既然高迎祥已逃，湖廣境內其他流寇僅憑湖廣當地守軍就能剿滅，故而洪承疇再待在湖廣已經沒有任何意義。于是，崇禎八年五月底，在荊州休整了幾天，洪承疇重新踏上了北上河南的腳步。
大軍行進道南陽，一個令人不安的消息傳來，五月十五，也就是在洪承疇在湖廣圍剿高迎祥之時，流竄在陝西境內的李自成突然從北方南下，攻克了鳳翔。
洪承疇得知消息之後，久久不語，直到身邊軍將詢問之時嗎，才下令大軍加速北上。
走至葉縣，已經是六月十五，更多消息傳來，李自成攻克陝西之後，並沒有浪費時間，而是繼續東向，連續攻克了武功，扶風、武功、眉縣、咸陽等地，兵峰再次指向西安。
不僅如此，在藍田一帶發現了被打殘的流賊闖王高迎祥的旗幟。同時，在五月之時，曹操羅汝才，與八大王張獻忠，闖塔天劉國能等流寇，在歸德府聚集，共同攻打歸德府府治商丘。
萬幸在流寇攻克商丘以前，山東巡撫朱大典率軍及時趕到，驚走賊眾，並率軍追擊流寇，連續在寧陵，拓城，太康，扶溝等地連續擊潰流寇聯軍，俘虜賊眾三萬有余，擊斃一萬人，賊勢大減。
此時，身處京城的崇禎終于意識到在義軍流動作戰情況下，全面圍剿，勢難成功，于是又改用分區負責，重點進攻的方針，令洪承疇重新擔任三邊總督，專負責剿滅陝西賊眾。
盧象升以圍剿高迎祥之功，接替唐暉出任湖廣總督，駐襄陽。又令山東巡撫朱大典駐鳳陽，負責剿滅河南，江北，山東等地流寇。
接到旨意，朱大典叫苦不迭，自家人知道自家事，他能擊敗流寇，全憑一時運氣，根本就無運籌帷幄之能，如何能統帥三軍？于是，前後三次奏請朝廷辭去三省總督之職，然而崇禎一概不許。朱大典只能硬著頭皮上任。
六月初，張獻忠聯合羅汝才，劉國能等人，欲效仿當初奇襲破鳳陽之舉，故而欲出兵攻打顯陵，也就是嘉靖皇帝的老爹恭睿獻皇帝朱祐杬的墓（皇帝名義是追封），帶兵行至確山。
朱大典聞之，不敢怠慢，連忙帶兵出鳳陽，取道汝寧府，想要進入湖廣。走至信陽中山鋪一帶，四周伏兵四起，朱大典方寸皆亂，無計可施。官兵被張獻忠大敗，倉皇逃竄，張獻忠等人隨後追之，于新蔡龍口一帶追上朱大典。
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朱大典此時叫天天不應，叫地地不靈，在亂軍之中，拔劍自刎。經此一戰，張獻忠等人勢力一躍擴充至十萬。兵分三路，泛南陽，歸德，江北鳳陽一帶。
崇禎八年六月二十三，羅汝才率軍三萬，越過南陽，劫掠唐縣，泌陽一帶，並最終帶兵抵達新野。湖廣總督盧象升越境，出襄陽，在新野迎戰羅汝才。
是役，天地昏暗，狂風大作，羅汝才的大旗被狂風吹翻，軍心不穩。盧象升抓住這個機會，率軍猛攻羅汝才的中軍。羅汝才不敵，大敗奔逃，大軍隨之崩潰。
盧象升帶人狂追五十里，打得羅汝才魂飛膽喪，草木皆兵，最終只帶了三十六騎勉強逃出盧象升的手掌。
消息傳到京師，已經被弄得焦頭爛額的崇禎當即眼前一亮，下令設立「五省總理」的差使，由盧象升兼任，統轄南直隸、河南、山東、四川、湖廣五省軍務。
盧象升接到任命後，向朝廷呈上「平寇十要」即︰一辦餉；二籌兵；三用人；四任將；五設險；六定功罪；七明分合；八專責成；九以民攻賊；十以賊攻賊，又奏「三大機宜」即︰剿蕩大局、兵餉全籌、督理專力，崇禎捏著鼻子全部采納。
于是，盧象升帶著手中大軍，急速奔向南直隸，並與崇禎八年七月二十二，在廬州府擊潰了正要侵犯廬州的張獻忠部。張獻忠隨即回兵，意圖向北重攻鳳陽。
盧象升一路尾隨，連續在阜陽，開封等地，連續擊敗張獻忠于劉國能的聯軍。張獻忠被破南下由商洛道進入陝西。
而于此同時，三邊總督的洪承疇也已經趕到了潼關。然而此時，以往無往不利的洪承疇卻並沒有直接進入陝西，反而在潼關駐扎了下來。另一方面，李自成也在拿下咸陽之後，收攏了兵峰，遲遲沒有向西安展開進攻。
此時的兩人，就宛如一個正要決戰的劍客，彼此擺出姿勢，只等待對方出招。
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