就在鍋王沉浸于即將實現宏願的幻象中時，直接參與進手術流程的魂器「昭鏡」卻在山田院長的遠程操控下抽絲剝繭，逐漸向影響忍者世界運行的終極真理靠近！
不同于被堅殼重重包裹的靈化術使用者，眼前正被一點點擠出肉身的富岳的靈魂正將查克拉與生命體之間最單純也最神秘的聯系毫無保留的呈現在總司眼前。
作為外星人輝夜姬通過神樹改造世界、控制世界的關鍵通道，這份連接對總司的價值，甚至比所謂的三大童術、仙人之體更加關鍵！
尤其是在他利用魂器制作精要間接參與到生命創造這個過程中後，山田院長對輝夜姬究竟是如何將極具個人特色的烙印與本地原始能量進行強綁定的操作充滿好奇。
畢竟生活在神樹時代的遠古先民們獲得各種「異能」，還能用受到神樹的影響對查克拉產生天然親和來解釋，但隨著羽村羽衣兩兄弟大義滅親把輝夜姬連同神樹的軀殼一並送上月球，忍者世界究竟為什麼在其後的上千年時間里依然長期保持著查克拉的傳承，遲遲沒有發生劣化效應？
基于這種反常的現象，總司在經過長期的研究後提出了兩種背道而馳的解題思路。
其一，是當年輝夜姬通過神樹對地球原始能量的修飾已經突破了某個臨界點，以至于整個世界現存的能量中，帶有外星人印記的查克拉已成為絕對主流。
這就解釋了為什麼既然神樹這個轉化器消失後，整個世界仍舊按照被輝夜姬改造後的框架繼續運轉︰新的自然規律已經形成，受到排斥和侵蝕的反而成了其他包括仙術在內的能量運轉模式。
在環境被動篩選的情況下，適合使用查克拉的忍者在生存競爭中取得優勢，進而在雙向選擇的過程中逐漸對後代進行品種改良，這才最終創造出了眼前這個燦爛輝煌的忍術文明！
亦即是說，大環境中查克拉的儲備量遠高于其他種類的原始能量，提取難度又相對較低，因此整個世界才呈現出被忍宗壟斷的趨勢。
但鑒于三大聖地都留存著獨特的仙術傳承，且原著中刻畫最多的妙木山仙術使用者也從來沒有表示「自然能量」在自然環境中存在的數量和查克拉有什麼區別，這種「能量優勢學說」似乎又存在其局限
畢竟自來也、波風水門、太子在修煉仙人模式時遇到的難點都是平衡三種不同能量的比例，而非吸收自然能量的過程本身。
而從實戰出發，三人更是都能做到在各種復雜環境中開啟仙人模式！這似乎進一步證明了所謂的「優勢能量地位」不過只是一廂情願的後驗性假設，並不成為與客觀事實相符的普遍真理。
在這種情況下，山田院長又提出了第二種出發點完全相反的猜想。
或許當初輝夜姬配合神樹首次發動無限月讀後，並不是直接針對地球存在的原始能量進行修飾——龐大而狂躁的能量無時無刻不存在于變化之中，想要憑借外力強行矯正，那幾乎意味著從底層設計層面徹底顛覆整個世界的運行規則，這與大筒木一族實際表現出的能力並不相符。
既然如此，或許當初輝夜姬控制祖之國和彼之國後並不是針對原始能量本身進行改造，而是針對那些被她控制的人類進行了改造！
眾所周知，利用神樹伸出的根須與觸角，大筒木逐漸模索出了一套具備輝夜特色的能量使用規範，亦即「查克拉」系統的雛形。
假如輝夜姬選擇的是和後來的六道仙人同樣的做法，慢慢依靠言傳身教傳播查克拉的使用方法，培養潛在的查克拉受體，那麼實在很難想象她到底要有多因材施教才能夠維持神樹如此巨大的定期獻祭消耗。
而如果直接從本質下手，通過無限月讀控制並改造一批人類先祖的靈體，使他們在靈魂層面產生能夠穩定遺傳的吸收處理查克拉的虛擬器官，那麼後續的工作量自然大大降低。
也就是說，不是自然環境讓人類種群產生了優勝劣汰的發展進化，而是人為干涉的「基因」反過來限制了忍者能夠使用的原始能量的種類！
于是乎在失去輝夜姬與神樹的這千年時間里，成千上萬的大小忍宗不僅僅是查克拉的使用者，同時也是查克拉的制造者。
他們每個人都被忍者世界的規則所束縛，但同時，他們本身又為這種束縛提供了最主要的能源供給！
假如這樣的猜想屬實，那麼包括羽衣羽村兩兄弟在內，大筒木一族各種人性化的特征立刻便遭到了磨滅
因為這些外星人及其他們對這個世界產生的一切變量本質上都是為了吞噬所在星球及所有原住民的「血肉」而服務！
至于究竟是像輝夜姬那樣的高壓統治，還是像六道仙人那樣高唱愛與和平，對被剝削的普通人類而言，其實並不存在什麼本質上的區別不管大筒木一族的個體究竟怎麼想，反正只要把時間線無限拉長，查克拉的泛濫遲早會成為人類為自己刻下的墓志銘。
從這個角度出發，山田院長在幕後主導的這次靈體轉移手術立刻又被賦予了新的意義。
——通過壓縮、傳輸的方式完整提取一個忍者的靈魂，並將其重新有序地灌入新的軀體，總司得以在這個過程中完整地記錄靈魂中每個組件的具體功效。
這種窮舉式的操作足以洞悉靈魂層面每個神秘莫測的細節，進而驗證輝夜姬當年控制世界的手段究竟是否與總司所見相同！
倘若當真如他所料，那麼憑借山田院長如今在相關領域積累的專業技術，是否有可能修改掉其中最關鍵的幾條代碼，將原本隸屬大筒木一族控制的力量化為己用？
又或者，當總司想要推廣魔力體系、打開用戶市場，他又是否可以借鑒當年輝夜姬發家致富的這一整套流程？
搞清楚這些問題，遠比富岳的生死、長生的執念更加重要！
因此，當山田院長懷著十二萬分的謹慎與嚴謹借助昭鏡的身體正式介入調和流程，膠囊艙里發生的一切變故就全數被他記錄在心。
而隨著總司從其中剝離出有關宇智波富岳本人的記憶、能力、人格所對應的波形之後，一種基于查克拉本身的奇特波動很快引起了當事人的注意。
山田院長通過接駁機關暫時關閉了靈體轉移的通道，竭盡全力把握那一絲與整個忍者世界息息相關的微弱脈動！