面對如火如荼的發展形勢，復興軍終于整編到二十個甲等師，二十個乙等師，並取消了民兵建制，因為根據新的體制，復興黨將不會再直接掌控地方政權，浙江、台灣、南海、山東等地也將和上海一樣，通過孝廉選舉產生各省布政使和法司。
當然，復興黨作為一個有著共同行動綱領的政黨，黨代表大會暫時還保持這對各省行政的協調權，李彥作為黨魁，同時也擔任復興軍總統領，依然保持著對軍權的控制，對政權的影響，而分別隸屬于諾貝爾財團的基金和隸屬于復興黨的復興基金，又控制著大量的工礦企業，經濟命脈。
原屬于總督府的各部門，順利轉成復興黨黨部的有關機構，大量官員開始外放，以切實控制地方，推行新政實施，在上海政改以後，浙江、福建也基本以同樣的模式進行了調整。
五月，聯盟首次聯盟大會在上海召開，之所以選擇上海而不是南昌，顯然是與李世賢比較起來，復興黨更讓湘淮放心，而在這次聯盟大會上，雖然以五省聯盟的國士大會為核心，但十幾個行省的代表，以及三大黨派正式亮相，構成了未來政治權力分配的基本格局。
江西、福建、廣東、湖南、江北五省都已經完成了四級選舉，按照新的選舉模式，州縣選孝廉、府道選賢良、行省選大夫、聯盟選國士，孝廉、賢良、大夫、國士構成四級民主的基礎。
聯盟首屆國士院由五省選出的國士擔任，名額平均分配。每省都有十個名額，這五十個人也成為聯盟最高權力地掌控者，即便是已經定下的內閣宰相李世賢在這個時候，權力也遠遠不如國士院。
在這五十個人當中，只有十六名復興黨成員。其中福建省六人，廣東省五人，江西省三人，江北兩人，福建省剩下的三名國士中，還有兩個太平黨人，一個儒黨成員，還有一個無黨派；廣東、江西剩下的都是太平黨人，一共是十二人；而湘淮組建的儒黨，除了湖南十人、江北八人。還有福建一人，一共是十九人。
從國士名額地分配便可看出三個黨派目前的路線，復興黨相對更加開明，除了優勢明顯的福建，在廣東也擁有相當的影響力；儒黨不愧是文人精英，不僅牢牢控制了湖南，在江北也只是給復興黨留下兩個名額，其路線非常保守。而太平黨組織經驗相對不足，加上在廣東、江西復興黨又確實有較大的影響力。畢竟近半地盤本來就是復興黨讓出來的。所以兩省也讓復興黨拿下八個國士席位。
如此一來，儒黨儼然成為國士院第一大黨，但是葉楓和李世賢達成協議，復興黨和太平黨組成聯盟，卻又超過儒黨，獲得組閣權，李世賢順利成為聯盟內閣宰相。
不過首屆內閣的特殊性決定了三方都必須妥協，這實質上還是一個三黨聯合內閣，除了李世賢成為宰相，太平黨還拿下了農林部、戶部、兵部。復興黨則據有外務部、文宣部、產業部等重要部門，儒黨則有商務部、刑部、內務部，每黨佔據三個部門。
傳統來說，戶部、兵部、刑部、內務部，包括商務部、文宣部都是很重要的部門，而外務部、產業部、農林部似乎就不是那麼重要，因而復興黨在內閣中的權力並不大。所以在法司部門就得到了彌補。當然這也是葉楓的交換策略，另外懂新法地也基本都是復興黨的人。太平黨和儒黨也缺乏相應的人才，所以大理院、按察院的院丞都是復興黨人，隸屬于國士院的都察院、立法院分別由儒黨、無黨派人士擔任，不過這個無黨派人士容閎也被看成是復興黨人。
在法司機構中一無所獲的太平黨則佔據了國士院院丞的位置，總的來說三方對權力的分配保持了平衡，都能夠滿意。
而在各部院司下屬吏員地選擇中，復興黨提出了任人唯賢，專業對口地原則，容閎作為立法院院長，將一份官吏任用升遷法作為首份法案提交國士院表決通過，成為行政原則，並由都察院監督執行，而在復興黨掌控下的按察院也會特別關注，以確保該法得到切實執行。
首屆聯盟國士院和政府形成以後，逐漸開始運轉起來，特別是復興黨一批有著新政經驗的官吏加入，讓這個由三方妥協而成的權力框架逐步豐滿起來，而他們面對的就是一個新政權建立以後的內政外交，另外還有緊接著召開的行省大會。
按照當初佔領北京以後全國通電所確定的原則，加入聯盟的行省包括聯邦省，也就福建、廣東等五省，還有自治省，包括浙江、廣西、四川等都是自治省。
而在這次大會上，在看到聯盟用一種新的方式開始運轉起來以後，不管是出于何種目地，很多行省都提出加入聯邦省的申請。
按照公約的規定，加入聯邦省就可以在國士院中擁有相應的席位，進而影響內閣和法司，而不加入的話，雖然擁有地方自治的權力，卻不能擁有國士院的席位。
當然，地方自治似乎也不錯，但問題是你不加入有人要加入，至少復興黨明確提出在這次會議上讓蘭芳行省、上海道先行加入，這樣就會產生至少十五個國士地名額，如果太平黨、儒黨不做出應對，那麼大家在國士院地平衡就會打破。
實際上太平黨遠遠要比復興黨更激進，他們希望讓廣西、雲南、貴州三省都加入，而在徹底和洪秀全開始爭奪教義的主導權以後，李秀成也提出加入聯邦省，不過他可以等到年底。
另外還有新捻軍控制地河南，他們也提出加入聯邦省，並考慮成立獨立的捻黨，又在和太平黨、復興黨接觸，看看是不是能加入兩黨之一，因為光憑他們自己，勢力也太單薄了些。
面對這種情況，儒黨自然不能無動于衷，最後大家商量的結果，還是在這次控制聯邦省的規模，先接收五個行省，也就是捻黨的河南、儒黨的湖北、太平黨的廣西，以及復興黨的蘭芳和上海。而待這些地方完成選舉後，即可擁有國士院的席位。
湖北、廣西的選舉還要準備，上海的政改已經完成，讓上海道賢良閣選五個國士出來，是很簡單的事情，同樣的情況還有早就實行共和制的蘭芳，以及改組後的新捻軍，都可以很快派出國士進入國士院，國士院勢力對比的變化，又勢必要刺激其他省份盡早完成政改，已加入國士院。
大會以後，聯盟將擁有九省一道，並且多是東南精華之地，可以說如果能整合好的話，那麼確實可以說是一支強大的勢力，只不過現在看起來，這個龐大的軀體還處于內部分裂狀態，要彌合並不容易。不過，這種彌合畢竟是在進行，黃勝擔任聯盟文宣部尚書，著力將報社、新式學堂開設到湖南江北，復興黨的新式學堂雖然主要講新學，但是對傳統也很重視，特別是有馮桂芬這個教的長老在，學堂對傳統的延續做得很好，儒黨中的湘淮精英都知道新學的重要性，倒也是並不反對，但也對傳統儒學教育提出很多意見，多少有些踫撞，卻能在矛盾中變化發展。
太平黨對新學也很歡迎，特別是職業技術學堂，不過太平黨從平民角度提出意見，希望學堂教育可以更多的免費，本著中國歷來重視教育的傳統，這個提案也在國士院得到通過，並付諸執行。
當然最為難的還是掌握著財政大權的戶部，太平黨雖然掌握著這個管錢的部門，但實際上大部分經濟來源還控制在各省和復興黨手中，而且戶部的大額撥款和項目預算都必須經過國士院審核通過，限制了戶部亂花錢的可能。
至于報刊的發行引起的爭議就比較大，黃勝將時報確定為聯盟官方報刊，又提出了新聞自由的法案，這個法案的核心是清流議政，不以言罪人，但實質上範圍非常廣泛，基本是定下了民間言論自由的原則。
除了時報，原本在各地私底下流傳的報刊開始正式浮出水面，公開發行，很快就引發了一些爭論,而其中影響最大的，便是關于如何處置滿清皇室的問題。