衣室换好衣服后，向外走去。刚好看见一个帅气的男生拿着一把鲜花走过来，向静杨躬身，“静雅同学，自从上次在棒球场见到你英姿飒爽的倩影，我就对你一见钟情，请你给我个机会吧，让我们交往吧。”千钧在稍远一点地方看得目瞪口呆，这个太直接了吧。静杨头上都是黑线，“啊，你确定要追求我吗？”帅哥一看有门，“是啊是啊，静雅同学，我是真心的，今天我打算请你吃饭，我们先认识一下好吗？当然如果不介意，你的姐姐和武居直子同学也可以一起过去的。”小雅在旁边捂住嘴笑起来，直子也莞尔，原来他就是给小雅写肉麻情书的家伙。
在众人惊讶中，“砰”的一拳，帅哥华丽的倒在地上，静杨收回拳头，“真是的，还说真心追我妹妹，连人都没有认清楚，这算什么嘛。”千钧他们也都走过来了，旁边的云灵也大为惊奇，“静杨？你和小雅的位置对调了啊，怪不得那家伙弄错了呢，连我们都混淆了啊。”千钧过来与三女分别拥抱，随后才弄清楚。
平时三女出入时候，通常是静杨在中间，直子和小雅在两边，今天训练完后三人都感到口渴，静杨就跑去买饮料，小雅就变成挨着直子站立，静杨将饮料交给她们两个后，就站在小雅边上，而姐妹两个总穿一样衣服，如果不开口说话，就是熟人也会弄混。帅哥从地上艰难爬起来，羞惭满面，居然第一次向人表白就弄错对象，在大家戏谑的目光下狼狈逃离帝丹高中，随后引起一片哄笑。
当日，帝丹小学，柯南也在抱怨自己这日子什么时候是个头啊，“我的名字叫江户川柯南，原本是高中生新一，被灌下毒药后身体缩小了，身体变小了头脑还是一样，是个无所不能的名侦探。”刚好，步美也在旁边一阵叹气，“我觉得最近真是闲啊。”元太也像受到了感染一样也打个哈欠，“是啊，最近都没有客户上门，亏我们还发了那么多传单。”
“这样下去，我们少年侦探团也就没有办法行动了。”坐在元太对面的光彦轻轻敲着着桌子。在一旁颠球的柯南嘲笑他们几个，“那是当然的喽，这么简单的有客户的话，侦探就不用这么辛苦了。”结果柯南遭到了团长元太的强力镇压，批评柯南作为侦探团一员没有集体观念。从a班过来的文乃摆弄着手里的少年侦探团徽章一脸失落，“我还特地请阿笠博士帮我也做了徽章，不过这个徽章真的好帅啊。”
这时门口进来了一个小孩子，“你们是少年侦探团吗？我有点事情想要拜托你们。”元太三人组兴冲冲的跑到了那个小孩的面前，文乃从后面走过来，“你是c班的浩树吧，找我们什么事？杀人事件吗？”步美把头伸了过来，“不是杀人，那是欺诈吗？”浩树张着嘴看着文乃和步美，摇了摇头。元太挥舞拳头大声说：“明白了，是有人勒索打劫吗？”再次被否定后，光彦捏着下巴一脸肯定的说道，“那一定是调查父母的外遇。”
“天啊，这样的事件会有人找孩子解决吗？”坐在一旁的柯南汗，这都什么乱七八糟的。浩树终于把张开的嘴闭上了，然后开口说道，“是我家的阿基拉昨天晚上突然不见了。”元太、步美和文乃同时惊叫起来，“咦，竟然是失踪事件？”没等浩树继续说下去，根据上次文乃被绑架的经验，光彦就自顾自的分析起来，“这应该是一起绑架事件，那个孩子长的什么样？”
浩树拿出了一张照片递给了他们，“什么嘛，”侦探团全是一脸失望，“竟然是一只猫。”元太摆手，“我们才不会接受这种小案件的，你可以走了。”步美嘀咕道，“我们可没时间帮你找一只猫的。”文乃也赞成，“没错，我们可是很忙的，你回家等等吧，也许那只猫会自己回去的。”光彦点了点头，“真是的，把我们侦探团当什么了。”大家就要转身离开，浩树从兜里拿出了几张卡片，“真是遗憾啊，我本来想如果你们帮我找到的话，报酬就是给你们假面超人的卡片！”说着晃了晃手里的卡片，“你们看，这就是我收集的假面超人的黄金卡片。”
已经转身的几个孩子在听到假面超人这四个字之后回头一看浩树手里的卡片，顿时尖叫起来，“这是相当稀有的假面超人的卡片，是超级黄金卡片！”元太看着浩树手里的卡片大声叫道。光彦急忙抓住了浩树的手，拼命点头说道，“这个案子我们接了。”
“嘭”正在颠球的柯南被自己的足球砸到了脑袋上，嘴角抽搐了几下，“喂喂，你们这是什么跟什么啊。”柯南一脸郁闷的嘀咕道，“我堂堂平成年代的福尔摩斯竟然陪着一群小孩子去找猫，而且报酬竟然是那个什么卡片。”步美听到柯南小声的自言自语就问道，“柯南，你在说什么啊？”
柯南急忙掩饰，“我在说，要什么时候才能找到那只猫啊，喂，你家的猫有没有什么特点啊？”浩树想了一下，“阿基拉和其他的猫不一样的地方是它的叫声很特别。”柯南这次真的被彻底打败了。随后大家开始寻找传说中的阿基拉，一路上侦探团还几次翻墙上树，各式各样的猫是找到不少，可浩树都说不是。柯南回忆起当年和千钧一起找狗的事情，忍不住露出笑意。
渐渐的天色晚了，大家都有些失望打算放弃了。“喵呜呜呜”情急之下浩树学起了自己家猫的叫声，然后众人听到了一声类似的叫声，浩树举起手指说道，“就是这个声音，阿基拉。”柯南四处看了一下，“刚才的那个声音是从那里传过来的，那栋房子那里！”于是带着众人跟随声音的方向跑到了那栋别墅门口。浩树冲着别墅门口对着里面喊道，“阿基拉！”别墅的一个窗户里真的探出了一只猫的脑袋，“没错，那就是阿基拉！”浩树一脸开心的说道。
当它全身都出来的时候，众人都吓了一跳，那只猫叫了一声跑到了浩树的身前，柯南抱起那只猫，仔细的看了看，“猫没受伤，这个血有些奇怪啊。”随后柯南让其他人都先回去，自己却偷偷从大门上跳了过去，将一个垃圾桶垫在了那个窗户的地下，向里面望去，一个浑身是血的人趴在浴缸旁边，头浸在水里。不满柯南总是单独行动的元太他们跟着柯南一起进来，看到这个场景吓得尖叫着跑掉了，柯南也跟着跑到了门口的电话亭，匆忙打电话告诉了目暮警官。听到这个消息是柯南说的之后，深信不疑的目暮警官立即带着人按照柯南说的地址开车冲了过去。
目暮警官过来后，“柯南，刚才是你打电话报警的吗？真的发现了尸体？”坐在电话亭上面的柯南帅气的点了点头，“绝对不会错的，目暮警官，而且我们发现尸体之后，就没有任何人从那栋房子的正门里出来，而且那个房子的后面，是个水渠。我一直在这里盯着。如果里面的人想要从后面运走尸体，动静一定会非常的大的，所以，尸体肯定还在那里面。”
目暮警官点了点头，“总之先去搜查一下他的房子再说！”随即带着这群小孩子来到了那栋房子的门口。“叮咚”一个穿着浴袍的中年人打开了门，看着门口的众人，“干什么？吵死了。”目暮警官将自己的警官证拿了出来，“这群孩子说在你的屋子里发现了一具尸体。”那个中年人惊讶的说道，“尸体？别开玩笑了。”柯南瞪着那个中年人，“不会错的，我们很清楚的看到了，就在那个浴室里面。”“没错，我们全看到了，流了好多血啊。”孩子们一起跳出来。
“这怎么可能，浴室的话，刚才我一直在用，走廊尽头的就是浴室了。”那个中年人解释道。“那么请让我们过去看一看吧！”说着目暮警官推开了中年人奔着浴室走了过去，柯南他们也跟着走了过去。结果打开门一看，发现里面是空的。柯南一脸诧异，“尸体，尸体不见了……”侦探团上下也大惊，“怎么会呢？刚才明明看到的。”
“呐，目暮警官，你们来到这里花了十五分钟，要清洗这个浴室的话，最多要十分钟就可以了。所以他肯定把尸体藏了起来。”柯南拽着目暮的手说道。目暮在听到了柯南的推论之后点了点头，“没错，藏起来一具尸体顶多十分钟就够了。”那个男人一脸怒气的吼道，“那么就请你们找吧，随便找，找到高兴为止，明明就是一些小鬼的恶作剧，现在的警察还真是清闲啊！我很累，回二楼睡觉去了。”目暮点了点头说道，“那么我们就开始搜查了。”“随便，我弟弟就快回来了，等他回来你有什么问题就问他好了。不过你们警察竟然把小鬼的恶作剧当真，还真是闲啊。”
于是警察就开始翻找了起来。“天花板，橱柜，都给我仔细的找，尸体肯定还在这个房间里面，不要放弃任何一个角落！”“是！目暮警官！”检查了一阵子之后，一个男人走了进来，跟着进来的还有一个警察，“报告，目暮警官，他的弟弟回来了!”看着自己的房间被警察搜的乱七八糟的，那个拿着手机的男人赶忙走到了目暮的旁边，“那个警官，这里发生了什么事情？”目暮指着柯南，“这个小孩说在你们家发现了尸体。”“尸体？这怎么可能？”“啪啦！”正在搜查房间的元太不小心将一个花瓶打碎了，目暮赶忙走了过去，“喂喂，你怎么这么不小心啊？”那弟弟急忙说道，“没关系的警官，这个东西不值钱的。”
“你们很吵，可不可以安静一点！”从二楼传来了一阵咆哮。那个男人走到了楼梯口向上看了看，“我哥哥现在在二楼吗？”目暮点了点头，“是的，他刚才说去二楼休息，看来相当生气的样子啊。冒昧的问一下，你哥哥是从事什么工作的？”“哦，我哥哥是一个作家，所以一般在家写作时间比较多，这是我的名片。”“田中知史？你在证券公司上班吗？那么说这个家里就只有你们兄弟二人了？”“是的，警官，我哥哥叫做田中和由。”
检查了一阵子之后，目暮看了看手中的笔记，“房檐，床铺下面都检查过了，现在只剩下你哥哥的房间还没有找，所以请配合一下。”“好，那么跟我来吧，我哥哥在那个房间，”说着田中知史就将众人引到了他哥哥所在的房间，“哥哥，我带警察进来了啊。”开门一看，田中和由正坐在凳子上看电视，身上盖着浴袍，于是田中知史走到哥哥身旁，看了一下，对着目暮说道，“哥哥已经睡着了，请你们小声一点。”
目暮点了点头，就开始检查起了田中和由的房间，然而让目暮警官大为失望的是田中和由的房间同样没有找到任何线索，目暮警官让随行的警察甲乙爬到屋外的大树上进行查找依然是一无所获。田中知史露出嚣张的笑声，目暮警官也是大为生气，又让那两位警察到房后的水渠附近进行了寻找，结果依然失败。目暮警官不得不认为侦探团谎报军情或者是恶作剧，把柯南等人教训一顿后收队离去，侦探团灰头土脸从里面出来，还被田中知史大声讥笑。
元太恼怒，“可恶，柯南你快想办法，我们侦探团不能就这么认输的，这样下去就名誉扫地了。”文乃也奇怪，“是啊，我们大家都看到了尸体啊，为什么就是找不到呢？”光彦也努力思索，“会不会被外星人带走了？”步美好笑，“真是的，光彦，那家伙又不是鼹鼠星人，能把尸体藏到洞里。”柯南也有些头疼，猛然想起千钧说的一句话，专业的事情就要找专业人员来解决，于是拿起徽章呼叫千钧。
千钧接到柯南的呼叫，就知道这家伙肯定又惹出事情了，立即开车赶过来，这时他已经把新庄姐妹、直子她们各自送回家了。“什么？你们说尸体不见了？”千钧问明白情况，“那个猫身上的血让鉴识人员检验了吗？没有啊，那田中知史兄弟的详细情况调查了吗？也没有，我的天啊，这个还真草率啊。”柯南听他这么一说，也觉得有些疏忽了，尤其是猫身上的血，是人血还是动物的血还是很容易检验出来的。千钧无奈，现在目暮警官已经收队走了，自己只好继续一下老本行了。
千钧在侦探团惊讶的眼光下带着柯南轻易翻过围墙潜入田中宅，在柯南指引下来到了田中和由的房间，柯南奇怪这家伙怎么老半天还在睡觉呢。千钧却明显感觉到田中和由身上已经没有了生命磁场的正常波动，波动已经趋近停止状态，可能已经死了很长时间了。千钧的生命磁场感应，能在人死亡开始就能够发现生命磁场会逐渐减弱，随着尸体体温下降到最低点时磁场就会完全消失。千钧就告诉柯南这个人好像已经死了，柯南也大惊，急忙过去查看，果然已经死掉了，那么刚才警方调查时又是怎么回事？千钧也想起今天在学校发生的事情，“柯南，你说田中兄弟会不会也是双胞胎，把你和目暮警官骗了过去？”柯南眼睛一亮，终于明白了问题出在哪里。
这时候田中知史发现屋子里有声音，拿着棍子过来查看。柯南冷笑着开始进行自己的推理，“你把哥哥的尸体洗干净后让尸体穿着浴袍坐在二楼的椅子上，你很大胆，改装成被杀死的哥哥，然后出来迎接过来寻找尸体的警察。接着趁着警察在屋子里搜查的时间，从二楼的窗户爬到树上再跳到围墙的外面去，再以弟弟的身份若无其事的从外面回到家里来。利用房间里的录放机、电话答录机，还有利用你手上的手机，可以让人以为是二楼的哥哥在怒吼。”
田中知史大惊失色，“你到底是什么人？为什么会看破我的计谋？”“柯南，我是一个侦探，真相永远只有一个。”愤怒的田中知史挥舞着棍棒冲了过来，千钧亮出了七夕剑，轻易将其击倒在地，千钧捡起他的手机，叹道，“果然藤笠制造，必是精品啊。”柯南汗，这个日本现在市场上流通的手机80%都是藤笠公司出品的，不过这个公司名字可够搞笑的，不知道还以为生成斗笠的。
随后接到千钧电话，目暮警官再次赶来，看到死在椅子上的田中和由，就立即将田中知史正式拘捕。原来，田中和由因为掌握了弟弟田中知史进行不正当股票交易这个弱点，而威胁其要养自己一辈子，没想到最后却被愤怒的弟弟所杀害。随后，面对脸色很难看的少年侦探团，目暮警官笑着进行了道歉，表示自己以后会相信侦探团的。目暮警官在被侦探团奚落完后，擦擦冷汗，“千钧，你搞什么啊，怎么又私自闯入民宅了，跟你说过多少次了，要先向我报告。”千钧急忙推月兑，“拜托，我只是例行调查，哈哈，你看这不，案件都解决了。”目暮警官无可奈何叹了口气，邀大家回警局去做笔录。
尾声，田中知史因杀害兄长田中和由情节恶劣，被法庭判处7年徒刑。少年侦探团因破获尸体神秘消失案件，被警视厅给以b级奖励。过了两天，侦探团抱怨上次擒获凶手竟然没有一夜成名，浩树又来向少年侦探团请求找猫，而且强调阿基拉不是普通的猫。结果最后证明，那只是一只喜欢捉迷藏的普通小猫，柯南悲愤地大叫我要疯了。