在詢問父帥孫烈臣意見之後，孫晉與榮三爺權衡利弊，決定聯合阜新所有的行會發起了關于以東北藥業和阜新煤礦為首的阜新商會支持東北建設和建立強大奉系軍隊的倡議，阜新商業聯合會決定支持省政府關于阜新征收稅收由去年征稅70萬大洋增加到210萬的決議，其中東北藥業承擔100萬大洋、阜新煤礦40萬，並通電東北三省呼吁所有商會全力支持張作霖提出的‘建設東北、強我奉軍’的決議。第三天孫晉收到父帥孫烈臣的密電︰舍得舍得，有舍就有得！一個星期後，張作霖帶著省政府一干人等來到阜新視察，在榮三爺的引領下興致勃勃地參觀了東北藥業、阜新煤礦及阜新最大的住宅小區︰幸福小區和巴黎風情別墅區。
巴黎風情別墅區是孫晉控股的建築公司承建的，聘請了幾個法國設計師專門按照法國人藝術風格建築的。法國人打仗不咋的，但是設計起這些別墅風格卻不是蓋得，第一期工程30棟剛完工就被阜新市富紳商賈搶購一空；現在第二期100棟別墅正在收尾階段，已經銷售了70%，大部分是被東北三省有權有錢人家訂購了；現在這個巴黎風情幾乎名聲在外，連許多前清滿蒙王公貴族都派人來詢問，孫晉立馬決定要求法國設計師以蒙古包為主調設計，結合西歐元素再建65棟，以滿足前清蒙古族滿族有錢沒有權力的王公貴族的需要。巴黎風情讓不但孫晉掙得滿盆金幣，也帶動了阜新市整個經濟商業的繁榮，相關的產業企業一個接一個開業，呈現蓬勃發展。
張作霖對巴黎風情的別墅非常感興趣，特意參觀幾處別墅，不住點頭稱贊！對孫晉連連夸獎。在阜新市人民議會大禮堂里，張作霖當著全市政府官員和商會代表及議員，表彰了東北藥業的義舉，明確要求東北三省的商家響應東北藥業的義舉和號召，全力支持建設大東北。對榮三爺也進行表揚，表揚他能迅速的完成省政府下達的任務，省政府將其納入優等考核之列。
下午張作霖出席了阜新商會會長改選現場，在張作霖暗示下，阜新商業聯合會通過了大恆通掌櫃潘三元為新的會長之決議，並修改了一些商會的章程，讓商會更加獨立自主的維護自己的利益；晚上張作霖參加阜新商會舉辦的晚宴，晚宴上潘三元代表阜新商會向省政府提出建議︰阜新海州煤礦由官辦改為商辦。張作霖與王永江協商一下，認為海州煤礦是省政府控股的企業，官僚作風盛行，煤礦利潤低，覺得由商辦更好，政府部門收稅更多；當即要求王永江回去後與商業廳拿出一個方案來，把政府控股的股份全部賣掉，改由商辦；王永江表示同意。
晚宴氣氛融洽而隆重，賓朋滿座，相互敬酒，商會的掌櫃不失時機的與張作霖、王永江等頻頻敬酒，拉關系混個臉熟。而宴會塊要結束時，省長王永江接到一份吉林孫烈臣發來的電報︰晚上九時許，日本關東軍突然浸入吉林琿春地區！張作霖當即匆匆離開返回奉天。
民國九年十月二日，旅居中國的朝鮮革命黨人樸東明、金永植等數百人襲擊了吉林琿春的日本人，並焚毀了日本駐琿春領事館，殺死日本人數名。日本即以此為借口，無視中國主權，于5日擅自派兵1萬多人由朝鮮向延邊及琿春地區進犯，並無理要求中國方面出兵配合鎮壓延邊人民。東北最高統治者張作霖派出3000多名士兵協助日軍從北面向延邊地區進軍，並應日本的要求派其顧問町野武馬會同孫烈臣，制定了與日本「會剿」延邊反日人民的8條措施。佔領了環春城及附近各縣後，日軍采取報復手段，對旅居中國的朝鮮人及當地中國居民肆意屠殺，焚毀村莊。8日，日本外務省才發表出兵中國聲明書；9日，向北京政府外交部提出照會，要求允許其出兵延吉，以會同中國剿匪和取消朝鮮獨立黨活動。中國政府表示︰中國已派地方官出兵保護日僑，日本毋需出兵。但日軍數千人已經進據延吉、和龍、汪濤、東寧、寧安等縣。北京政府為此而向日本提出抗議。
全國各大城市大學生紛紛示威游行，強烈抗議日本軍人無視中國主權，悍然侵佔我國領土。孫晉看到報紙上連篇累牘的抗議，不由的哀嘆︰弱國無外交！當天發電給南滿株式會社駐阜新辦事處︰以時機不對推遲東北藥業與南滿株式會社的合作談判。因南滿調查部指使葛天霸搶劫東北藥業的貨物，孫晉將青木一郎送給張作霖處理後當即宣布東北藥業與南滿株式會社合作暫停，雙方商業關系跌入低谷，但沒有破裂，只是處在冷戰階段。孫晉不著急，東北藥業現在訂單多著呢，可日本人著急啊，上次日本人花了130萬日元的貨物運到國內，就被搶購一空，大部分是軍部買去了。國內催著南滿株式會社再進購一批，野村龍太郎也沒有辦法，只得請張景惠做中間人重啟談判，在張景惠的撮合下雙方同意談判。
孫晉現在也沒顧得上野村龍太郎如何著急。自榮三爺主政市府以來，孫晉大部分時間放在阜新制藥廠上，經常到各個車間視察作業流程，與車間師傅聊天，與工人們同吃一桌；了解那些外國技師的想法和建議。通過一段時間深入調查，孫晉還是發現不少問題，特別是原材料損耗太大，次品增多，浪費了不少藥材和時間，生產效率低下。孫晉把主管生產的掌櫃找來問，負責生產掌櫃的說是不可能啊，這已經是高效生產啊，若是藥房手工制作更慢啦！孫晉後來找到榮三爺說到此事，榮三爺也是吃驚，說孫晉還不知足啊，這已經是相當快了。孫晉後來一想，才明白是怎麼回事︰時代眼光不一樣了。榮三爺和生產掌櫃的認為機械生產比藥房手工制作快了不知多少倍，但孫晉是用前世眼光看待的，見過大企業生產效益，相比較之下，覺得東北藥業現在浪費挺大的，要不是市場供不應求，利潤絕對會下降。
通過孫晉不斷細致的探索，與工人師傅一同研究如何提高生產效率，大家你一言我一句的獻計獻策，從各個生產環節細致入手，杜絕人工操作人為因素，制定各種操作細節規範，完善崗位職責、獎罰制度和工人的福利制度，既保證了生產效率的提高，又做好秘方的保護工作。孫晉想起以前有部電視連續劇《大染坊》，陳壽亭不用溫度計測試水溫用魷魚試，堵住無孔不入的間諜的窺探。
東北藥業實驗室主管**曾告訴孫晉，傳統藥物方劑的組成有君臣佐使四類藥物；所謂「君臣佐使」，即從多元用藥的角度，論述各藥在方中的地位及配伍後的性效變化規律。它高度概括了中醫遣藥組方的原則，是七情配伍的進一步發展，對學習研究中藥成方和指導臨床合理用藥具有極其重要的意義。
1、君藥︰即在處方中對處方的主證或主病起主要治療作用的藥物。它體現了處方的主攻方向，其藥力居方中之首，是組方中不可缺少的藥物。
2、臣藥︰是輔助君藥加強治療主病和主證的藥物。
3、佐藥︰意義一是為佐助藥，用于治療次要兼證的藥物，二是為佐制藥，用以消除或減緩君藥、臣藥的毒性或烈性的藥物，三是為反佐藥，即根據病情需要，使用與君藥藥性相反而又能在治療中起相成作用的藥物。
4、使藥︰意義一是引經藥，引方中諸藥直達病所的藥物，二是調和藥，即調和諸藥的作用，使其合力祛邪。
如世界有名的雲南白藥，這副方劑一般人不知道，只是有人猜測三七是主藥。後世日本人曾有顯微儀器、光學原理對雲南白藥進行觀察，但是就是沒有發現這副方劑的具體成分和配制，雲南白藥藥方和制作工藝被國家列為最高機密保護。這就是中藥的魅力。
而中藥材制成西藥，就得是運用中藥化學即是一門結合中醫藥基本理論和臨床用藥經驗，主要運用化學的理論和方法及其它現代科學理論和技術等研究中藥化學成分的學科。比如這個板藍根注射液，板藍根中藥成分的一般提取、分離方法，結構測定的一般程序；研究中藥化學成分時，提取、分離、鑒定是必不可少的三個步驟。首先是把化學成分從藥材中提取出來，其產物含多種成分，即為復雜的混合物，然後經過初步分離純化及進一步分離得到達到一定純度的單體成分，才能進行結構鑒定。板藍根注射液提取法主要分為水蒸氣蒸餾法；這個水蒸氣蒸餾法關鍵的要掌握這個溫度和水壓，否則全功盡棄。
孫晉根據這個原理，在制藥設備上做文章︰要求設備廠家將衡量溫度和水壓的指示針和數字進行修改。比如提取板藍根主藥化學成分需要120度，超過低于皆不行。孫晉在溫度顯示器上只有10度、50度……100度，沒根本就沒有120度數字；原因是孫晉利用前世進修過機械制造的知識，拜訪了不少專家教授特制這個溫度顯示表。當溫度指示針到達100度位置時，其實制造設備的溫度已經是120度了，當別人用100度提取時也就提取不出來了。再加上這個崗位的工作人員都是信得過的，即使被別人拉下水也沒關系，你只能知道是100度，等待餓結果注定是失敗的。因為知道這個秘密只有實驗室和孫晉、榮三爺等幾個人。這也是孫晉不擔心秘方泄露的原因。
經過孫晉與各位技師、師傅、工人不斷努力探索與實踐，東北藥業也研制了一套比較成熟制藥行業流程，將技術、機械設備、人力三者緊緊連在一起，形成良性的生產流程圖，東北藥業生產效率迅速提高，利潤也是水漲船高了。現在孫晉感到最緊迫的是急需大量的醫學化學生物學的人才，特別是化學。但是數理生物化醫這些自然學科又是急不得，需要層層遞進的學習再學習。