與鋪天蓋地的宣傳相比，軍的步伐也沒有停止，沿海的船只緊急動員，第一師第三旅直接在上海登船，首先在開山登陸，與淮安、贛榆三路大軍齊齊壓下海州，雖然人數不算多，但一個主力師的戰力，也足以對海州四萬多清軍和團練雜牌形成巨大的壓力。
同時受宣傳攻勢的影響，海州的清軍軍心很受影響，對贛榆的進攻也緩了下來，陳國瑞本身就是降將，若說太平軍和捻軍的話，他只有拼死作戰，但軍卻不是死敵，而且同樣是太平軍降將的程學啟在投降清軍後又投降軍，如今還是第六師打過來的這個旅中的一個營長，所以在大兵壓境的情況下，陳國瑞並不打算死戰到底。
何況在贛榆的攻防中，無論是海州鹽商抑或是陳國瑞都驚駭地見識到了軍凶猛的活力，披著鐵皮的鐵甲艦向陣地上傾瀉的大口徑炮彈足以讓大地顫抖。
海州的鹽商們作戰意志也不堅定，在方面承諾保護他們的財產以後，已經表露出投降傾向。
待到北京的消息正式傳到海州，第三旅在開山登陸，陳國瑞和鹽商們很迅速地放下了武器，選擇投降。
按照參謀部的計劃，十八旅留在海州休整，同時對陳國瑞部和鹽商武裝進行整編，整編一個警備師和一個民兵師。第三旅、十七旅三營向沐陽方向攻擊前進，十七旅一營、二營向泗陽方向開進，十六旅沿範公堤進入淮安府。接手十七旅防地，通州、揚州府一帶，則從上海調新整編的第八師渡江北上，各部梯次發展，滾動前進。
十一月二十三日，第七師陸續在海州登陸，隨後向山東前進，直插清廷大本營。
直到此時，忙著清理政敵以及通過加官進爵穩定人心的清廷還沒有反應過來。
十一月二十五日，軍佔領海州全境。以第一旅、第十七旅兩個旅地兵力壓迫徐州、泗州一帶。
十一月三十日，第七師攻佔沂州，打開山東門戶。
十二月一日，第八師在整編中進入興華，劍指揚州，李秀成攻佔泰州。
與此同時，在陳玉成的策劃和串聯下，得到軍的太平軍沿長江發起全面進攻，陳玉成反攻江浦；楊輔清反攻和州、含山。李世賢也再次發起對武昌的攻勢。
清廷不出意外地加封曾國藩為兩江總督，全權處理江南軍務、政務，不過此時的江南也僅余湖南而已，其它李鴻章為四川總督，駱秉章為兩廣總督。官文為湖廣總督等並沒有太大的變化，只是在虛餃上都有提高。
雖然從四川總督到安徽巡撫品級上是一種下降，清廷的目的是要讓李鴻章回頭穩定皖中的戰局，所以還是給了李鴻章兵部尚書的頭餃。而曾國藩雖然是兩江總督，但實際上還是在湖南應對湖廣地戰局。
北京政變的消息傳出以後，經過方面的刻意宣傳，在朝野之間造成的影響是巨大的，雖然還沒有地方官直接宣布倒戈。但是向投效的讀書人倒是一下子多了起來。軍在地方上也更容易被接受。
等到軍和太平軍聯手發起全面攻勢，清軍一敗再敗，清廷連忙作出應對，緊急抽調李鴻章回兩江戰場，加封其為江北總督，統轄江蘇、安徽北部軍務，又調駱秉章為四川總督。防備石達開再度入川。加曾國藩為江南總督，署理兩廣、湖南、江西及安徽、江蘇南部軍務、政務。看起來權力很大，實際上真正能控制也只有湖南，又加胡林翼為湖廣總督，調官文為陝甘總督。
可以說面對在輿論和軍事上的全面進攻，北京方面也有些惱羞成怒，這次封授和前次有明顯的不同，大多都得到了實權。
同時清廷也命令多隆阿、僧格林沁盡心作戰，又以勝保為直隸總督，部署山東、河南一帶防務，又從關外、蒙古抽調大批兵力南下，務必將軍打回長江以南。
「李鴻章和曾國藩有什麼行動？」杭州的總督府內，葉楓一直在關注著前方地訊息，雖然從目前來說，軍的動作很大，不過總體上還是比較謹慎，並沒有一下子直搗黃龍。
「曾國藩與胡林翼全面接手湖廣軍務以後，已經將李世賢擋在武昌外圍，趙烈文現在希望我們保守承諾，因為曾國藩已經是湖廣總督，所以雙方應該在湖廣的地面上保持和平，」馬建勛作為機要秘書，開始參與軍務，向葉楓匯報最新的情況。
「曾國藩還是江南總督呢，難道我們要將江南的地方都讓給他？」葉楓不置可否地笑了笑，問旁邊負責和趙烈文接觸地王運︰「曾國藩那里談得怎麼樣了？」
「進展不大，曾國藩要求保留軍隊，在地方自治的問題上，也還是有一些分歧，曾國藩並不願意在地方上實現共和，」王運道。
葉楓想了想︰「罷了，這個可以先答應他，如果別的省都實行共和制，我不信湖南能獨善其身，至于軍隊的話，也可以保留，不過必須限制數量，最多不超過兩個主力師，具體你們再商量看，模清他們的底線，李鴻章呢？」
「李鴻章可能和駱秉章有默契，不能駱秉章進四川，就已經帶著幾個營趕往安慶，李鴻章的要求和曾國藩也差不多，」王運道。
「那就一並答應了，不過要求他們要通電，」葉楓笑著說道。
「總的說來，目前為止的行動都是挺順利地，但是我們也不能放松，除了徽州地第四師可以抽調出來，第五師要向廣東集中，第二師也要適當向贛州第三師靠攏，這三個師的任務就是看住湘軍和香港的英國人。」
「整編中的第十師和第四師負責滬杭戰區的守備，抽調一個旅進駐上海，另外第一旅已經準備好了吧？」葉楓道。
「已經準備好了，隨時都可以出發，」顏永京道。
葉楓點了點頭︰「那就按計劃行動。」
在的軍事部署中，三個主力師放在廣東、江西一帶，完全不用擔心湘軍玩什麼花樣，兩個主力師擺放在杭州、上海一帶，防備英國人或者李秀成有什麼異動，第八、第六、第七三個師在江北一線排開，加上第一師、第九師作為戰略預備隊。
「參謀部擬定的計劃是，在新年以前發起對揚州、徐州、袞州地戰役，確保攻取揚州和徐州，打開北方地門戶，而在山東戰場上，則以調動敵軍為主，待清軍主力結集于濟南、袞州一線時，再有一軍在膠州登陸，使其月復背受敵，」趙勇描述了參謀部的作戰計劃。
考慮到下一階段主要是軍事行動，所以在三大戰役中，江北地警備軍將協同作戰，而不僅僅是守備地方，因為此時正是清廷動蕩的時刻，趁著這個機會，完全可以給予清廷狠狠一擊，就算一時半會不能將其打死，也足以改變形勢的對比。
由于這段時間美國內戰和英國人從中作梗，軍從外部購買的軍備數量有所下降，由于軍工廠優先保證國防軍的需要，所以江北警備軍的裝備一下子還不能滿足，何況就算能裝備上，一時半會也難以形成戰斗力。
不過在降低要求的情況下，主要使用冷兵器的江北警備軍人數卻是不少，僅僅是降軍和各路義軍就有近十萬，也難怪李秀成跑到湖北一趟就帶回十幾萬，清廷倒行逆施，民不聊生，天下早就亂了。
雖然簡單的整編並不能從根本上改變這些軍隊的作戰能力，主要是紀律上的整頓，以及兵員的挑選，經過整編以後，配合良好的兵餉和後勤保障，這樣的軍隊戰斗力也要高出一般的清軍很多。
以國防軍為主力，以整編後的警備軍沖鋒陷陣，成為三大戰役中的標準戰術動作。
在戰役發起以後，首先撐不住的還是揚州，本來就有李秀成的配合，兵力上有絕對優勢，結果就是當面清軍紛紛脆敗，李秀成佔領江都，軍佔領高郵。
楊輔清、陳玉成也成功佔領了和州、江浦、六合，重新建立起天京的江北防線，不過在李鴻章重新進入安徽以後，又將當地團練的幾個營補充進入淮軍，淮軍顯得益發龐大，又對太平軍展開了全面反攻，雙方在滁州、廬州一帶大打出手。
而且李鴻章還趁著軍會戰徐州的時候，讓淮軍進駐泗州、宿州一帶，並要求軍信守承諾，不得進入安徽。